| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 1,293,169 | 0 | C | T | 24.1% | 299.6 / 116.8 | 200 | noncoding (46/132 nt) | CXP41_RS06840 | RtT sRNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (31/114); new base T (24/22); total (58/142) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.36e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.90e-01 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 200 total aligned reads displayed.
TGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCA > NZ_CP025268/1293055‑1293304 | ttgagaGTTCCGGTACTTTTGAAAGGGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATc < 1:2405553/135‑1 (MQ=11)ttgagaGTTCAGGGTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATc < 1:3339931/135‑1 (MQ=11) cAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGc < 1:4414222/140‑1 (MQ=255) cAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGGCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGc > 1:9012066/1‑140 (MQ=255) ggcTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCTCCCTTCGGTTCGTTGCCTTCGGCAAAGCTCTCTCGCTGGCGCACGAGTCGAACATTGGTCGAAGATTCTCATCCTTCCCCGCATgg > 2:6769318/3‑140 (MQ=11) tgttttGAATTTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATggg < 1:5437900/138‑1 (MQ=11) gcTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATggg < 1:1748191/139‑1 (MQ=9) aattttGCCAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGACGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATggg < 2:9132645/138‑1 (MQ=11) ttttGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCa < 2:1432984/140‑1 (MQ=12) tttGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTTCCTGCGGCAAAGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCAACCTTCCCCGCATGGGCAg > 2:4982848/1‑140 (MQ=11) tttGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAg > 2:10676905/1‑140 (MQ=12) tttGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCGTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAg > 2:1652990/1‑140 (MQ=255) tttGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCACGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTAAAACTTCCCCCCATggggcg > 1:3794173/1‑137 (MQ=11) tttGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGAGGCAACGCACTCTCGCTTGCGCTCGAGTCGAAACTTTGTAGATGCTTCTCAAACTTACCCGCAtctgaag > 2:2334748/1‑134 (MQ=11) gagtaaGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCCAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGa < 2:5967203/136‑1 (MQ=11) tACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCCAGCCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGATTCGGGTGAGAGt > 2:1712903/1‑140 (MQ=11) aCTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATACATCCCCGCATGGGCCGAAT‑ATTTGATTGCGGAGTCGCGTGAGAGtt > 2:8955172/1‑140 (MQ=11) aCTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGACTGCGGCAACGCTCTCTCGGTGTCGCTCGAGCCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCCTCATTCCCCGCCTGGGCCGAGG‑AGTTGAGTGCGGATTCGCGTGGGAGtg > 2:6053367/1‑139 (MQ=11) tgcgcTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGTAT‑ATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAgg < 1:3088810/139‑1 (MQ=255) aGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAgg < 1:1313957/140‑1 (MQ=21) gcgcTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAggg < 1:419012/140‑1 (MQ=21) gcgcTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAggg < 1:8129044/140‑1 (MQ=21) gcgcTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAggg < 1:9507714/140‑1 (MQ=21) gcgcTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAggg < 1:6808051/140‑1 (MQ=21) gcgcTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAggg < 1:7471368/140‑1 (MQ=21) gcgcTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAggg < 1:3011118/140‑1 (MQ=21) gcgcTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAggg < 1:10335648/140‑1 (MQ=21) cgcTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGGCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGCACCTTGGTCGGAGCTTGTCATCCTTCCCCGCGTGGGGAGAATCATTTG‑TTGCGGCGTGGGTTGAGAGttacgggg > 1:8802813/1‑134 (MQ=0) cgcTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAATTCGAACCGGTGTCGTAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGTAT‑ATTTGATTGCGGATGGGTTTGTGAGttacgggg > 2:10496744/1‑134 (MQ=1) cgcTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCGTCCCCGCAGGGGCAGACT‑ATTTGTTTGCGGATTCGCTTGTGAGTTCAgggg > 1:11036111/1‑139 (MQ=11) cgcTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCGTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGATTCGCTTGTGAGTTCAGGGa > 1:10780168/1‑140 (MQ=255) cgcTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCGTAGTCGAAGCTTCTCAACCGTCCCCGCATGGGCAGAAT‑ATTTGATTTCGGATTCGCTTGTGAGTTGAgggg > 1:8920426/1‑139 (MQ=11) gcTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGAc < 2:2857516/140‑1 (MQ=255) tGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCGGACGCGCGAGCCGAACCTTGGTAGAAGCTTCTCCTACTTCCCCGCATGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGAGTAGCTTGAGAGTTAAGGGACtt > 2:40220/1‑140 (MQ=11) cgcgcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGGCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCGTGCCCGCATGGGCCGAAT‑ATTTTATTGCGGATTAGGTTGGGAGTTGAGGGACtttt > 2:38845/1‑140 (MQ=11) cgcgcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGATCCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGAGTCGCGTGAGCGTTCAGGGACtttt > 2:9068146/1‑140 (MQ=11) cgcgcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGATTCGCTTGTGAGTTCAGGGACtttt > 2:7133489/1‑140 (MQ=255) cgcgcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCAGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCACGAGCCGAACCATAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCCTGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGTTTCGCGTGAGAGTTAAGGGACtttt > 2:129715/1‑140 (MQ=11) gcgcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTg < 2:8147124/140‑1 (MQ=255) cgcgTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGa < 1:6745595/140‑1 (MQ=255) gcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGACGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCAGGGACTTTTGaa < 1:2738480/140‑1 (MQ=11) gcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGaa < 1:913764/140‑1 (MQ=255) gcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAAACTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGaa < 1:961314/140‑1 (MQ=255) cTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCTCTGACGCTCTAGCCGAACCTTAGTCGAAGATTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGaaa < 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1:10838345/140‑1 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg < 1:1577642/140‑1 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg < 1:9874706/140‑1 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCAGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGACT‑ATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg < 1:642603/140‑1 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCGCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg < 1:4387998/140‑1 (MQ=255) tGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGATTCGCTTGATAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGaa > 2:8545914/1‑140 (MQ=255) gCCTGCGGCATCGCTCTCGCGCTGTCGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAg < 1:4031415/140‑1 (MQ=255) gCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCGGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAg < 1:9821087/140‑1 (MQ=255) cTGCGGCTACGGTCTCTCGGTGAGGCTCGAGCCTAACCTTTGTCGTATGTTCTCCTCCGTCCCCGCTTGGGCATATT‑ATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCTTGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGa < 1:5063071/140‑1 (MQ=2) cTGCGGCTACGCTCTCTCGCTGACGATCGAGCCGAACCGTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGATT‑ATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGa < 1:178841/140‑1 (MQ=11) cTGCGGCATCGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTGAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCATTAT‑ATTTGATTGCGGATTAGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGTAGGa < 1:11250087/140‑1 (MQ=11) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCTAGTCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGa < 2:10595092/140‑1 (MQ=255) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTGCCCCGCTTGGGCAGAAT‑ATTGGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGa < 2:2449300/140‑1 (MQ=11) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCATAAT‑ATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGa < 2:1130205/140‑1 (MQ=255) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGATTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGa < 2:7503949/140‑1 (MQ=255) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGa < 2:6344732/140‑1 (MQ=255) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTGAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGATTTCATGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGa < 2:870225/140‑1 (MQ=11) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGACCCTAACCTTAGGCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTGGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGTTTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGa < 1:2040343/140‑1 (MQ=11) gCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGTGCAGCACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttact < 1:11114994/140‑4 (MQ=11) gCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttact < 1:6046619/140‑4 (MQ=255) gCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCGTCCCCGCATGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttact < 1:7559721/140‑4 (MQ=255) cGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg > 1:5061637/1‑126 (MQ=255) cGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGATGCGGTTGAGAGTTCAGGGAAGTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAttagtcaga > 2:2619439/1‑133 (MQ=11) cctctcGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCGTCCCCGCTTGGGCAGAAT‑TTTTTATTGCGGATTCGTTTGTTACTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCg < 2:6676208/139‑1 (MQ=14) | TGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAT‑ATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCA > NZ_CP025268/1293055‑1293304 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |