New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NZ_CP025268 | 1292725 = | 682 (1.020) | 190 (0.340) | 60/234 | 3.2 | 37.0% | intergenic (+182/+2) | narI/CXP41_RS06830 | respiratory nitrate reductase subunit gamma/RtT sRNA |
? | NZ_CP025268 | = 1293258 | 69 (0.120) | intergenic (‑44/+3) | CXP41_RS06840/CXP41_RS06845 | RtT sRNA/tRNA‑Tyr | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
TCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGA > NZ_CP025268/1293119‑1293396 | cGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTg < 1:4343417/140‑1 (MQ=255) cGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTACCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTg > 2:3339931/1‑140 (MQ=255) gCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGa < 1:8235978/140‑1 (MQ=255) gCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGa < 1:3371610/140‑1 (MQ=255) gCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGa < 1:1712903/140‑1 (MQ=255) gCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGa < 2:2970632/140‑1 (MQ=255) gCCCTGCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCCCTCTCGCTGCCGCTCGAGCCGACCCTGAGTCGAAGCTTCTCATCCGTCCCCGCAGGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGa < 2:7897567/140‑1 (MQ=11) ccTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGAtg < 1:6247039/140‑1 (MQ=255) ccTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGAtg < 1:8840187/140‑1 (MQ=255) tCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTCGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGAtggtg < 2:1208852/140‑1 (MQ=255) cGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCTAGCCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGAtggtgg < 1:1150142/140‑1 (MQ=255) cGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTCGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGATTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGAtggtgg < 1:2264208/140‑1 (MQ=255) gggTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGACTTCAGGGTCTTTTGAAAGTGAtggtggt < 2:8091526/140‑1 (MQ=11) gggTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGAtggtggt < 1:5727979/140‑1 (MQ=255) gggTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGAtggtggt < 1:7983619/140‑1 (MQ=255) gggTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGAtggtggt < 1:5856377/140‑1 (MQ=255) gggTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGAtggtggt < 1:346771/140‑1 (MQ=255) ggTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCTAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTTATTGCGGATTCGTTTGTCAGTTCAGGGTCTTTTGAAAGTGAtggtggtg < 1:748150/140‑1 (MQ=11) tCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTggg < 1:1052168/140‑1 (MQ=255) tCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTggg < 2:7017623/140‑1 (MQ=255) tCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGCGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTggg < 1:8448261/140‑1 (MQ=255) tCGTTGCCTGCCGCAACGCACTCTCGCAGACGCTCGCGCCGAACCTTCGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGATTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTggg < 1:11199948/140‑1 (MQ=11) ggtGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGCCGCTCGAGACGAACCTGTGTCTAAGCTTCTCATCCGTACCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg < 2:9672135/138‑1 (MQ=11) ggtGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTATTTCGAAGCTTCTCAACCTTCACCGCCTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTAGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg < 2:6518462/138‑1 (MQ=11) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCGAGGCGAACCTTATTCGAAGCTTATCATCCTTCCCCGCATGGGAAGAATATTTGTTTGCGGATTAGCTTTAGAGTTCAGTGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg < 1:11150464/140‑1 (MQ=11) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCGAGCCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg < 1:3627527/140‑1 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGCCGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGATTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg < 1:9981781/140‑1 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGCCGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCGTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg < 1:4933316/140‑1 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGCGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg < 2:9450727/140‑1 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTTGTCGTAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGTAAGTGATGGTGGTggggg < 2:3626892/140‑1 (MQ=11) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg < 2:6270428/140‑1 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg < 2:907164/140‑1 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg < 1:9005208/140‑1 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg < 1:10760293/140‑1 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg < 1:69481/140‑1 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg < 1:10838345/140‑1 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg < 1:11029700/140‑1 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg < 1:9874706/140‑1 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg < 1:3986440/140‑1 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg > 2:10760293/1‑140 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGAAGGTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCAACCTTCCCCGCATGGGCATACTATTTGATTGCGGATGCGCGTGAGCGTTCAGGGACTGTTGTTTGTGTTGGTGGTggggg > 2:8740476/1‑140 (MQ=11) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCAGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGACTATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg < 1:642603/140‑1 (MQ=255) tGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTCGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGGAGTCTATTTGTTTGCGGATTCGGTGGAGAGTTCGGGGACGTGTGAAAGTGAGGGTggggggggga > 2:10318604/1‑138 (MQ=11) tGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGATAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGaa > 2:8545914/1‑140 (MQ=255) gCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCGGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAg < 1:9821087/140‑1 (MQ=255) cTGCGGCTACGGTCTCTCGGTGAGGCTCGAGCCTAACCTTTGTCGTATGTTCTCCTCCGTCCCCGCTTGGGCATATTATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCTTGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGa < 1:5063071/140‑1 (MQ=2) cTGCGGCACCGCTCTCTCGCTGACGCTCCAGCCGAACCTTCGTCGAAGCTTCACATCCTTCCCCGCAGGGGCAGATTATTTGATTCCGGATGCGTTAGAGCGTTCCGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGa < 2:6344872/140‑1 (MQ=11) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCTAGTCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGa < 2:10595092/140‑1 (MQ=255) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGa < 2:3912496/140‑1 (MQ=255) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCATAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGa < 2:1130205/140‑1 (MQ=255) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGATTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGa < 2:7503949/140‑1 (MQ=255) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCGTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGa < 1:7706844/140‑1 (MQ=255) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGACCCTAACCTTAGGCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTGGGGCAGAATATTTGATTGCGGTTTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGa < 1:2040343/140‑1 (MQ=11) gCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCGAGCCGAACCTTCGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttact < 2:6018345/140‑4 (MQ=255) gCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGTGCAGCACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttact < 1:11114994/140‑4 (MQ=11) gCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttact < 1:6046619/140‑4 (MQ=255) gCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCGTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttact < 1:7559721/140‑4 (MQ=255) cGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg < 2:5061637/126‑1 (MQ=255) cGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg > 1:5061637/1‑126 (MQ=255) cGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATGCGGTTGAGAGTTCAGGGAAGTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttagtcaga > 2:2619439/1‑133 (MQ=11) cctctcGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCGTCCCCGCTTGGGCAGAATTTTTTATTGCGGATTCGTTTGTTACTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCg < 2:6676208/139‑1 (MQ=14) ggCGCTCGAGTCGTACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGCCAGAATATTTTATTGCGGATTCGTTGGGGAGTTCAGGGACTTTTGATAGTGATGGTGGTGGGGGTAGGATTCGAAACTTCGAAGTCGATg > 1:872575/1‑140 (MQ=14) ggCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAGGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGGTGGGAAGTTCAGGGACTGTTGATAGGGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCGTCGAAGTCGATg > 2:2394951/1‑140 (MQ=11) cTCCAGTCGACCCTTGGTCGTAGCGTCTCAACCGTCCCCGCCTGGGCATACTACTTAATTTGGGATTCGTTGGCACGTTCCGGGACTTTAGCAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACgg < 1:335082/140‑1 (MQ=9) cctgtcGAACCTTGTTCTAAGCTTCTCAACCTTACACGCTTGGGCAGAATTTTTAATTGCGGAGTCGTTACGCAGTTCACGGAAATTTGCAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCa < 1:940614/135‑1 (MQ=9) cGAGGCGAACATCAGTCGAAGATGCTGATCCTTCCCCGCATGGGCTGTATATTTGATTGCGTATTCGCTTGGGAGTTCAGGGACTGTTGATAGTTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCa < 2:1326599/140‑1 (MQ=18) ggtCGTAGCTTCTCATCCTTCCCCGCCTGGGCTGTCTATTTAATTGCTGATTCGTTTTGAATTTCAGTGTCTTTTGTTAGTTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg < 1:2630520/138‑1 (MQ=17) cgtCCCCGCATGGGCAGAATCTGTGATTGCGGAGTCGCTTGTCAGGTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATGTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCg < 2:10414233/138‑1 (MQ=21) gggCAGAATATTTGAGTGCGGATTCGTTGGTGACTTCCGGGGCTTTTGACAGTGAGGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCccacc < 1:10004764/140‑1 (MQ=17) cGGATTCGCTTGAGATTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGACGATGACGGAAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGCGAACCCCACCAGGGGTAATTAAAAtttt > 2:10489763/1‑140 (MQ=21) ttCGTTTGTTAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAgg < 2:3146283/140‑1 (MQ=255) ttgggaagTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAAt < 2:1383646/134‑1 (MQ=255) gttagTTCAGGGTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCt < 2:3867134/137‑1 (MQ=255) ggaagTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCt < 1:2399161/137‑1 (MQ=255) ggaagTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCt < 2:1454903/137‑1 (MQ=255) ggaagTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCt < 2:1001222/137‑1 (MQ=255) gaagTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCtt < 1:6361502/138‑1 (MQ=255) tagTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTNGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTg < 1:10489763/139‑1 (MQ=255) ttCAGGGCCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCATATTTTGAGGTAATGCTTgaga < 1:150937/140‑1 (MQ=255) ttCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTgaga < 1:1327906/140‑1 (MQ=255) ttCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTgaga < 2:3766430/140‑1 (MQ=255) ttCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTgaga < 1:4110575/140‑1 (MQ=255) ttCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTgaga < 1:7560571/140‑1 (MQ=255) tccggggCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCATCGAAGACGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTAGGACGCTCGGGAACCCAACCAGCGGTCATTCAAATTTTGAGGTCATGCTTgagct > 2:11230828/4‑138 (MQ=18) tccgggACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGAt < 1:9047400/137‑1 (MQ=255) tCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGAt < 1:9523851/140‑1 (MQ=255) tCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGAt < 1:10615260/140‑1 (MQ=255) ccgggTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATTACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGAtg < 1:897582/138‑1 (MQ=255) cAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGAtg < 2:5887673/140‑1 (MQ=255) cAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGAtg < 1:948432/140‑1 (MQ=255) gACTTTTGCAAGTGATGGTGGTGGGTGACGGACTCGAACCTTCGAAGTCGATGACTGCAGCTATACAGTCTGCTCGCTGTGGCAGCTCGGTAACCCCACCAGGCGTAATTCATATTTTGAGGTAATGCTTGAGAtggtgg < 2:2641487/140‑1 (MQ=21) gACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGAtggtgg < 1:10568183/140‑1 (MQ=255) tttGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTggg > 2:2770539/1‑140 (MQ=255) tttGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTggg > 1:11153623/1‑140 (MQ=255) tGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTCCAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTggggg < 1:2853879/140‑1 (MQ=255) tGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTggggg < 2:4320897/140‑1 (MQ=255) tGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTggggg < 1:7388679/140‑1 (MQ=255) gAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGTCAGTTTTACAGTCTTCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGa < 1:10313819/140‑1 (MQ=255) caaGTGAAGCTGGGGGGGGAAGGCTTCGATCCTTCGTAGTCGATGACGTCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCTGGAACCCCACCATGGGTAATTGAAATGTTGTGGTATTGCTTGTGATGGTGGTGGGGGaa < 2:7982967/139‑1 (MQ=17) aaaGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGaa < 1:10084707/140‑1 (MQ=255) | TCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGA > NZ_CP025268/1293119‑1293396 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |