| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NZ_CP025268 | 4,542,898 | (A)6→7 | pseudogene (27/602 nt) | fimB → | type 1 fimbria switch DNA invertase FimB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_CP025268 | 4,542,892 | 1 | . | A | 97.8% | 1554.1 / 19.7 | 412 | pseudogene (21/602 nt) | fimB | type 1 fimbria switch DNA invertase FimB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (7/2); new base A (286/117); total (293/119) | |||||||||||
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Only 100 of 456 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |