| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 1,391,913 | A→G | T126A (ACA→GCA) | tyrR → | transcriptional regulator TyrR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 1,391,913 | 0 | A | G | 99.8% | 1496.3 / NA | 430 | T126A (ACA→GCA) | tyrR | transcriptional regulator TyrR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (271/158); minor base T (1/0); total (272/158) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 453 total aligned reads displayed.
TGGCGTTGAGCGCGTTACTGGAGGCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCACACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGA > NZ_CP025268/1391776‑1392049 | tGGCGTTGAGCGCGTTACTGGAGGCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCcgca > 1:3739185/1‑140 (MQ=255) gCGTTGAGCGCGTTACTGGAGGCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCcgcaca > 2:6231140/1‑140 (MQ=255) cGTTGAGCGCGTTACTGGAGGCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACaa < 1:5288869/140‑1 (MQ=255) ttGAGCGCGTTACTGGAGGCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAAtt < 2:9231898/140‑1 (MQ=255) gAGCGCGTTACTGGAGGCGTNGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAATTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTNGATCGCCNGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGa > 1:5917927/1‑140 (MQ=255) aGCGCGTTACTGGAGGCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATCTGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGAt > 2:8828400/1‑140 (MQ=255) aGCGCGTTACTGGAGGCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGAt > 1:5185647/1‑140 (MQ=255) aGCGCGTTACTGGAGGCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGAt > 1:3610224/1‑140 (MQ=255) aGCGCGTTACTGGAGGCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGAt > 2:5676580/1‑140 (MQ=255) cgTTACTGGAGGCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAAc > 1:8975150/1‑140 (MQ=255) tACTGGAGGCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGc > 2:1490222/1‑140 (MQ=255) gCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAAttt > 1:8289115/1‑140 (MQ=255) gTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAAttttt > 2:2818076/1‑140 (MQ=255) tGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTa > 1:5768966/1‑140 (MQ=255) tGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTa > 2:448421/1‑140 (MQ=255) tGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTGTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTa > 2:349238/1‑140 (MQ=255) gCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTAc > 2:607794/1‑140 (MQ=255) cTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGt < 2:6494932/140‑1 (MQ=255) aaCCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTgg > 2:9820221/1‑140 (MQ=255) aCCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGc > 2:10787499/1‑140 (MQ=255) tgCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCGCAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGaa > 1:9380114/1‑140 (MQ=255) tgCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGaa > 2:11228443/1‑140 (MQ=255) tgCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGaa > 1:881508/1‑140 (MQ=255) tgCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGaa > 1:8510536/1‑140 (MQ=255) tgCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGaa > 1:6213984/1‑140 (MQ=255) ctctGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCg < 1:7202252/140‑1 (MQ=255) tGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAAc > 1:919810/1‑140 (MQ=255) tGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAAc > 1:10971887/1‑140 (MQ=255) tGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAAc > 1:2970482/1‑140 (MQ=255) tGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAAc > 1:3344620/1‑140 (MQ=255) cGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGc > 2:10208272/1‑140 (MQ=255) cGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGc > 1:4908936/1‑140 (MQ=255) cGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGc > 1:6536653/1‑140 (MQ=255) cGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGATGGAAAGCGAACCGc > 2:1243170/1‑140 (MQ=255) cGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGAAACCATACCGACGCACAATTGATTAAAGGATTTAATTTTTTACGTTGGCTGGACAGAGAACCGc > 2:11022183/1‑140 (MQ=255) atatGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACAAGGAGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGACTGCGCAACCATACAGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTTTTTTTTTTCTTTGGGGGGCATGCGAACGGCac > 2:9102520/1‑139 (MQ=255) tGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGAt > 1:287152/1‑140 (MQ=255) tGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTGTAATTTTTTACGTTGGCTGGACAGCGAACCGCAAGAt > 2:7292805/1‑140 (MQ=255) gAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGAtt < 1:5500828/140‑1 (MQ=255) gAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTGGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGAtt < 1:7484130/140‑1 (MQ=255) aaaaGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTc > 1:11273487/1‑140 (MQ=255) aaaaGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTc > 1:10112046/1‑140 (MQ=255) aaaaGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTc > 1:5614157/1‑140 (MQ=255) caaGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCGTTTTGGGCAAAAATTGGCTCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCg < 2:6776734/139‑1 (MQ=255) aaaGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCg < 2:6994194/140‑1 (MQ=255) aaGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGc > 1:6407126/1‑140 (MQ=255) aaGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGc > 1:272609/1‑140 (MQ=255) aGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACg > 1:1383482/1‑140 (MQ=255) tGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAg < 2:2284856/140‑1 (MQ=255) ggATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGc < 2:8443387/140‑1 (MQ=255) gATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCa > 2:9799635/1‑140 (MQ=255) atatGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCAt < 2:8708148/140‑1 (MQ=255) tatGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATg < 1:6740988/140‑1 (MQ=255) atGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGt < 2:2688208/140‑1 (MQ=255) ggCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCg > 1:7899106/1‑140 (MQ=255) gCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGt > 1:4616923/1‑140 (MQ=255) gAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAACATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGACAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGtta > 2:2009048/1‑140 (MQ=255) gAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGtta > 1:7651189/1‑140 (MQ=255) gAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGtta > 1:1201616/1‑140 (MQ=255) aCCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGttatt > 2:590469/1‑140 (MQ=255) aCCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGttatt > 1:6339234/1‑140 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1:4459798/139‑1 (MQ=255) aGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTc < 1:1671166/140‑1 (MQ=255) aGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTc < 2:4833092/140‑1 (MQ=255) ttttGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGa < 2:1669605/140‑1 (MQ=255) ttttGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGa < 1:5579629/140‑1 (MQ=255) tttGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGAt < 2:4438157/140‑1 (MQ=255) tttGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGAt < 2:7759559/140‑1 (MQ=255) ttGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATg > 1:10231277/1‑140 (MQ=255) ttGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTGGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATg < 2:250106/140‑1 (MQ=255) ttGGGCAAAAATTGGAACGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATg < 1:6027828/140‑1 (MQ=255) gggCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTCACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGga > 2:4043350/1‑140 (MQ=255) gggCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGga < 2:36123/140‑1 (MQ=255) gggCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTATTTAATGGGCAGAATTTCCTGATGga < 2:4333768/140‑1 (MQ=255) cAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGAt < 1:9066158/140‑1 (MQ=255) aaaaaTTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGAtt > 1:4110610/1‑140 (MQ=255) aaaaTTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTa < 1:8464215/140‑1 (MQ=255) aaTTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACg < 2:3075587/140‑1 (MQ=255) ccTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATc > 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cAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAgg < 2:5115370/140‑1 (MQ=255) ccATACCGCCGCACACTTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTCGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATg > 1:348273/1‑140 (MQ=255) ccATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCTAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTGTATCTTCAGGATg > 2:8049297/1‑140 (MQ=255) aTACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGaa > 1:3062790/1‑140 (MQ=255) tACCGCCGCACCATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGaaa < 2:7540382/140‑1 (MQ=255) aCCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGaaaa > 2:7185315/1‑140 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TGGCGTTGAGCGCGTTACTGGAGGCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCACACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGA > NZ_CP025268/1391776‑1392049 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |