| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP025268 | = 3743324 | 0 (0.000) | 341 (0.520) | 95/274 | 1.5 | 100% | intergenic (‑100/‑82) | yiaJ/galK | IclR family transcriptional regulator YiaJ/galactokinase |
| ? | NZ_CP025268 | 3744556 = | 0 (0.000) | intergenic (+2/‑99) | galK/yiaK | galactokinase/3‑dehydro‑L‑gulonate 2‑dehydrogenase | |||||
Only 100 of 343 total aligned reads displayed.
CATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑A‑CAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCCTGTTGACAATTAATCATCGGCATAGTATATCGGCATAGTATAATACGACAAGGTGAGGAACTAAACCCAGGAGGCAGATCATGAGTCTGAAAGAAAAAACACAATCTCTGTTTGCCAACGCATTTGGCTACCCTGCC > NZ_CP025268/3743186‑3743462 | tctcGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCag > 2:11316509‑M1/1‑138 (MQ=255) tcGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagat < 1:195588‑M1/140‑5 (MQ=255) ttCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTGTTGAAATTCATCAATCagattgc > 1:483247‑M1/1‑133 (MQ=255) tctcTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgcc < 1:7397677‑M1/140‑9 (MQ=255) tctcTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgcc < 1:10103273‑M1/140‑9 (MQ=255) tctcTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgcc < 2:2790907‑M1/140‑9 (MQ=255) tctcTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgcc < 2:8796419‑M1/140‑9 (MQ=255) tctcTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgcc < 2:787416‑M1/140‑9 (MQ=255) ttCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaa > 1:6598277‑M1/1‑123 (MQ=255) ccATCACTTCTTTCCCCATGTTGTCGCGTCCTGATGGTAGTGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagagtgccttgttaaaaagt < 2:8387486‑M1/140‑21 (MQ=255) tCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgat < 1:8404884‑M1/140‑24 (MQ=255) tCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgat < 2:4202667‑M1/140‑24 (MQ=255) tCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgat < 1:11161537‑M1/140‑24 (MQ=255) tCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgat < 1:9584771‑M1/140‑24 (MQ=255) tCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgat < 1:9676988‑M1/140‑24 (MQ=255) tCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGGCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgat < 1:3821937‑M1/140‑24 (MQ=255) acaCGTCGTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTGATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgat < 2:3799585‑M1/139‑24 (MQ=255) ttcttTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAATTTCATCAATCagattgcctttttaaaaagtgatcgat < 1:7544029‑M1/140‑28 (MQ=255) cttTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatat > 1:1534989‑M1/1‑111 (MQ=255) tttCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgagcgatata > 2:7204365‑M1/1‑110 (MQ=255) ttCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTCTGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatat > 1:8493309‑M1/1‑109 (MQ=255) tCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatt > 1:4297381‑M1/1‑108 (MQ=255) cccATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcg > 1:5278314‑M1/1‑106 (MQ=255) cccATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcg < 2:5278314‑M1/131‑26 (MQ=255) aTTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaa > 1:11285004‑M1/1‑103 (MQ=255) tttGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatc < 1:3221706‑M1/140‑40 (MQ=255) gcgTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagttt < 2:9014635‑M1/140‑46 (MQ=255) tCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgc > 2:6730060‑M1/1‑92 (MQ=255) aGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaat > 2:3563040‑M1/1‑82 (MQ=255) gcgcAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaataaagtttcgcatattgaaatt > 2:7448355‑M1/1‑81 (MQ=255) cgcAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattt > 1:1348623‑M1/1‑80 (MQ=255) cgcAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattt > 2:1414561‑M1/1‑80 (MQ=255) cAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaatttta < 1:1720131‑M1/140‑63 (MQ=255) aGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagc > 2:4063958‑M1/1‑75 (MQ=255) tgtgCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagcca > 2:10515012‑M1/1‑73 (MQ=255) tgtgCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagcca > 1:10953260‑M1/1‑73 (MQ=255) tgCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaa > 2:5559686‑M1/1‑71 (MQ=255) tgCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaa > 2:1321577‑M1/1‑71 (MQ=255) gCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaa > 1:7485137‑M1/1‑70 (MQ=255) gCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaa > 1:9299482‑M1/1‑70 (MQ=255) ccGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaa > 1:5744764‑M1/1‑69 (MQ=255) ttCACGATCTCGACAGATAATTTCTA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgag > 2:7110191‑M1/1‑63 (MQ=255) ttCACGATCTCGACAGATAATTTATACC‑CAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaatgtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgaatattgaaattttaagcccaaaaagcgat > 2:10951621‑M1/1‑63 (MQ=255) ttCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgat > 1:8161046‑M1/1‑63 (MQ=255) ttCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgat > 1:3992671‑M1/1‑63 (MQ=255) ttCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgat > 1:7914647‑M1/1‑63 (MQ=255) ttCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgag > 1:6138209‑M1/1‑63 (MQ=255) cACGATCTCGACAGATCATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatca > 2:3891940‑M1/1‑61 (MQ=255) cACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatca > 1:330308‑M1/1‑61 (MQ=255) cACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatca > 2:11095971‑M1/1‑61 (MQ=255) cACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatca > 1:10491189‑M1/1‑61 (MQ=255) cACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatca > 1:6485742‑M1/1‑61 (MQ=255) cACGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCGTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaatccaaaatagcgaacc > 2:4918332‑M1/1‑61 (MQ=255) aCGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTATTTTTAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaa < 2:9408283‑M1/140‑81 (MQ=255) cGATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaa > 1:6279182‑M1/1‑59 (MQ=255) gATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaa > 1:6945119‑M1/1‑58 (MQ=255) gATCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaa < 1:1898848‑M1/140‑83 (MQ=255) aTCTCGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaa < 1:5897348‑M1/140‑84 (MQ=255) tctcGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaatgcgatcaaaaaa > 2:6825777‑M1/1‑56 (MQ=255) cGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaaca > 2:4275611‑M1/1‑53 (MQ=255) cGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaaca > 2:8029111‑M1/1‑53 (MQ=255) cGACAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagcaaattaagcgatcaaaaaaaca > 1:7153444‑M1/1‑53 (MQ=255) aCAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaacagcgatcaaaaaaacaag < 2:346567‑M1/140‑90 (MQ=255) aCAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaag < 1:3710028‑M1/140‑90 (MQ=255) cAGATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaagg < 1:1034980‑M1/140‑91 (MQ=255) gATAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaa > 1:8944456‑M1/1‑48 (MQ=255) aTAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaag > 2:10332721‑M1/1‑47 (MQ=255) tAATTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagc > 2:1662717‑M1/1‑46 (MQ=255) aaTTTATA‑ACCTATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcc < 2:3315613‑M1/140‑96 (MQ=255) aaTTTATA‑ACCAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaatacaaggaagcc > 1:8824644‑M1/1‑45 (MQ=255) accaaTTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaattttcgcattttgtaattttaagccataaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatga > 1:9548266‑M1/3‑37 (MQ=255) cAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaa > 2:2608184‑M1/1‑35 (MQ=255) aTTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagt > 2:290175‑M1/1‑33 (MQ=255) aTTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagt > 2:2297758‑M1/1‑33 (MQ=255) aTTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagt < 1:5378002‑M1/140‑108 (MQ=255) aTTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagt > 1:4253086‑M1/1‑33 (MQ=255) aTTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagatagccttgttaaaaagtgatcgaaatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaaatttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaatcctgggatgaaagt > 2:4653603‑M1/1‑33 (MQ=255) ttGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaatcgatcaaaaaaacaatgaagacagggatgaaagtg > 2:10714214‑M1/1‑32 (MQ=255) ttGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaacaaaccgggaagcctgggatgaaagtg > 2:8496317‑M1/1‑32 (MQ=255) gATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgac < 1:10662047‑M1/140‑111 (MQ=255) aTGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgacatttgag < 2:4331290‑M1/140‑118 (MQ=255) aTGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgacatttgag < 1:9949968‑M1/140‑118 (MQ=255) aTGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgacatttgag < 1:7962957‑M1/140‑118 (MQ=255) aTGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgacatttgag < 1:3509054‑M1/140‑118 (MQ=255) aTGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgacatttgag < 2:6042181‑M1/140‑118 (MQ=255) aTGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgacatttgag < 2:10850786‑M1/140‑118 (MQ=255) aTGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgacatttgag < 1:475248‑M1/140‑118 (MQ=255) tGTCTTTTGAAATTCATCAATCagattgcattgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgacatttgagc > 1:516537‑M1/1‑22 (MQ=255) cTTTTGAAATTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgacatttgagcagt < 2:5735902‑M1/140‑122 (MQ=255) aaaTTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgacatttgagcagttaaaag < 2:5856748‑M1/140‑128 (MQ=255) aaaTTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgacatttgagcagttaaaag < 1:2872563‑M1/140‑128 (MQ=255) aaaTTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgacatttgagcagttaaaag < 2:5065383‑M1/140‑128 (MQ=255) aaTTAATCAATCatattgcattgtaaaaaagttatcgatatatttgaaatcaagattcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgacatttgagcagttaaaagc < 2:2091572‑M1/140‑129 (MQ=255) aTTCATCAATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgacatttgagcagttaaaagca < 1:269237‑M1/140‑130 (MQ=255) catcaATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgacatttgagcagttaaaagcagcc > 2:9535475‑M1/1‑8 (MQ=255) catcaATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcct < 2:3097303‑M1/104‑97 (MQ=255) catcaATCagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcct > 1:3097303‑M1/1‑8 (MQ=255) tcagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgacatttgagcagttaaaagcagcctttaat < 1:7049624‑M1/140‑139 (MQ=255) tcagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgacatttgagcagttaaaagcagcctttaat < 1:7333031‑M1/140‑139 (MQ=255) tcagattgccttgttaaaaagtgatcgatatatttgaaatcaagtttcgcatattgaaattttaagccaaaaaagcgatcaaaaaaacaaggaagcctgggatgaaagtgacatttgagcagttaaaagcagcctttaat < 1:2394717‑M1/140‑139 (MQ=255) | CATCTCGTTCTCTTTTTTTCCCATCACTTCTTTCCCCATTTTGTCGCGTCCTGATGGTAGCGCAAAGTGTGCCGTAGTTCACGATCTCGACAGATAATTTATA‑A‑CAATTGATTTTTATGTCTTTTGAAATTCATCAATCCTGTTGACAATTAATCATCGGCATAGTATATCGGCATAGTATAATACGACAAGGTGAGGAACTAAACCCAGGAGGCAGATCATGAGTCTGAAAGAAAAAACACAATCTCTGTTTGCCAACGCATTTGGCTACCCTGCC > NZ_CP025268/3743186‑3743462 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |