| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 4,426,468 | +C | pseudogene (249/275 nt) | yjfY ← | DUF1471 family protein YjfY |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 4,426,468 | 1 | . | C | 99.5% | 2160.5 / NA | 626 | pseudogene (249/275 nt) | yjfY | DUF1471 family protein YjfY |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/0); major base C (292/329); minor base A (0/3); total (294/332) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.52e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 643 total aligned reads displayed.
TTCCTTCCTCGGGAGATAACTGGTCTAATTCCGCAGCCGTTTTTCAAAAAAAAGCCCCCTGCGAAGGGGGCAAAGCAAACTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGTTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTG‑A‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTATGATTGATATAAATCACGC > NZ_CP025268/4426331‑4426601 | tccttcctCGGGAGATAACTGGTCTAATTCCGCAGCCGTTTTTCAAAAAAAAGCCCCCTGCGAAGGGGGCAAAGCAAACTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTgcat < 1:9916786/140‑4 (MQ=255) acGGGAGATAACTGGTCTAATTCCGCAGCCGTTTTTCAAAAAAAAGCCCCCTGCGAAGGGGGCAAAGCAACCTATCGCAATGTTTCGTTGGATATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCg < 2:11190428/139‑1 (MQ=255) aTAACTGGTCTAATTCCGCAGCCGTTTTTCAAAAAAAAGCCCCCTGCGAAGGGGGCAAAGCAAACTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTcc > 2:10471329/1‑140 (MQ=255) aCTGGTCTAATTCCGCAGCCGTGTTTCATAAAATAGCGCCCTGCGAAGGGGGCATAGCAAACTATGGCAATGTGTCGTTGTTTATCCCTGGTGCTAGCGATCAATATCCGCGCGGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCg > 2:7509927/1‑140 (MQ=255) tGGTCTAATTCCGCAGCCGTTTTTCAAAAAAAAGCCCCCTGCGAAGGGGGCAAAGCAAACTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGt < 1:1555966/140‑1 (MQ=255) gTCTAATTCCGCAGCCGTTTTTCAAAAAAAAGCCCCCTGCGAAGGGGGCAAAGCAAACTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTc > 1:3106361/1‑140 (MQ=255) gTCTAATTCCGCAGCCGTTTTTCAAAAAAAAGCCCCCTGCGAAGGGGGCAAAGCAAACTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTc > 1:7225072/1‑140 (MQ=255) aaTTCCGCAGCCGTTTTTCAAAAAAAAGCCCCCTGCGAAGGGGGCAAAGCAAACTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGc < 1:6863609/140‑1 (MQ=255) ccGCAGCCGTTTTTCAAAAAAAAGCCCCCTGCGAAGGGGGCAAAGCAAACTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCa < 2:3231100/140‑1 (MQ=255) cGCAGCCGTTTTTCAAAAAAAAGCCCCCTGCGAAGGGGGCAAAGCAAACTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAg < 1:8370139/140‑1 (MQ=255) cGCAGCCGTTTGTCACAAAAAAGCCCCCGGCGAAGGGGGCAAAGCAAACTCGGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCGAGCGATAAAGATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGGTACTCCCCGGTTCCCGCATCAg < 2:3604535/140‑1 (MQ=255) cAGCCGTTTTTCAAAAAAAAGCCCCCTGCGAAGGGGGCAAAGCAAACTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGaa > 2:8644649/1‑140 (MQ=255) cAGCCGTTTTTCAAAAAAAAGCCCCCTGCGAAGGGGGCAAAGCAAACTATGGCAATGTTTCGTGGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAAGATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGaa < 1:413684/140‑1 (MQ=255) cAGCCGTTTTTCAAAAAAAAGCCCCCTGCGAAGGGGGCAAAGCAAACTAGGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TAGTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGaa < 2:9294673/140‑1 (MQ=255) ccGTTTTTCAAAAAAAAGCCCCCTGCGAAGGGGGCAAAGCAAACTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTa < 2:535737/140‑1 (MQ=255) acGTTTTTCAAATAAAAGCCCCATGCGATGGGGGAAAAGCACACTATTTCAATGTTTCGTTGGTTATTACTGGTGCTAGCGATAAATTTCCGCGCTGGAGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCGCGCATCTGTATTa < 2:6061400/139‑1 (MQ=255) gttatacAAAAAAAAGCCCCCTGCGAAGGGGGCAAAGCAAACTCTGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACg < 1:10254450/134‑1 (MQ=255) gTTTTTCAAAAAAAAGCCCCCTGCGAAGGGGGCAAAGCAAACTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACg < 1:3475351/140‑1 (MQ=255) gTTTTTCAAAAAAAAGCCCCCTGCGAAGGGGGCAAAGCAAACTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACg < 1:3696824/140‑1 (MQ=255) gTTTTTCAAAAAAAAGCCCCCTGCGAAGGGGGCAAAGCAAACTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACg < 1:2414815/140‑1 (MQ=255) gTTTTTCAAAAAAAAGCCCCCTGCGAAGGGGGCAAAGCAAACTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACg < 1:4344994/140‑1 (MQ=255) gTTTTTCAAAAAAAAGCCCCCTGCGAAGGGGGCAAAGCAAACTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACg < 1:1741569/140‑1 (MQ=255) gTTTTTCAAAAAAAAGCCCCCTGCGAAGGGGGCAAAGCAAACTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACg < 1:5674867/140‑1 (MQ=255) tCAACAAAAAGCCCCCTTCGAAGGGTGCAAAGCAAACTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGgta < 2:1186748/140‑1 (MQ=255) tCAAAAAAAAGCCCCCTGCGAAGGGGGCAAAGCAAACTCTGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGgta < 1:3257302/140‑1 (MQ=255) aaaaaaaaGCCCCCTGCGAAGGGGGCAAAGCAAACTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGgtagt < 2:7825948/140‑1 (MQ=255) aaaaaaaaGCCCCCTGCGAAGGGGGCAAAGCAAACTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGgtagt < 2:5183897/140‑1 (MQ=255) ccccTGCGAAGGGGGCAAAGCAAACTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGcc < 2:4769044/140‑1 (MQ=255) ccccTGCGAAGGGGGCAAAGCAAACTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGcc < 1:1111217/140‑1 (MQ=255) tGCGAAGGGGGCAAAGCAAACTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTgc > 1:10887854/1‑140 (MQ=255) gAAGTGGGCTAAGCAAACTATGGGTATGTTTCTTTGGTTATTCCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCa < 2:2599586/140‑1 (MQ=255) ggCAAAGCAAACTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTCCGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGtt > 1:8944087/1‑140 (MQ=255) ggCAAAGCAAACTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTgcgc < 1:4045985/133‑1 (MQ=255) ggCAAAGCAAACTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTgcgc > 2:4045985/1‑133 (MQ=255) ggCAAAGCAAACTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGtt > 1:6085767/1‑140 (MQ=255) ggCAAAGCAAACTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGtt > 1:2786824/1‑140 (MQ=255) ggCAAAGCAAACTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGtt > 2:2753399/1‑140 (MQ=255) gcaaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGttt > 2:2168159/1‑140 (MQ=255) aaagcaaaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTttct < 2:8831569/140‑1 (MQ=255) caCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTAGACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TAGTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCaaat < 2:5439200/139‑4 (MQ=255) aaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCAttt > 1:7432354/1‑140 (MQ=255) aaCTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCAttt < 1:2099151/140‑1 (MQ=255) cTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTaa > 1:11235273/1‑140 (MQ=255) tGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGc < 2:4328729/140‑1 (MQ=255) aTGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGAc < 2:3747977/140‑1 (MQ=255) tGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACg > 1:483492/1‑140 (MQ=255) tGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTACTTCATTAAATGCCTGACg > 2:6248290/1‑140 (MQ=255) tttCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTg > 1:7835089/1‑140 (MQ=255) tttCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTg > 2:8164721/1‑140 (MQ=255) tttCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTg > 2:6125037/1‑140 (MQ=255) tCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCt < 1:2257364/140‑1 (MQ=255) tCGTTGGTTATACCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCt < 2:7215432/140‑1 (MQ=255) ttctaCCTGGTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGGTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCttt < 2:9823366/137‑1 (MQ=255) tataCCTGGTGATAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCAGGTTCCCGAATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGACTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTc > 2:2012457/1‑140 (MQ=255) taCCTGGTGCTAGCGATAAATAACCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAg < 1:5521096/140‑1 (MQ=255) ggTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCAGCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCg > 2:1485756/1‑140 (MQ=255) ggTGCTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑GATTGCCGGTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCg < 2:3008907/140‑1 (MQ=255) gtgcTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGa > 1:10052778/1‑140 (MQ=255) gtgcTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGa > 1:1965673/1‑140 (MQ=255) gtgcTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGa > 1:262712/1‑140 (MQ=255) gtgcTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGa > 2:660413/1‑140 (MQ=255) gtgcTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGa > 1:669528/1‑140 (MQ=255) gtgcTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATGTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGa > 2:106039/1‑140 (MQ=255) gtgcTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGGGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTGTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGa > 2:3861136/1‑140 (MQ=255) tgctAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCgca > 2:4505727/4‑138 (MQ=255) tgctAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGaa > 2:2462179/4‑140 (MQ=255) tgctAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGaa > 2:5000913/4‑140 (MQ=255) tAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAAtt < 2:5757654/140‑1 (MQ=255) tAGCGATAAAGATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAAtt < 2:10966349/140‑1 (MQ=255) aGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCTGTTCCCGCATAAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTa > 2:6400533/1‑140 (MQ=255) aGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTa > 2:9664179/1‑140 (MQ=255) aGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTa > 1:4557162/1‑140 (MQ=255) aGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTa > 1:10706404/1‑140 (MQ=255) ctAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTAtgat < 1:9364843/139‑1 (MQ=255) aTAAATCTCCGCGCGGGCGGGCA‑CATTGCCGTTACGCCCCGGTCCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTAtgat < 2:10043707/140‑1 (MQ=255) aTAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTAtgat < 2:1625341/140‑1 (MQ=255) aTAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTAtgat < 1:10444709/140‑1 (MQ=255) aTAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTAtgat < 1:1241680/140‑1 (MQ=255) aTAAATATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTAtgat < 1:623822/140‑1 (MQ=255) aaaTATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTAtgattg > 1:7028787/1‑140 (MQ=255) aaaTATCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTAtgattg > 2:8468536/1‑140 (MQ=255) tatCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTATGATTGata < 1:8018910/140‑1 (MQ=255) tatCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTATGATTGata < 2:6759035/140‑1 (MQ=255) tatCCGCGCTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTATGATTGata < 1:5076609/140‑1 (MQ=255) ccGCGCTGGCGTG‑NGTATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGGTTCGCTTNCAGTGGCGAAATTATGATTGATATaa > 1:5925143/1‑140 (MQ=255) gcgcTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTATGATTGATATAAAt < 1:1429700/140‑1 (MQ=255) gcgcTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTATGATTGATATAAAt < 2:8964730/140‑1 (MQ=255) gcgcTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTATGATTGATATAAAt < 2:10248609/140‑1 (MQ=255) gcgcTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTATGATTGATATAAAt < 1:9597853/140‑1 (MQ=255) gcgcTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTATGATTGATATAAAt < 1:9128798/140‑1 (MQ=255) gcgcTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTATGATTGATATAAAt < 1:867165/140‑1 (MQ=255) gcgcTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTATGATTGATATAAAt < 1:6994727/140‑1 (MQ=255) cgcTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTATGATTGATATAAATc > 2:3476146/1‑140 (MQ=255) cgcTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTATGATTGATATAAATc < 2:9417083/140‑1 (MQ=255) cgcTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTATGATTGATATAAATc > 1:7503118/1‑140 (MQ=255) cgcTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTGTCAGTGGCGAAATTATGATTGATATAAATc > 2:1871538/1‑140 (MQ=255) cgcTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTGTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTATGATTGATATAAATc > 1:5448451/1‑140 (MQ=255) gcTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTATGATTGATATAAATCa < 2:8263382/140‑1 (MQ=255) cTGGCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTATGATTGATATAAATCAc > 2:9101170/1‑140 (MQ=255) ggCGTGCA‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTATGATTGATATAAATCACGc > 1:6436301/1‑140 (MQ=255) | TTCCTTCCTCGGGAGATAACTGGTCTAATTCCGCAGCCGTTTTTCAAAAAAAAGCCCCCTGCGAAGGGGGCAAAGCAAACTATGGCAATGTTTCGTTGGTTATACCTGGTGTTAGCGATAAATATCCGCGCTGGCGTG‑A‑TATTGCCGTTACTCCCCGGTTCCCGCATCAGAATTACGTGGTAGTACGTTGCGCCTTGCGCATCTGTTTCTTCATTTAATGCCTGACGTGCTTCGCTTTCAGTGGCGAAATTATGATTGATATAAATCACGC > NZ_CP025268/4426331‑4426601 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |