| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 1,534,757 | A→G | pseudogene (2037/2037 nt) | CXP41_RS08125 → | RHS repeat protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 1,534,757 | 0 | A | G | 99.5% | 1310.9 / NA | 377 | pseudogene (2037/2037 nt) | CXP41_RS08125 | RHS repeat protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (45/330); minor base T (0/2); total (45/332) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 377 total aligned reads displayed.
TGGCGATTTTTCTGCCAAATGTAGCGATGCATGTATTGAAAAATATAACACTGGGCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAAAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTATTTTATGGACATAAAACACCAAAGAGCGTTGAGATATATCTTTCTGAA > NZ_CP025268/1534622‑1534890 | ggCGAGTTTTCTGCCAAATCGAGCGATGCCTGTATTGAAAAACATAACACTGGGCAACTCTTCGGGATAGATGGTATCAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAACGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCa < 2:10166634/140‑1 (MQ=255) ccAAATGTAGCGATGCATGTATTGAAAAATATAACACTGGGCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCAtttt < 1:5613557/140‑1 (MQ=255) ccAAATGTAGCGATGCATGTATTGAAAAATATAACACTGGGCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCAtttt < 1:3708742/140‑1 (MQ=255) ccAAATGTAGCGATGCATGTATTGAAAAATATAACACTGGGCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCAtttt < 1:4415575/140‑1 (MQ=255) ccAAATGTAGCGATGCATGTATTGAAAAATATAACACTGGGCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCAtttt < 1:5108641/140‑1 (MQ=255) ccAAATGTAGCGATGCATGTATTGAAAAATATAACACTGGGCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCAtttt < 1:6361817/140‑1 (MQ=255) tGTAGCGATGCATGTATTGAAAAATATAACACTGGGCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTaa < 1:6251721/140‑1 (MQ=255) tGTAGCGATGCATGTATTGAAAAATATAACACTGGGCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTaa < 1:3578153/140‑1 (MQ=255) gTAGCGATGCATGTATTGAAAAATATAACACTGGGCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAAt < 2:4687199/140‑1 (MQ=255) gTAGCGATGCATGGAGTGAAAAATATAACACTGGGCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAAt < 2:9470602/140‑1 (MQ=255) tAGCGATGCATGTATTGAAAAATATAACACTGGGCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAAtt < 1:989536/140‑1 (MQ=255) aGCGATGCATGTATTGAAAAATATAACACTGGGCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTa < 2:6139965/140‑1 (MQ=255) aGCGATGCATGTATTGAAAAATATAACACTGGGCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTa < 2:4213406/140‑1 (MQ=255) gATGCATGTATTGAAAAATATAACACTGGGCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTAccc < 1:4346696/140‑1 (MQ=255) aTGCATGTATTGAAAAATATAACACTGGGCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCNAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCt < 1:5976723/140‑1 (MQ=255) aTGCATGTATTGAAAAATATAACACTGGGCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCt < 2:2449694/140‑1 (MQ=255) aTGCATGTATTGAAAAATATAACACTGGGCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCt < 1:3964001/140‑1 (MQ=255) aTGCATGTATTGAAAAATATAACACTGGGCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCt < 2:3166727/140‑1 (MQ=255) cATGTATTGAAAAATATAACACTGGGCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCtt > 2:4424141/1‑138 (MQ=255) cATGTATTGAAAAATATAACACTGGGCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTg < 2:3428478/140‑1 (MQ=255) cATGTATTGAAAAATATAACACTGGGCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTg > 2:1199830/1‑140 (MQ=255) aTGTATTGAAAAATATAACACTGGGCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGt < 1:7343910/140‑1 (MQ=255) aTTGAACAATATAACACTGGGCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATCAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTAt < 2:217451/140‑1 (MQ=255) aTTGAAAAATATAACACTGGGCAACTCTTCGTGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTAt < 2:10930720/140‑1 (MQ=255) aTTGAAAAATATAACACTGGGCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATATAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTAt < 2:1833407/140‑1 (MQ=255) aTTGAAAAATATAACACTGGGCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTAt < 1:2852145/140‑1 (MQ=255) aTTGAAAAATATAACACTGGGCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTAt < 1:153944/140‑1 (MQ=255) gAAAAATATAACACTGGGCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATttg < 1:9039627/140‑1 (MQ=255) aaTATCACACTGGGCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATCATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATGACCCTTTGTTTATTtgttgt < 2:7135995/140‑1 (MQ=255) atatAACACTGGGCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTgttgtt < 1:9242412/140‑1 (MQ=255) atatAACACTGGGCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTgttgtt < 1:11178394/140‑1 (MQ=255) atatAACACTGGGCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTgttgtt < 2:1555785/140‑1 (MQ=255) agataACACTGGGCAACTCTTCGGGTTAGAGGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAACGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCACATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATGACCCTTTGTTTATTTgttgtt < 2:6302499/138‑1 (MQ=255) taACACTGGGCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTAc > 2:4884291/1‑140 (MQ=255) aaCACTGGGCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTAcc < 1:9095408/140‑1 (MQ=255) acacTGGGCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCt < 1:1471674/140‑1 (MQ=255) acacTGGGCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCt < 1:1735216/140‑1 (MQ=255) cacTGGGCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCtt > 1:7551633/1‑140 (MQ=255) acTGGGCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTg < 1:10790821/140‑1 (MQ=255) ggCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGtt > 1:4655289/1‑140 (MQ=255) acactTCGGGTTAGATGGTATAATAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGAt < 2:8444725/137‑1 (MQ=255) aCTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCTATAAAAGCAAAGCAAGTGAGTTCAGATGCTTCTAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGAt < 2:6647068/140‑1 (MQ=255) ctctTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATa < 2:2924653/140‑1 (MQ=255) ctctTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATa < 2:8228451/140‑1 (MQ=255) ctctTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATa < 1:2031668/140‑1 (MQ=255) tctTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATaa < 2:8864449/140‑1 (MQ=255) tctTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATaa < 1:7879499/140‑1 (MQ=255) tctTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATaa < 1:3034649/140‑1 (MQ=255) ctTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAAc < 1:4884291/140‑1 (MQ=255) cgtCGGGACAGATGGTATACCAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAAc < 1:10688852/138‑1 (MQ=255) gggTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAAtt < 1:2433801/140‑1 (MQ=255) ggTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTc < 1:10963916/140‑1 (MQ=255) gTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCa < 1:4219168/140‑1 (MQ=255) taAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACAt < 2:6915520/140‑1 (MQ=255) aaaaGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATc < 2:354064/140‑1 (MQ=255) aGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTa > 1:8250544/1‑140 (MQ=255) gCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTAt < 1:845729/140‑1 (MQ=255) gATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTtgttgt > 1:8848117/1‑96 (MQ=255) gATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTAtttt < 2:6462193/140‑1 (MQ=255) gATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTAtttt > 1:5376443/1‑140 (MQ=255) gATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTAtttt > 1:1002825/1‑140 (MQ=255) gATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTAtttt > 1:6810934/1‑140 (MQ=255) tAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTATTTTAt < 2:5835347/140‑1 (MQ=255) atacAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGTCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTATTTTATgg < 2:10465340/137‑1 (MQ=255) aTCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTATTTTATgg < 1:8130021/140‑1 (MQ=255) tCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATa < 2:3790512/108‑1 (MQ=255) cAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTATTTTATGGACa < 2:984755/140‑1 (MQ=255) cAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTATTTTATGGACa < 1:10421501/140‑1 (MQ=255) ctAAAAGCAAAGCACGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAGCTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTATTTTATGGACATa < 2:11259751/139‑1 (MQ=255) aTAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTATTTTATGGACATa < 2:8706403/140‑1 (MQ=255) aTAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTATTTTATGGACATa < 1:1628253/140‑1 (MQ=255) aaagcaaagcAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTATTTTATGGACATaaaa < 1:9869396/140‑1 (MQ=255) agcaaagcaaGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTATTTTATGGACATAAAaca < 1:1214127/140‑1 (MQ=255) aagcaaGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTATTTTATGGACATAAAACACCaa < 1:3484113/140‑1 (MQ=255) agcaaGTGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTATTTTATGGACATAAAACACCaaa < 1:321491/140‑1 (MQ=255) agcaaGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTATTTTATGGACATAAAACACCaaa < 2:10810700/140‑1 (MQ=255) agcaaGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTATTTTATGGACATAAAACACCaaa < 1:8612571/140‑1 (MQ=255) agcaaGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTATTTTATGGACATAAAACACCaaa < 1:11006615/140‑1 (MQ=255) agcaaGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTATTTTATGGACATAAAACACCaaa < 1:2360614/140‑1 (MQ=255) agcaaGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTATTTTATGGACATAAAACACCaaa < 2:6749067/140‑1 (MQ=255) gcaaGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTATTTTATGGACATAAAACACCAAag < 2:7781246/140‑1 (MQ=255) gggAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTATTTTATGGACATAAGACACCAAAGAGCg < 1:5816170/140‑1 (MQ=255) gggAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTATTTTATGGACATAAAACACCAAAGAGCg < 2:3690804/140‑1 (MQ=255) gggAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTATTTTATGGACATAAAACACCAAAGAGCg < 1:712907/140‑1 (MQ=255) ggAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTATTTTATGGACATAAAACACCAAAGAGCGt < 2:9180915/140‑1 (MQ=255) ggAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTATTTTATGGACATAAAACACCAAAGAGCGt < 1:6959462/140‑1 (MQ=255) ggAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTATTTTATGGACATAAAACACCAAAGAGCGt < 1:6653287/140‑1 (MQ=255) ggAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTATTTTATGGACATAAAACACCAAAGAGCGt < 2:4555881/140‑1 (MQ=255) ggAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTAATTTTTTTATTTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTATTTTATGGACATAAAACACCAAAGAGCGt < 2:6014136/140‑1 (MQ=255) ggAGTTCAGATGCATCAAAGTATTAGCGGAAAACATGTCATATTCTGAATTACCCTTTGTTTATTTGTGCTCTACCATGGGATTGATAACAATTCACAATCTGACATCGGATTTTATGGACACAAAACACCAAACAGCGt < 2:2805115/140‑1 (MQ=255) gAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTATTTTATGGACATAAAACACCACAGAGCGtt < 2:4003595/140‑1 (MQ=255) gAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTATTTTATGGACATAAAACACCAAAGAGCGtt < 2:7545032/140‑1 (MQ=255) gAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTATTTTATGGACATAAAACACCAAAGAGCGtt < 2:5376443/140‑1 (MQ=255) gAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTATTTTATGGACATAAAACACCAAAGAGCGtt < 2:5477382/140‑1 (MQ=255) gAGCTCAGAAGCTTCAAATTCTTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTATTTTATGGACATAAAACACCAAAGAGCGtt < 1:10266956/140‑1 (MQ=255) aGTTCAGATGCTTCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTATTTTATGGACATAAAACACCAAAGAGCGTTg < 1:1151118/140‑1 (MQ=255) tCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAAt > 2:802931/1‑36 (MQ=255) tCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTg < 1:2643581/65‑1 (MQ=255) tCAAATTATTAGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTATTTTATGGACATAAAACACCAAAGAGCGTTGAGATATATCttt < 1:6951111/140‑1 (MQ=255) ttattaGAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTATTTTATGGACATAAAACACCAAAGAGCGTTGAGATATATCTTTCTGaa < 1:6023664/140‑1 (MQ=255) | TGGCGATTTTTCTGCCAAATGTAGCGATGCATGTATTGAAAAATATAACACTGGGCAACTCTTCGGGTTAGATGGTATAAAAGCAGATAATCCAATAAAAGCAAAGCAAGGGAGTTCAGATGCTTCAAATTATTAAAGGCAAACTTGTCATTTTTTTAATTACCCTTTGTTTATTTGTTGTTTACCTTGGGTTTGATAACAATTCAAATTCTGACATCGTATTTTATGGACATAAAACACCAAAGAGCGTTGAGATATATCTTTCTGAA > NZ_CP025268/1534622‑1534890 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |