| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP025268 | = 787880 | 1 (0.000) | 712 (1.080) | 134/274 | 0.3 | 99.9% | coding (16/1050 nt) | galM | galactose‑1‑epimerase |
| ? | NZ_CP025268 | = 3744553 | 0 (0.000) | coding (1148/1149 nt) | galK | galactokinase | |||||
Only 100 of 743 total aligned reads displayed.
ACGCTGCCATCGGAAAGCGGAATACGGGCGGAAAGTAAAGTCGCACCCCAGTCCATCAGCGTGACTACCATCCCTGCGTTGTTACGCAAAGTTAACAGTCGGTACGGCTGACCATCGGGTGCCAGTGCGGGAGTTTCGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NZ_CP025268/787741‑787880‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tCAGCACTGTCCTGCTCCTTGTGATGGTTTACAAACGTAAAAAGTCTCTTTAATACCTGTTTTTGCTTCATATTGTTCAGCGACAGCTTGCTGTACGGCAGGCACCAGCTCTTCCGGGATCAGCGCGACGATACAGCCGC < NZ_CP025268/3744553‑3744415 ACGCTGCCATCGGAAAGCGGAATACGGGCGGAAAGTAAAGTCGCACCCCAGTCCATCAGCGTGACTACCATCCCTGCGTTGTTACGCAAAGTTAACAGTCGGTACGGCTGACCATCGGGTGCCAGTGCGGGCGTTTCGTT > 1:469497/1‑140ACGCTGCCATCGGAAAGCGGAATACGGGCGGAAAGTAAAGTCGCACCCCAGTCCATCAGCGTGACTACCATCCCTGCGTTGTTACGCAAAGTTAACAGTCGGTACGGCTGACCATCGGGTGCCAGTGCGGGAGTTTCGTT < 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GCCATCGGAAAGCGGAATACGGGCGGAAAGTAAAGTCGCACCCCAGTCCATCAGCGTGACTACCATCCCTGCGTTGTTACGCAAAGTTAACAGTCGGTACGGCTGACCATCGGGTGCCAGTGCGGGAGTTTCGTTCAGCA < 1:8385823/140‑1 GCCATCGGAAAGCGGAATACGGGCGGAAAGTAAAGTCGCACCCCAGTCCATCAGCGTGACTACCATCCCTGCGTTGTTACGCAAAGTTAACAGTCGGTACGGCTGACCATCGGGTGCCAGTGCGGGAGTTTCGTTCAGCA < 2:6580749/140‑1 GCCATCGGAAAGCGGAATACGGGCGGAAAGTAAAGTCGCACCCCAGTCCATCAGCGTGACTACCATCCCTGCGTTGTTACGCAAAGTTAACAGTCGGTACGGCTGACCATCGGGTGCCAGTGCGGGAGTTTCGTTCAGCA < 2:7595138/140‑1 GCCATCGGAAAGCGGAATACGGGCGGAAAGTAAAGTCGCACCCCAGTCCATCAGCGTGACTACCATCCCTGCGTTGTTACGCAAAGTTAACAGTCGGTACGGCTGACCATCGGGTGCCAGTGCGGGAGTTTCGTTCAGCA < 2:9083501/140‑1 GCCATCGGAAAGCGGAATACGGGCGGAAAGTAAAGTCGCACCCCAGTCCATCAGCGTGACTACCATCCCTGCGTTGTTACGCAAAGTTAACAGTCGGTACGGCTGACCATCGGGTGCCAGTGCGGGAGTTTCGTTCAGCA < 1:1446744/140‑1 GCCATCGGAAAGCGGAATACGGGCGGAAAGTAAAGTCGCACCCCAGTCCATCAGCGTGACTACCATCCCTGCGTTGTTACGCAAAGTTAACAGTCGGTACGGCTGACCATCGGGTGCCAGTGCGGGAGTTTCGTTCAGCA < 1:1258334/140‑1 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GTACGGCTGACCATCGGGTGCCAGTGCGGGAGTTTCGTTCAGCACTGTCCTGCTCCTTGTGATGGTTTACAAACGTAAAAAGTCTCTTTAATACCTGTTTTTGCTTCATATTGTTCAGCGACAGCTTGCTGTACGGCAGG > 1:7537360/1‑140 GTACGGCTGACCATCGGGTGCCAGTGCGGGAGTTTCGTTCAGCACTGTCCTGCTCCTTGTGATGGTTTACAAACGTAAAAAGTCTCTTTAATACCTGTTTTTGCTTCATATTGTTCAGCGACAGCTTGCTGTACGGCAGG > 2:10053825/1‑140 GTACGGCTGACCATCGGGTGCCAGTGCGGGAGTTTCGTTCAGCACTGTCCTGCTCCTTGTGATGGTTTACAAACGTAAAAAGTCTCTTTAATACCTGTTTTTGCTTCATATTGTTCAGCGACAGCTTGCTGTACGGCAGG > 1:3786001/1‑140 GACCATCGGGTGCCAGTGCGGGAGTTTCGTTCAGCACTGTCCTGCTCCTTGTGATGGTTTACAAACGTAAAAAGTCTCTTTAATACCTGTTTTTGCTTCATATTGTTCAGCGACAGCTTGCTGTACGGCAGGCACCAGCT < 2:2376623/140‑1 GACCATCGGGTGCCAGTGCGGGAGTTTCGTTCAGCACTGTCCTGCTCCTTGTGATGGTTTACAAACGTAAAAAGTCTCTTTAATACCTGTTTTTGCTTCATATTGTTCAGCGACAGCTTGCTGTACGGCAGACACCAGCT < 1:4134509/140‑1 CATCGGGTGCCAGTGCGGGAGTTTCGTTCAGCACTGTCCTGCTCCTTGTGATGGTTTACAAACGTAAAAAGTCTCTTTAATACCTGTTTTTGCTTCATATTGTTCAGCGACAGCTTGCTGTACGGCAGGCACCAGCTCTT > 2:1246091/1‑140 CGGGTGCCAGTGCGGGAGTTTCGTTCAGCACTGTCCTGCTCCTTGTGATGGTTTACAAACGTAAAAAGTCTCTTTAATACCTGTTTTTGCTTCATATTGTTCAGCGACAGCTTGCTGTACGGCAGGCACCAGCTCTTCCG > 1:8260473/1‑140 GGGTGCCAGTGCGGGAGTTTCGTTCAGCACTGTCCTGCTCCTTGTGATGGTTTACAAACGTAAAAAGTCTCTTTAATACCTGTTTTTGCTTCATATTGTTCAGCGACAGCTTGCTGTACGGCAGGCACCAGCTCGTCCGG > 1:7939941/1‑140 CAGTGCGGGAGTTTCGTTCAGCACTGTCCAGCTCCTTGTGATGGTTTACAAACGTAAAAAGTCTCTTTAATACCTGTTTTTGCTTCATATTGTTCAGCGACAGCTTGCTGTACGGCAGGCACCAGCTCTTCCGGGATCAG < 1:5153974/140‑1 TGCGGGAGTTTCGTTCAGCACTGTCCTGCTCCTTGTGATGGTTTACAAACGTAAAAAGTCTCTTTAATACCTGTTTTTGCTTCATATTGTTCAGCGACAGCTTGCTGTACGGCAGGCACCAGCTCTTCCGGGATCAGCGC > 2:11281195/1‑140 GAGTTTCGTTCAGCACTGTCCTGCTCCTTGTGATGGTTTACAAACGTAAAAAGTCTCTTTAATACCTGTTTTTGCTTCATATTGTTCAGCGACAGCTTGCTGTACGGCAGGCACCAGCTCTTCCGGGATCAGCGCGACGA > 1:10873274/1‑140 TCGTTCAGCACTGTCCTGCTCCTTGTGATGGTTTACAAACGTAAAAAGTCTCTTTAATACCTGTTTTTGCTTCATATTGTTCAGCGACAGCTTGCTGTACGGCAGGCACCAGCTCTTCCGGGATCAGCGCGACGATACAG > 2:8072919/1‑140 TCGTTCAGCACTGTCCTGCTCCTTGTGATGGTTTACAAACGTAAAAAGTCTCTTTAATACCTGTTTTTGCTTCATATTGTTCAGCGACAGCTTGCTGTACGGCAGGCACCAGCTCTTCCGGGATCAGCGCGACGACACAG > 1:2950064/1‑140 TCAGCACTGTCCTGCTCCTTGTGATGGTTTACAAACGTAAAAAGTCTCTTTAATACCTGTTTTTGCTTCATATTGTTCAGCGACAGCTTGCTGTACGGCAGGCACCAGCTCTTCCGGGATCAGCGCGACGATACAGCCGC > 1:4491114/1‑140 ACGCTGCCATCGGAAAGCGGAATACGGGCGGAAAGTAAAGTCGCACCCCAGTCCATCAGCGTGACTACCATCCCTGCGTTGTTACGCAAAGTTAACAGTCGGTACGGCTGACCATCGGGTGCCAGTGCGGGAGTTTCGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NZ_CP025268/787741‑787880‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tCAGCACTGTCCTGCTCCTTGTGATGGTTTACAAACGTAAAAAGTCTCTTTAATACCTGTTTTTGCTTCATATTGTTCAGCGACAGCTTGCTGTACGGCAGGCACCAGCTCTTCCGGGATCAGCGCGACGATACAGCCGC < NZ_CP025268/3744553‑3744415 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |