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TGCACGTTTCATATGTTCTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCGCCGCTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NZ_CP025268/4621521‑4621379‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gccgcttTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGATGGTGTCAGATGCCTGACGGCGTCC < NZ_CP025268/4621387‑4621249 TTCATATGTTCTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGC > 1:4487895/1‑140 TCATATGTTCTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCC > 2:7506319/1‑140 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CAAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCGGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCG < 2:4990072/140‑1 AAGTTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGA < 2:4570830/140‑1 TTTAATTGCCGCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGATGG > 2:11289572/1‑140 GCTTTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCCTATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGATGGTGTCAGATGC > 1:4294744/1‑140 TTCACCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGATGGTGTCAGATGCCTG < 2:4418776/140‑1 CCGCTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGATGGTGTCAGATGCCTGACGG < 1:10399006/140‑1 CTTTCGCCGCTTCCTGCCAGTGGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTACTCGATGGTGTCAGATGCCTGACGGCGT < 1:4619157/140‑1 TTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAGGCCGACGCTGAACTCGATGGTGTCAGCTGCCTGACGGCGTCC > 2:6252596/1‑140 TGCACGTTTCATATGTTCTCCGTACTCAGTGCTTCAAATTTAAATGATCAGATCAGTATACCGTTATTCGCTGATACGGCGATAGACAGTTGGTGTGCTTTCCGGTGCTTTATCGGCAAGTTTAATTGCCGCTTTCGCCGCTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NZ_CP025268/4621521‑4621379‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gccgcttTCGCCGCTTCCTGCCAGTTGTTTTCGTCTTTCGCGTGGATAACCGCCAGCGGACGCTGACCGTCTACCTGGTCGCCCAGACGCGCCATATCAGTAAAGCCGACGCTGTAATCGATGGTGTCAGATGCCTGACGGCGTCC < NZ_CP025268/4621387‑4621249 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |