Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 1,292,991 | 0 | C | T | 65.9% | 304.2 / 263.4 | 320 | noncoding (46/132 nt) | CXP41_RS06835 | RtT sRNA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (21/81); new base T (104/93); total (141/179) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.32e-08 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 326 total aligned reads displayed.
GCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTT > NZ_CP025268/1292852‑1293126 | tcagatgatTTGATGTCTGATTAGTTTGAGTATTCGGGTTCTTTTGCAAGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGc < 2:6793273/133‑1 (MQ=11) tatTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCACAGCTCTCTCGGTGGCGCTACAGTCGAAcc > 1:7411648/1‑140 (MQ=11) ttGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTGGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCGAGACGAACCTTa > 1:439115/1‑140 (MQ=255) ttGATTGCGGACTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGGGATGGGGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCttg > 2:4859716/1‑139 (MQ=11) gATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTagt < 2:9263329/140‑3 (MQ=255) gATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCGCGAGTCGGACCttggt > 1:10850574/1‑137 (MQ=11) tGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTTAGCCCATCACACTTCTGAACGATGCCTGTGGCAAAGTTATCTCGCTTACTCTCGAGACGAACAATAGTCGa > 2:9155584/1‑140 (MQ=9) tGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGTCGAACCTTAGTCGa > 1:3947597/1‑140 (MQ=255) tGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGa < 2:7405714/140‑1 (MQ=255) tGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCACCGCTGCGCGCTTCGCCCAACGGGTCGATGCATGCGGCAACGCACACTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTCGTCGa > 2:4178620/1‑140 (MQ=14) tcGGATTCGTTTGAGTATTCCGTGTCTTTTGGAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGaa < 2:2847342/139‑1 (MQ=14) cGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAg > 2:6572103/1‑140 (MQ=14) cGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAg < 1:2291528/140‑1 (MQ=255) ttCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTtc < 1:6250606/140‑1 (MQ=255) gtttGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCa < 2:578916/138‑1 (MQ=255) tttGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCAt < 2:8067535/139‑1 (MQ=255) tttGAGAATTCCGGGGCCGTTGAAAGTGATGGTGGTGTGGGAAGGATTAGTCTGCTCTGCGAGATTAGCATTTGTGTTAGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCAt < 2:10334749/139‑1 (MQ=14) ttagagcATTCCTGGTCTTTTGTAAGGGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCAt < 1:11310738/137‑1 (MQ=11) ttGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGACGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCacc < 2:5396394/140‑3 (MQ=255) tGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGACGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATcc > 2:4026474/1‑140 (MQ=255) gaATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTc < 1:10511425/140‑1 (MQ=255) gaATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTc < 1:10214851/140‑1 (MQ=255) gaATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTc < 1:5037102/140‑1 (MQ=255) tCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCCGCGCTGCGCGCATCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGAGGCAACGATCTCTCGCTGACGCTCGAGGCGAACCTTATTCGAAGCTTCTCAACCGTCCCCg > 1:7198779/1‑140 (MQ=11) ccGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCGTGACGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGc > 2:6627014/1‑140 (MQ=255) cGGGGCTTTTGCAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCa < 1:7158200/140‑1 (MQ=25) ggggCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑t < 2:1055827/140‑1 (MQ=21) ggggCTATTGTTAGTGATGTTGGTGGGGCAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑t < 1:9329266/140‑1 (MQ=11) gggCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑Tg < 2:8979692/140‑1 (MQ=21) gggCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGAGCTGCGCGCTTCGCCCTACGTGTCGTTGCATGTGGCAACGGTCTCTCGCTTACGCACGACACGAACCTTAGTCGACTCGTCTCAACCTTCCCCGctgt > 1:5869469/1‑137 (MQ=11) tcTTTTGTAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑Tggg < 2:162259/139‑1 (MQ=12) gCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCTAGCCGAACCTTAGTCGAAGATTCTCATCCTTCCCCGCA‑Tggg < 1:6530402/140‑1 (MQ=16) gCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑Tggg < 2:11265384/140‑1 (MQ=18) gCTTTTGAAAGTGATGGTGGGGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑Tggg < 1:10273577/140‑1 (MQ=18) ttttGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCa < 2:7019181/140‑1 (MQ=17) ttttGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCa < 2:3330638/140‑1 (MQ=17) tattGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGAAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCa < 2:7270926/138‑1 (MQ=12) tgtaaGGGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCAGaa < 2:1237949/137‑1 (MQ=12) tGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCAGAATCtttg > 2:4414222/1‑139 (MQ=9) gAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGtt < 1:3437517/140‑1 (MQ=255) aaGGATTACTCAGAGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCGGCGGCAACGCTCTCTAGCTGTCGCTCGACTCGAACCTATGTCGAAGCTTATCAACCTTCACCGCA‑ACGGCAGAATATTTAAATTCGGATTAGttt > 2:6872849/1‑139 (MQ=11) aGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTCGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTgg < 1:10732042/140‑1 (MQ=11) ggATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTggg < 1:2375060/140‑1 (MQ=255) gATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGa < 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aGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAgg < 1:2970171/140‑1 (MQ=255) cgcTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCCGAATATTTAATTGCGGATTGGTTGGGAAGTTCAGGGa > 2:5018569/1‑140 (MQ=14) cgcTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGa > 2:10885847/1‑140 (MQ=255) cgcTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCATCCCCGCA‑TGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGa > 1:9425016/1‑140 (MQ=14) cgcTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCGTGGTCGAAGCTTCAAATCCCTCCCCGCC‑GTGGCAGAATTGTTTATTGGGGATTGGTTGGGTAGTTCAtggg > 1:901429/1‑139 (MQ=2) cgcgcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGGGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑GGGGGGGGAGATTTAATTGCGGATTCGGTGGGAAGGTGAGGGCCgttt > 1:7509141/1‑140 (MQ=11) cgcgcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCAAACTTCCCCGCA‑TGGGCAGAAAATTTAATTGCGGATTCGTTTGGACGTTGCGGGACgttg > 2:3100318/1‑139 (MQ=11) cgcgcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCGCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCAGTATATTTATTTGCGGATTCGTTGGGAAGTGAAGGGAcgtgt > 2:9520490/1‑136 (MQ=14) cgcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGa < 2:3954176/140‑1 (MQ=255) cgcTTCGCCCTTCGGGTCGTAGCCTGCGGCAACGCACTCTCGCTGGCGCTCGAGGAGATCCGTGTTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGa < 2:4627638/140‑1 (MQ=14) cTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCTAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGaaa < 2:5571003/140‑1 (MQ=14) cTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGaaa < 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aaCGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaac > 1:1454903‑M1/1‑135 (MQ=255) cGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaacct > 2:3741079‑M1/1‑133 (MQ=255) tctctcGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcg < 2:9425016‑M1/140‑11 (MQ=255) tctctcGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcg < 2:7548962‑M1/140‑11 (MQ=255) tctctcGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcg < 2:6131195‑M1/140‑11 (MQ=255) tctcGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGGTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaa > 1:6284210‑M1/1‑128 (MQ=255) tcGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGGTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGACGGATTcgaaccttcgaagt > 1:1759298‑M1/1‑126 (MQ=255) tcGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGGTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGGGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagt > 1:10336002‑M1/1‑126 (MQ=255) gCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGtt < 1:4040532/78‑1 (MQ=11) cTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcga > 2:3574838‑M1/1‑123 (MQ=255) ggcgcTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatg > 2:11039105‑M1/3‑121 (MQ=255) gcgCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTGGGGAAGTTCCGGGAGTTTTGATAGTGATGGTGGGGGGGGTAGGCTTcgatccttcgaagtcgatga > 1:2665695‑M1/2‑120 (MQ=255) gCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCAGAATATTTAAATGAGGATTCGTTGGGAAGTTCATGGACTTTTTAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTagaaacttcgaagtcgatgacg > 1:8829960‑M1/1‑118 (MQ=255) gCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGGTTGTTAGTTCAGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaacatcgaagtccatgacg > 1:1239238‑M1/1‑118 (MQ=255) ctctAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCT‑TGTGCAGAATATTTTATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacgg < 1:8285567‑M1/140‑24 (MQ=255) cTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGCAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacgg < 1:10601270‑M1/140‑24 (MQ=255) cTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacgg < 1:11039105‑M1/140‑24 (MQ=255) cTCGAGTCGAACCGTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacgg < 1:5747676‑M1/140‑24 (MQ=255) tCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGGGGGGGAAGGATGcgaaccttcgaagtcgatgacggc > 2:7697741‑M1/1‑116 (MQ=255) tCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTGGTAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccatcgaagacgatgacgga > 2:1729618‑M1/1‑116 (MQ=255) cGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggca < 1:2898477‑M1/140‑26 (MQ=255) cGAGTCGAACCGTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACATTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgaagacggca < 1:48500‑M1/140‑26 (MQ=255) | GCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCA‑TGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTT > NZ_CP025268/1292852‑1293126 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |