| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NZ_CP025268 | 886,964 | A→G | *372* (TAA→TAG) S208S (AGT→AGC) |
yliI → gstB ← |
aldose sugar dehydrogenase YliI glutathione S‑transferase GstB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_CP025268 | 886,964 | 0 | A | G | 99.4% | 2198.2 / NA | 636 | *372* (TAA→TAG) S208S (AGT→AGC) | yliI gstB | aldose sugar dehydrogenase YliI glutathione S‑transferase GstB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (276/355); minor base T (1/3); total (278/358) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.36e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 641 total aligned reads displayed.
AAAGTGACAGAAGATGGCCGTATTTTAACGGACAGAGGGCAGCGAATTCGTGATGTTCGCACTGGACCCGACGGTTATTTATACGTTCTCACCGACGAGTCCAGTGGGGAATTACTTAAAGTTAGCCCACGCAATTAACTAACGGGAATCATCACCACTTTGCGCACTGCGGGGCGTTCAGTGAGTTGCTGATACCAGCGTTGCAGATTTGGACGCGGTGTCCAGGTCAGGCCAACGTTAAACAAATTGTAGATGAACGGTGCGATAGCGATA > NZ_CP025268/886827‑887099 | aCAGAAGATGGCCGTATTTTAACGGACAGAGGGCAGCGAATTCGTGATGGTCGCACTGGACCCGACGGTTATTTATACGTTCTCACCGACGAGTCCAGTGGGGAATTACTTAAAGTTAGCCCACGCAATTAGCTAACggg > 2:9648155/1‑140 (MQ=255) cAGAAGATGGCCGTATTTTAACGGACAGAGGGCAGCGAATTCGTGATGTTCGCACTGGACGCGACGGTTATTTATACGTTCTCACCGACGAGTCCAGTGGGGAATTACTTAAAGTTAGCCCACGCAATTAGCTAACGGGa < 2:4478782/140‑1 (MQ=255) aTGGCCGTATTTTAACGGACAGAGGGCAGCGAATTCGTGATGTTCGCACTGGACCCGACGGTTATTTATACGTTCTCACCGACGAGTCCAGTGGGGAATTACTTAAAGTTAGCCCACGCAATTAGCTAACGGGAatcatc > 2:89533/1‑140 (MQ=255) tGGCCGTATTTTAACGGACAGAGGGCAGCGAATTCGTGATGTTCGCACTGGACCCGACGGTTATTTATACGTTCTCACCGACGAGTCCAGTGGGGAATTACTTAAAGTTAGCCCACGCAATTAGCTAACGGGAAtcatca > 2:339250/1‑140 (MQ=255) 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|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |