| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NZ_CP025268 | = 1293101 | 40 (0.060) | 311 (0.550) | 87/236 | 1.2 | 58.8% | noncoding (114/132 nt) | CXP41_RS06840 | RtT sRNA |
| ? | NZ_CP025268 | 1293574 = | 402 (0.710) | noncoding (66/85 nt) | CXP41_RS06855 | tRNA‑Tyr | |||||
Only 100 of 840 total aligned reads displayed.
CTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACGCGCCGCTG > NZ_CP025268/1293435‑1293713 | gtgGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAGGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGa < 1:4415644/140‑1 (MQ=255) gtgGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGa < 1:5591395/140‑1 (MQ=255) gcaacgctctctcgcttgcgatcgcggagaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattagttgggaagttaagggacttttgaaagtgatgttggtgggggaaggattCGa < 2:6286487‑M2/3‑1 (MQ=255) gcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttcattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGa < 2:9336279‑M2/3‑1 (MQ=255) aacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAAc > 1:1454903‑M2/136‑140 (MQ=255) cGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCg < 2:3160713/140‑1 (MQ=255) cGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGGGGGGGAAGGATTCGAACCTTCg > 2:8408297/1‑140 (MQ=255) ctcGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCg > 2:5882432/1‑140 (MQ=255) ggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATg > 1:3570561‑M2/122‑140 (MQ=255) ggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATg > 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ctcgagtcgaaccgtggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACgg < 1:5747676‑M2/23‑1 (MQ=255) cGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGTGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGc > 2:7455144/1‑140 (MQ=255) cGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACCTCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGc > 1:2052217/1‑140 (MQ=255) gCTCGTATCGATCCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCGTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCa < 2:5173772/140‑1 (MQ=255) gCTCGAATCGAACCTTAGTCGTAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACAACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCa < 2:7018308/140‑1 (MQ=255) gCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCa < 2:6160471/140‑1 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< 2:9552621‑M2/38‑1 (MQ=255) ggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg < 2:11002782‑M2/38‑1 (MQ=255) cTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg < 1:782422/140‑1 (MQ=255) cTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg < 2:3811881/140‑1 (MQ=255) aGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTc > 1:8541946/1‑140 (MQ=255) gTTCTCTCCCTTCCCAGATGAGTGATATCTTTCAGATTCTGACCTTTGTTACACCATCGCTGTGGTGATTTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGc < 2:8747055/140‑1 (MQ=17) gTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGc < 1:8313430/140‑1 (MQ=255) gTTCTCACCCCTCCCCGATGATTGCAAACTTTCTCACTCTCACCGTTGTTACCACATCTCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGc < 1:9833594/140‑1 (MQ=21) ctcACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCCCATCGCTGGGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCGTTGGCCGc > 2:974721/1‑140 (MQ=255) ctcACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGc > 1:4864325/1‑140 (MQ=255) tcACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGCAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTAGGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCt > 2:419604/1‑140 (MQ=255) tcACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCt > 1:965798/1‑140 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ccTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCggg < 2:3492071/140‑1 (MQ=255) ccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGa < 1:4126096‑M2/58‑1 (MQ=255) ttCCCCGCGGAGGGCACACTTTCACAATCTCACCGAAGTTCCCACATCGCGGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGAAGATTTACAGTCTGCTCCAGATGGCCGCTCGGGaa > 2:4774742/1‑140 (MQ=21) cccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGaa > 1:9011635‑M2/82‑140 (MQ=255) tCCCCGATGAGTGCACACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAc > 2:914468/1‑140 (MQ=255) tCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAc > 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cTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAg > 2:1288027/1‑140 (MQ=255) tttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg < 2:8200778‑M2/38‑1 (MQ=255) tttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg > 1:8200874‑M2/31‑68 (MQ=255) gtgAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCgggg < 2:1854609/140‑1 (MQ=255) gtgAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCgggg < 2:1577253/140‑1 (MQ=255) aaTTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCGTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGgcgc > 1:8055245/1‑140 (MQ=255) ttATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGcat > 1:4028610/1‑140 (MQ=255) tATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGcatc < 1:3061203/140‑1 (MQ=255) tATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGcatc < 1:7531500/140‑1 (MQ=255) gatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGcatc < 1:4765142‑M2/119‑1 (MQ=255) tggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGcatcat > 2:2595404‑M2/20‑140 (MQ=255) tggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGcatcat > 2:2817710‑M2/20‑140 (MQ=255) gtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCaa > 1:6297275‑M2/15‑140 (MQ=255) gtggGGGAAGGATTCGGAACTTCGAAGTCGATGACGGCCGTTTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCCCGGGGTCCTGCTTTTTACTGGCCGGCTCCGGGATCGGGAATCGGGGGGCCTCAGATcta > 2:9502785/1‑138 (MQ=17) tgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCgggg > 1:1779060‑M2/14‑126 (MQ=255) ggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATg > 2:4360906‑M2/12‑140 (MQ=255) aaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGAcgc > 1:5227914‑M2/8‑140 (MQ=255) aggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTACTGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGAcgcg < 1:255047‑M2/134‑1 (MQ=255) aggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGAcgcg < 1:11121475‑M2/134‑1 (MQ=255) aggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGAcgcg > 2:2201090‑M2/7‑140 (MQ=255) aggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGAcgcg < 1:3848412‑M2/134‑1 (MQ=255) tCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAcc > 1:6792571‑M2/2‑62 (MQ=255) cGAACCTTCGAAGTCTATGACGGCAGAGTTACAGTCAGCTCCCTTATGCCGCTCGGGAACCCCACCCCGGGGTAATGCATTTTACTGGCCTGCGCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATCTCTAATGAAGCGCCTCTg > 2:2354605/1‑140 (MQ=21) | CTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACGCGCCGCTG > NZ_CP025268/1293435‑1293713 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |