Predicted mutation | ||||||
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RA | NZ_CP025268 | 1,101,377 | T→C | *388* (TAA→TAG) | CXP41_RS05705 ← | IS3‑like element IS3 family transposase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NZ_CP025268 | 1,101,377 | 0 | T | C | 99.8% | 1372.4 / NA | 422 | *388* (TAA→TAG) | CXP41_RS05705 | IS3‑like element IS3 family transposase |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.58e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 422 total aligned reads displayed.
CTATCGACTGGCTGATAACGCACTTTACGAGGCGAAAGAGACCGGGCGTAATAAGGTGGTTGTGAGGGATGTGGTGAATTTTTGTGAGTCACCATAAAGCGGCATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTG > NZ_CP025268/1101240‑1101508 | cGACTGGCTGATAACGCACTTTACGAGGCGAAAGAGACCGGGCGTAATAAGGTGGTTGTGAGGGATGTGGTGAATTTTTGTGATTCACCATAAAGCGGCATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCg < 2:7153914/140‑1 (MQ=255) tGGCTGATAACGCACTTTACGAGGCGAAAGAGACCGGGCGTAATAAGGTGGTTGTGAGGGATGTGGTGAATTTTTGTGAGTCACCATAAAGCGGCATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGt > 1:5440327/1‑140 (MQ=255) ggCTGATAACGCACTTTACGAGGCGAAAGAGACCGGGCGTAATAAGGTGGTGGTGAGGGATGTGGTGAATTTTTGTGAGTCACCATAAAGCGGCATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAgggt > 2:10415161/1‑138 (MQ=255) gATAACGCACTTTACGAGGCGAAAGAGACCGGGCGTAATAAGGTGGTTGTGAGGGATGTGGTGAAGTTTTGTGAGTCACCATAAAGCGGCATTTTGATCCTACCCCCGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTg > 1:1380581/1‑140 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |