| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 1,215,634 | +C | pseudogene (402/405 nt) | tfaP → | tail fiber assembly protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 1,215,634 | 1 | . | C | 98.9% | 2505.3 / 15.4 | 747 | pseudogene (402/405 nt) | tfaP | tail fiber assembly protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (3/5); new base C (441/297); total (445/302) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.80e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.83e-01 | |||||||||||
Only 100 of 784 total aligned reads displayed.
GGCAGGGTAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCTTACGCCTCCGGCA‑GTT‑AGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGTTGAATCAGA > NZ_CP025268/1215495‑1215767 | ggTAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑Gttcaggc > 1:627224/1‑135 (MQ=255) ggTAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑Gttcaggc > 2:11053163/1‑135 (MQ=255) ggTAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑Gttcaggc < 1:7764967/140‑6 (MQ=255) gTAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGcc < 2:2656848/140‑1 (MQ=255) tAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCa > 2:9885713/1‑140 (MQ=255) aGGCTGCGTTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGGTGATACATCCAGTGCGCCAGATATGGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGa > 1:1788649/1‑140 (MQ=21) aGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGa > 1:8694863/1‑140 (MQ=255) aGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGa > 2:8986209/1‑140 (MQ=255) cATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGACCTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATAGTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGTTGAcgt > 1:7224760/1‑138 (MQ=18) cATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACAt > 2:1941830/1‑140 (MQ=255) cATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCAAGTGAGCCAGATATTGTATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACAt > 2:10940137/1‑140 (MQ=18) aTTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATCTTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATc > 2:8692273/1‑140 (MQ=255) aTTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATc < 2:3629187/140‑1 (MQ=255) gAAGACTTACAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGgcg < 1:198130/140‑1 (MQ=255) gAAGACTTAAAGAAGATGCGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGGTC‑AGGCCAGATGACATCCGgcg < 2:8084154/140‑1 (MQ=18) gAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAANAATATAANTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTNAGGCCAGATGACATCCGgcg < 1:5921412/140‑1 (MQ=255) gAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACCTCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGgcg < 2:3121560/140‑1 (MQ=255) gAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGgcg < 1:3673187/140‑1 (MQ=255) gAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGgcg < 2:589246/140‑1 (MQ=255) gAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGgcg < 2:7531242/140‑1 (MQ=255) gAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGgcg > 1:133421/1‑140 (MQ=255) gAAGACTTAAAGAACATGAGCAGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTCTCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATAAATCCAGTGCGCCTGATATTGAATGGCCTACGCATCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGgcg < 2:8482586/140‑1 (MQ=17) gAAGACTGAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGgcg < 2:7297373/140‑1 (MQ=255) aaGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGgcgc < 1:6464734/140‑1 (MQ=255) aGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGcgcg < 2:10521718/140‑1 (MQ=255) aGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGcgcg < 2:9684975/140‑1 (MQ=255) aCTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGt > 2:7881544/1‑140 (MQ=255) aCTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGt > 1:5509440/1‑140 (MQ=255) aCTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGt > 1:10884924/1‑140 (MQ=255) aCTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGt > 1:6703593/1‑140 (MQ=255) aCTTAAAGAAGATGAGCTGAAAAAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGt > 1:9034430/1‑140 (MQ=255) aagaagATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTgg > 1:2761752/1‑140 (MQ=255) aagaTGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTAt < 2:10746292/140‑1 (MQ=255) aagaTGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTAt < 1:9686103/140‑1 (MQ=255) gaTGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCt > 2:10096246/1‑140 (MQ=255) gaTGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCt > 1:5693593/1‑140 (MQ=255) gaTGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCt > 2:3904278/1‑140 (MQ=255) aTGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTg > 2:5690841/1‑140 (MQ=255) aCAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCAc < 2:6172771/140‑1 (MQ=255) aCAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCAc < 2:1536647/140‑1 (MQ=255) tctaATTTGTGGCTGGCTTATCTGGAAGCACTGGCACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATGGACTGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACcgcg < 2:6403661/138‑1 (MQ=11) ataATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGt < 2:9207825/140‑1 (MQ=255) ataATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGt < 1:4449174/140‑1 (MQ=255) ataATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGt < 1:8564584/140‑1 (MQ=255) tttGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAAt > 1:4659422/1‑140 (MQ=255) ttGTGTCTGGATTATATGGAAGCACTGGAAATGGTTGATACATCCAGTGCTCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCAGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGGGCTGGTATCTGTTGCCTTCACCGCGTCAATg < 2:5247641/140‑1 (MQ=11) ttGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATg < 1:3114306/140‑1 (MQ=255) ttGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATg < 2:10307894/140‑1 (MQ=255) ttGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATg < 1:7428911/140‑1 (MQ=255) gCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATc < 2:6762174/140‑1 (MQ=255) cTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATcc > 1:5353972/1‑140 (MQ=255) ggATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAg > 1:6118098/1‑140 (MQ=255) gATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGc > 2:8823189/1‑140 (MQ=255) gATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGc > 1:10320407/1‑140 (MQ=255) gATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGc > 2:2758345/1‑140 (MQ=255) gATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGc < 2:11304914/140‑1 (MQ=255) aTTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGca < 2:5477770/140‑1 (MQ=255) aTTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGca < 1:1543789/140‑1 (MQ=255) aTTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGca < 2:6940480/140‑1 (MQ=255) ttctCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGcac < 2:7058737/137‑1 (MQ=255) aTCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAg > 2:4165279/1‑140 (MQ=255) aTCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCGCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCACTGTAATCCAGCACAg > 2:4669913/1‑140 (MQ=11) ggAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGtt < 1:9355163/140‑1 (MQ=255) gCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGt < 1:10990098/140‑1 (MQ=255) cTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCATCACAGCGTTAAGTCTg > 1:4963044/1‑140 (MQ=255) cTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTg > 2:4441910/1‑140 (MQ=255) tGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTgg > 1:2231201/1‑140 (MQ=255) tGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTgg < 2:8321943/140‑1 (MQ=255) tGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTgg < 2:1331345/140‑1 (MQ=255) cTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGggtgtt > 2:7661544/1‑140 (MQ=255) ggTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTc > 1:8765138/1‑140 (MQ=255) gTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTct > 1:3251929/1‑140 (MQ=255) gTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTct > 1:6939027/1‑140 (MQ=255) gTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTct > 1:7593865/1‑140 (MQ=255) gTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTct > 2:7811342/1‑140 (MQ=255) gTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGGTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGGTAAGTCTGGTTGTTTct > 2:4939549/1‑140 (MQ=14) tGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTctgc > 2:9501981/1‑140 (MQ=255) gATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTctgcc < 1:11331292/140‑1 (MQ=255) aTACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTctgcct > 2:2384714/1‑140 (MQ=255) aTCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGt < 1:5228655/140‑1 (MQ=255) tCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTc < 1:10161093/140‑1 (MQ=255) ccAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCa > 1:358516/1‑140 (MQ=255) ccAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCa > 1:3784935/1‑140 (MQ=255) ccAGTGCGCCAGATAGTGAATGTCCTACGAAGCCGGCT‑GTTCAGGCCAGAGGACATCCGGCGCGGTGATGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCTCAGCGTTAAGTCTGGTTGTTGCTGCCTGCGTct > 2:2969658/1‑139 (MQ=14) tGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTCTCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGttt > 1:7961835/1‑140 (MQ=255) tGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGttt > 1:258626/1‑140 (MQ=255) tGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGttt > 2:2536180/1‑140 (MQ=255) cAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTc > 1:4206891/1‑140 (MQ=255) gATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCg > 1:6383310/1‑140 (MQ=255) atTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCg > 1:8267671/1‑137 (MQ=255) atTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGcc > 1:3973633/1‑140 (MQ=255) tACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAg < 1:9616444/140‑1 (MQ=255) cGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGtt > 1:10574954/1‑140 (MQ=255) tCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGTTGAAt < 1:9916737/140‑1 (MQ=255) tCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGTTGAAt < 1:10003821/140‑1 (MQ=255) ccGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGTTGAATc > 2:335139/1‑140 (MQ=255) cGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGTTGAATCa > 1:11182699/1‑140 (MQ=255) cGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGTTGAATCa > 1:9238455/1‑140 (MQ=255) cGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGTTGAATCa > 1:9170495/1‑140 (MQ=255) cGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGTTGAATCa > 2:2227855/1‑140 (MQ=255) | GGCAGGGTAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCTTACGCCTCCGGCA‑GTT‑AGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGTTGAATCAGA > NZ_CP025268/1215495‑1215767 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |