| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 2,026,646 | A→G | *246* (TAA→TAG) | fliP → | flagellar type III secretion system pore protein FliP |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 2,026,646 | 0 | A | G | 99.7% | 2448.8 / NA | 701 | *246* (TAA→TAG) | fliP | flagellar type III secretion system pore protein FliP |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (345/354); minor base T (1/1); total (346/355) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 715 total aligned reads displayed.
GCCAGCGTGTTGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAAAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCACGC > NZ_CP025268/2026509‑2026782 | aGCGTGTTGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAgg > 1:3787897/1‑140 (MQ=255) gCGTGTTGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGc > 1:3606735/1‑140 (MQ=255) gCGTGTTGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGc > 2:4897917/1‑140 (MQ=255) gCGTGTTGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGc > 2:1465153/1‑140 (MQ=255) cGTGTTGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCa > 1:4807930/1‑140 (MQ=255) cGTGTTGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCa > 1:10907661/1‑140 (MQ=255) ttGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCGCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAAt < 1:8045617/140‑1 (MQ=255) ttGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAAt < 2:7077147/140‑1 (MQ=255) tggATGGCATTGGGGATGATGATTGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAAt < 2:6869785/138‑1 (MQ=255) gagggCATTGGGGATGCTGCTGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAACCTGATGCTGTTTGTACGGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGa < 1:9693330/137‑1 (MQ=255) ggCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGacac < 2:5090415/140‑1 (MQ=255) gCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCGGTTGGTACTGGTGGAGGGCTGGCAACTGCTGGGCGGTTCGCTGGCGCAGAGCGTTTACAGCTAGAGAGGCAAATTGACAcc > 1:4975928/1‑140 (MQ=255) cATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCt > 1:6189440/1‑140 (MQ=255) cATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCt > 1:10626835/1‑140 (MQ=255) aTTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCAGTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCACTTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAATTGACACCTg > 2:5312148/1‑140 (MQ=255) tGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGaa < 2:9300886/140‑1 (MQ=255) tGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGaa < 1:8874947/140‑1 (MQ=255) tGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTGTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTAGAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGaa > 1:7636941/1‑140 (MQ=255) ggggATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAAt < 1:452408/140‑1 (MQ=255) ggggATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTATAAACTGATGCTGATTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAAt < 1:10200768/140‑1 (MQ=255) atgatgatgGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGt < 1:2734090/140‑1 (MQ=255) tgatgatgGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGGTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTc > 1:5173475/1‑140 (MQ=255) gatgatgGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCa > 1:5292120/1‑140 (MQ=255) tgatgGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTGTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGGTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCatg < 2:8647100/140‑1 (MQ=255) tgatgGGTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCatg < 1:4619465/140‑1 (MQ=255) tgGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGACTCGGTCatgatg > 2:2102005/1‑140 (MQ=255) gTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCatgatgat < 1:9804428/140‑1 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2:3340972/1‑140 (MQ=255) ttGCTCTGCCCTTTAAAGTGATGCGGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTATATCAGCTAGATAGGCTAAATGACACCTGACTCGGTCTTGCGGCGGGGGACTGATGCGATg > 2:2739391/1‑140 (MQ=255) ctctGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGaaa > 2:3684833/1‑140 (MQ=255) ctctGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGaaa > 1:7500454/1‑140 (MQ=255) ctGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCTCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCTACATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGt < 2:7634829/140‑1 (MQ=255) ctGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGt > 1:417612/1‑140 (MQ=255) cccTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTcgc < 2:10286122/140‑1 (MQ=255) cTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCgcgc < 1:2601903/140‑1 (MQ=255) tttAAACTGATGCTGTGTGGACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGACGCGATGAAAGTCGCGCt > 2:1778324/1‑140 (MQ=255) tAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTgg < 2:7196046/140‑1 (MQ=255) tAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTgg > 2:6098571/1‑140 (MQ=255) tAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCAGGCAATTGATGGTCGGTTAGCAGGCGCAGAGATTTTAAAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTgg > 1:2267691/1‑140 (MQ=255) tAAACTGATGCGGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCGGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTGACAGCTAGAGAGGCACAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTgg < 2:3474357/140‑1 (MQ=255) tGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTg > 1:3401114/1‑140 (MQ=255) gTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGccc < 2:11153249/140‑1 (MQ=255) tttGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGcccc > 1:9398260/1‑140 (MQ=255) tttGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGcccc > 1:8707282/1‑140 (MQ=255) tttGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGcccc > 1:7759742/1‑140 (MQ=255) ttGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCg < 1:641681/140‑1 (MQ=255) ttGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCg < 2:9729117/140‑1 (MQ=255) ttGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCg < 1:7051707/140‑1 (MQ=255) ttGTACTGGTGGATGGCAGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCg < 2:10742610/140‑1 (MQ=255) tACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTa > 1:389158/1‑140 (MQ=255) aCTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAt < 1:1048950/140‑1 (MQ=255) ggtggATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCCGAGCGTTTACAGCTAGAGAGGCAATATGACACCTGATGCGGGCATGAGGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGAACTGGCTGCCCCGcgagtgg > 2:3869325/1‑134 (MQ=255) ggtggAAGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGATCTTTTACAGCTATATACGAAAAATGACACCTGAATCGCTCATGATGAAGAGGACTGAAGCGATGAAAGACTCGCTCGCACAGGCTGCACCGCTAtagg > 2:11277669/1‑137 (MQ=255) gtggATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt > 2:2964330/1‑140 (MQ=255) tggATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCNCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgttg < 1:5968798/140‑1 (MQ=255) tggATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATTAAAGTCTCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgttg > 2:8196565/1‑140 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ggcAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTg > 1:6805728/1‑140 (MQ=255) ggcAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTg > 1:1712198/1‑140 (MQ=255) ggcAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTGTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTCTTGTTGGTAGCGTTg > 2:5728190/1‑140 (MQ=255) gcAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAATATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAGTGTTGGTAGCGTTgg > 2:3166949/1‑140 (MQ=255) aTTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCa < 2:647238/140‑1 (MQ=255) aTTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCa < 1:1465153/140‑1 (MQ=255) aTTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCa < 2:3984099/140‑1 (MQ=255) aTTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCa < 1:4055430/140‑1 (MQ=255) aTTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACAGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCa < 2:2468870/140‑1 (MQ=255) ttGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCAc < 2:2379262/140‑1 (MQ=255) tGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGc < 2:9522302/140‑1 (MQ=255) tCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCtt < 1:2144135/140‑1 (MQ=255) tCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCtt < 1:7230900/140‑1 (MQ=255) tCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCtt < 1:9087316/140‑1 (MQ=255) ttCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTatca > 1:11118245/1‑140 (MQ=255) ttCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTatca > 1:5473595/1‑140 (MQ=255) tCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGTCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTatcat < 2:7954544/140‑1 (MQ=255) tCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTatcat < 2:8923982/140‑1 (MQ=255) tCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTatcat < 2:9875112/140‑1 (MQ=255) tCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTatcat < 2:5434794/140‑1 (MQ=255) tCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTatcat < 2:1200840/140‑1 (MQ=255) gCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTAtcatca < 1:1911327/140‑1 (MQ=255) ggCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTa < 1:5615790/140‑1 (MQ=255) agCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCa > 1:2503273/1‑140 (MQ=255) cAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCa < 1:7869035/140‑1 (MQ=255) aGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc < 2:8473460/140‑1 (MQ=255) gCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCACg < 1:2863540/140‑1 (MQ=255) gCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCACg < 2:415279/140‑1 (MQ=255) | GCCAGCGTGTTGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAAAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCACGC > NZ_CP025268/2026509‑2026782 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |