Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 320,615 | (G)6→7 | intergenic (+482/‑44) | rclR → / → ykgE | reactive chlorine‑specific transcriptional regulator RclR/heterodisulfide reductase‑related iron‑sulfur binding cluster |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 320,609 | 1 | . | G | 94.4% | 1532.6 / 81.0 | 467 | intergenic (+476/‑50) | rclR/ykgE | reactive chlorine‑specific transcriptional regulator RclR/heterodisulfide reductase‑related iron‑sulfur binding cluster |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (15/11); new base G (180/261); total (195/272) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.03e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 490 total aligned reads displayed.
AGCGATGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑T‑G‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGTGCTGCTACTGGAAAAAC > NZ_CP025268/320470‑320743 | aGCGATGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑t < 1:9578542/140‑1 (MQ=255) aGCGATGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑t > 2:6001581/1‑140 (MQ=255) cGATGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGTGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCAAATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑T‑g‑g < 1:8562506/140‑1 (MQ=255) cGATGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑T‑g‑g < 2:11091624/140‑1 (MQ=255) aTGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑T‑g‑gg‑g > 2:1066042/1‑140 (MQ=255) gCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑T‑g‑gg‑gg‑g > 1:6936782/1‑140 (MQ=255) agaaaTAAAATTAGTTAGTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACa < 2:3060275/140‑1 (MQ=255) gaaaTAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACAt < 1:6709033/140‑1 (MQ=255) acaTAAATTTAGTGAGTTCTTTTGACGTTTGGATGAAAGCTTCTGATTTGGCTTACAAATGAGGGGTGGTTTGTTGCTTGCCAATTAAAATAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CA‑GGAG‑G‑GG‑GG‑GAAACATc < 2:5441549/138‑1 (MQ=255) aaaTAAAATTATTTATTGCAATTTACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGATATCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATTATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATc < 2:4505060/140‑1 (MQ=255) aaaTAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATc < 2:927926/140‑1 (MQ=255) aaaaTTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑T‑G‑GGTGG‑GAATCATCGGGc < 2:4908473/140‑1 (MQ=255) aGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAAt > 1:8759144/1‑140 (MQ=255) aTTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGc < 1:8263173/140‑1 (MQ=255) ttGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCa < 2:2277197/140‑1 (MQ=255) ttGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCa < 1:5863443/140‑1 (MQ=255) tGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCAt > 2:6202844/1‑140 (MQ=255) gCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATg < 2:483708/140‑1 (MQ=255) ttGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAAATAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGt > 1:8447951/1‑140 (MQ=255) tGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTa > 2:9015629/1‑140 (MQ=255) gACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTaa < 2:1834836/140‑1 (MQ=255) gACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTaa < 1:9734316/140‑1 (MQ=255) gACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTaa < 1:1340360/140‑1 (MQ=255) gACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTaa < 2:428503/140‑1 (MQ=255) aCGTTTGGATGAAAGAGTATCATGTGTCATACACATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATAGGGATGGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GACACCTCGGGCATACAGGGGCATGAAGtcct < 2:1599099/140‑4 (MQ=255) aCGTCTGGATGACAGATTATCCATTGTCCTACCAATGAGGGGAGGTAGGGAGCTCGCCAATTAACCAACAACGCCAGCTTTCTTGATGTTTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCAGGAAGTAAt < 2:9939962/140‑1 (MQ=255) gTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATgg < 1:11130432/140‑1 (MQ=255) gTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATgg < 1:6328107/140‑1 (MQ=255) tGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGt < 2:3469846/140‑1 (MQ=255) ggATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTa < 2:9741698/140‑1 (MQ=255) aTGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTAtt < 1:7332214/140‑1 (MQ=255) gAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAg < 1:2718346/140‑1 (MQ=255) ttATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGa < 2:4172890/140‑1 (MQ=255) atATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATTTTTATTGATGATTGCTCCC‑CC‑TG‑T‑GTGG‑GT‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGa < 2:6788315/139‑1 (MQ=255) cATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGt < 2:79891/140‑1 (MQ=255) aTTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTc < 1:1496675/140‑1 (MQ=255) gTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAAtt < 1:1726416/140‑1 (MQ=255) gTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAAtt > 2:2082627/1‑140 (MQ=255) gTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAAtt > 2:3615520/1‑140 (MQ=255) aTACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCt < 1:9041535/140‑1 (MQ=255) aCAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCttt > 1:10036724/1‑140 (MQ=255) aCAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCttt < 2:10808302/140‑1 (MQ=255) aCAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCttt > 2:7535707/1‑140 (MQ=255) aCAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCttt < 1:245167/140‑1 (MQ=255) cAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTg < 1:863849/140‑1 (MQ=255) aaaTGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGt < 2:9575871/140‑1 (MQ=255) aaaTGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGt < 1:2128238/140‑1 (MQ=255) aaTGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTc < 1:4063818/140‑1 (MQ=255) tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATCAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 2:7637720/140‑1 (MQ=255) tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGTAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 1:5626950/140‑1 (MQ=255) tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGGAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 1:4196900/140‑1 (MQ=255) tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 1:8871665/140‑1 (MQ=255) tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 2:5276725/140‑1 (MQ=255) tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 1:4498556/140‑1 (MQ=255) tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 1:4941035/140‑1 (MQ=255) tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 2:8644076/140‑1 (MQ=255) tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 2:8044650/140‑1 (MQ=255) tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 1:943143/140‑1 (MQ=255) tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 1:7810795/140‑1 (MQ=255) tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTAATGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 2:8228128/140‑1 (MQ=255) gAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAcc < 2:6665804/140‑1 (MQ=255) gAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAcc > 1:1039982/1‑140 (MQ=255) gAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAcc > 1:2968646/1‑140 (MQ=255) gAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTGATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAcc < 2:9400672/140‑1 (MQ=255) aGGGGTGGTATGTTGCGAGCCAATGAAAAAAGAACGCCATCTTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GGAG‑G‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGCAGTAAGAGTTGTGAATGTCAAGTTCTTGGTCACCt < 2:6379557/140‑1 (MQ=255) ggggTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTg > 2:4623452/1‑140 (MQ=255) gtggtATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTAt < 1:9329723/140‑1 (MQ=255) tggtATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTAtt > 1:4716472/1‑140 (MQ=255) gtATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGTTTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTgg > 2:2454545/1‑140 (MQ=255) gtATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GGAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTgg > 1:6087804/1‑140 (MQ=255) gtATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAAt < 1:3937577/82‑1 (MQ=255) gtATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTgg > 1:3626646/1‑140 (MQ=255) gtATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTgg > 2:1930560/1‑140 (MQ=255) tGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGa < 1:3415740/140‑1 (MQ=255) ttGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACg > 2:7846097/1‑140 (MQ=255) gCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGcc < 2:6589525/140‑1 (MQ=255) gCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGcc < 2:6936782/140‑1 (MQ=255) cTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACTccc > 2:8451221/1‑140 (MQ=255) aGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTg < 2:3783281/140‑1 (MQ=255) aGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTg < 2:2645428/140‑1 (MQ=255) gCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGa > 2:5146946/1‑140 (MQ=255) gCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGa > 1:1625967/1‑140 (MQ=255) gCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGa > 1:10725174/1‑140 (MQ=255) gCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTAGTGGTGACGCCCTGa > 2:2974009/1‑140 (MQ=255) gCCAATTAAAAAAGAACGCCATAGATATTGTTGATAGATCCC‑AC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GACACATCGGGCCTAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGATGTGAATGTCACTTTCTATGTCACCGGTATTGGTGACGCCCTGa > 2:7290279/1‑140 (MQ=255) gCCAAGTAAAAAAGAACGCCATAGTTATTGATGATTGATCCCGCG‑GG‑G‑G‑GG‑GG‑GAAGCATCGGGCATAAATGGGCATGTCGTTCTGGCGGATTAGGGGTGACTGTCAAGTTCGTTGTCACCGGGATTGGTGACGcccggc > 2:10393347/1‑137 (MQ=255) ccAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGaa < 1:1854534/140‑1 (MQ=255) aTTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CCGGG‑G‑G‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATc > 1:6445106/1‑140 (MQ=255) ttAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCa > 2:5751690/1‑140 (MQ=255) aaaaaaGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAg < 2:1309217/140‑1 (MQ=255) aaaaGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGaa < 1:7530260/140‑1 (MQ=255) aaGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATg < 1:5273412/140‑1 (MQ=255) aaCGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCa < 1:9239243/140‑1 (MQ=255) cGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACg > 1:11231626/1‑140 (MQ=255) cGCCATATATATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑T‑G‑GG‑GGTGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACg < 2:8331671/140‑1 (MQ=255) cATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACgaga < 1:5409450/140‑1 (MQ=255) tatttattGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACt < 1:10128633/140‑1 (MQ=255) attGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGtg > 1:3057538/1‑140 (MQ=255) attgatCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGTGCTGCTAc > 1:1235246/1‑140 (MQ=255) atCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCCTGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGTGCTGCTACTGGa > 1:4385541/1‑140 (MQ=255) | AGCGATGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑T‑G‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGTGCTGCTACTGGAAAAAC > NZ_CP025268/320470‑320743 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |