| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 3,188,274 | A→G | T63T (ACA→ACG) | CXP41_RS16625 → | fimbrial biogenesis outer membrane usher protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 3,188,274 | 0 | A | G | 99.4% | 1812.2 / NA | 525 | T63T (ACA→ACG) | CXP41_RS16625 | fimbrial biogenesis outer membrane usher protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); major base G (224/297); minor base T (1/2); total (226/299) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 525 total aligned reads displayed.
GCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACACCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTCAGCAAAACCTGATCGATGGTTGTT > NZ_CP025268/3188137‑3188410 | gCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGcc < 1:9628309/140‑1 (MQ=255)gCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGcc > 1:2518036/1‑140 (MQ=255) tATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAAt < 1:4981378/140‑1 (MQ=255) tATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTGAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAAt < 2:2297716/140‑1 (MQ=255) tGCCGTTGAATTCAACAAAGTTTGAATCGAAGCCGCAGATCGTGAAAACGTTAACCTGTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATGACCCGTCGGCAAAGAGTCACTCAGCCCTCTGATTAATCATAAGAGGACGCCAATcc < 2:7385075/140‑1 (MQ=255) gCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCa < 1:3273759/140‑1 (MQ=255) cGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGCTCGTTAAATCGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCAAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCAcc < 2:9648128/140‑1 (MQ=255) cGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCAcc < 1:6530184/140‑1 (MQ=255) cGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCAcc > 2:8349885/1‑140 (MQ=255) ttGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCtt > 2:1259820/1‑140 (MQ=255) ttGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCtt > 1:2866871/1‑140 (MQ=255) ttGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCtt < 1:818839/140‑1 (MQ=255) tGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTg > 1:10653930/1‑140 (MQ=255) tGAAGTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGGCGGCACATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCGTg > 1:9441798/1‑140 (MQ=255) gAATTCAACTAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCTATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGa < 2:4715408/140‑1 (MQ=255) aaTTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGAc < 2:5915665/140‑1 (MQ=255) aTTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGAcc < 2:7136234/140‑1 (MQ=255) aacaaAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCa < 1:536203/140‑1 (MQ=255) acacAGATTTAAACGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGATAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAAGTACCCGTCGGCAAAGATTCACAAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATACACCTTGACCTCaaa < 2:3944775/140‑1 (MQ=255) acaaAGTTTTCATGGAAGACGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAACCACTCTGCGTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCaa < 2:2897982/140‑1 (MQ=255) acaaAGATTTAATCGAAGCCGAATATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCaa < 2:9708893/140‑1 (MQ=255) acaaAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATGTTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCaa < 1:4235448/140‑1 (MQ=255) acaaAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCTCTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCaa < 2:431925/140‑1 (MQ=255) acaaAGATTTAATCGAAGCAGAAGATCGTGAAAACGTTAACATATCCCAAATTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCaa < 2:8566397/140‑1 (MQ=255) caaAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCaag > 1:7919615/1‑139 (MQ=255) caaAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAAt > 2:6458816/1‑140 (MQ=255) caaAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTGTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAGTCCACCTTGACCTCCAAt < 2:301341/140‑1 (MQ=255) aaaGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATg < 1:3036956/140‑1 (MQ=255) aaaGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATg < 1:11305716/140‑1 (MQ=255) aaaGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATg < 2:9008894/140‑1 (MQ=255) aGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATggg < 1:750119/140‑1 (MQ=255) aGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACACGTCGGCAAATATTCACTAAGAACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCAAATCCACCTTGACCTCCAATgtg > 2:6342052/1‑138 (MQ=255) tttAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTAt < 2:7247110/140‑1 (MQ=255) tCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAAtt < 1:4677895/140‑1 (MQ=255) gCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATaa < 1:5184043/140‑1 (MQ=255) gAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCa < 1:10051294/140‑1 (MQ=255) taGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCTATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGTACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCaa < 1:10593925/139‑1 (MQ=255) cGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGc > 1:6763867/1‑140 (MQ=255) cGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGc > 1:1092691/1‑140 (MQ=255) tGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAg > 2:11326482/1‑140 (MQ=255) tGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAg > 1:2360367/1‑140 (MQ=255) tGAAAACGTTAACATTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTCATAATAAGAGGACGCCACTCCACCTTGACCTCCAAGAGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAg > 1:5938946/1‑140 (MQ=255) cgatAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCg < 1:8554449/137‑1 (MQ=255) cGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTGGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCg < 2:845893/140‑1 (MQ=255) gTTAACCTTTCCCACTTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGAGAACCAAACTGCAGTTTGCGt < 2:3261837/140‑1 (MQ=255) ttAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAATCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTg > 1:6168699/1‑140 (MQ=255) tttCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCa < 2:9407033/140‑1 (MQ=255) tgtCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCa < 2:7000560/138‑1 (MQ=255) tCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCaga > 2:3853355/1‑140 (MQ=255) tCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCaga < 2:496413/140‑1 (MQ=255) cccTATTTGAAACTGAGGGCCAATTACCAGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTTCGTGACACCagag < 2:10572586/140‑1 (MQ=255) cccAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCagag < 1:10976161/140‑1 (MQ=255) cccAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCagag > 2:2162789/1‑140 (MQ=255) tttGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAAtt > 1:3680799/1‑140 (MQ=255) ttGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTa > 1:10419837/1‑140 (MQ=255) tGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTaa < 1:2629314/140‑1 (MQ=255) tGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACACAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCGCCAATGGGTATTAATTGATAACCAACCTGCAGGTTGCGTGACACCAGAGCAATTaa < 2:3072862/140‑1 (MQ=255) gAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAAc < 1:9305343/140‑1 (MQ=255) aTGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACAttatta > 2:7760657/1‑140 (MQ=255) aTTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTa < 2:2518533/140‑1 (MQ=255) aCCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTa < 1:9809233/137‑1 (MQ=255) tAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACt < 1:10750675/140‑1 (MQ=255) aaGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTc > 1:4121535/1‑140 (MQ=255) agaaCTCTGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATAAATTGATAACCAAAATGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTCa > 2:1794204/4‑140 (MQ=255) ctGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTCAGCaaaa > 2:1531540/1‑140 (MQ=255) tGATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTGTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTCAGCAAAAc < 2:4121199/140‑1 (MQ=255) gATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTCAGCAAAAcc > 2:9199001/1‑140 (MQ=255) gATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTCAGCAAAAcc > 1:6360471/1‑140 (MQ=255) gATTAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACAGTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTCAGCAAAAcc > 2:10155272/1‑140 (MQ=255) ttAATAATAAGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTCAGCAAAACCTg < 1:4532491/140‑1 (MQ=255) aataataaGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTCATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTCAGCAAAACCTGAt > 2:6844899/1‑140 (MQ=255) aataataaGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTCAGCAAAACCTGAt > 1:8901980/1‑140 (MQ=255) aataataaGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTCAGCAAAACCTGAt > 1:4355737/1‑140 (MQ=255) tcctaaGAGGACGACAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTCAGCAAAACCTGATCg < 2:8053850/137‑1 (MQ=255) taataaGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTCAGCAAAACCTGATCg > 1:7739651/1‑140 (MQ=255) taataaGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTCAGCAAAACCTGATCg > 1:5489085/1‑140 (MQ=255) aaataaGAGCACGCCAATCCACCATGACCACCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTCAGCAAAACCTGATCg < 1:7390661/139‑1 (MQ=255) aataaGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTCAGCAAAACCTGATCGa < 2:5563305/140‑1 (MQ=255) aataaGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTCAGCAAAACCTGATCGa < 1:4082695/140‑1 (MQ=255) aataaGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTCAGCAAAACCTGATCGa > 1:5670164/1‑140 (MQ=255) aataaGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTCAGCAAAACCTGATCGa > 1:9075885/1‑140 (MQ=255) aataaGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTCAGCAAAACCTGATCGa > 2:1978740/1‑140 (MQ=255) aataaGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAAGGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTCAGCAAAACCTGATCGa < 1:1339499/140‑1 (MQ=255) ctaaGAGGACGCCAATCCAACTTGAACTACAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGAAGTTTGCGTGAAACCAGAGCAAATAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTCAGAAAAACCTGATCGAt < 2:5345183/139‑1 (MQ=255) ataaGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTCAGCAAAACCTGATCGAt < 1:7012235/140‑1 (MQ=255) ataaGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTCAGCAAAACCTGATCGAt < 1:1851890/140‑1 (MQ=255) ataaGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTCAGCAAAACCTGATCGAt < 1:3538738/140‑1 (MQ=255) ataaGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTCAGCAAAACCTGATCGAt < 1:2162789/140‑1 (MQ=255) ataaGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTGTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTCAGCAAAACCTGATCGAt < 2:5756133/140‑1 (MQ=255) ataaGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCAAATGGGTATTACTTGAGAACCAAACTGCAGGTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTCAGCAAAACCTGATCGAt < 2:6207558/140‑1 (MQ=255) taaGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTCAGCAAAACCTGATCGATg < 1:7223231/140‑1 (MQ=255) taaGAGGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTCAGCAAAACCTGATCGATg > 2:1724539/1‑140 (MQ=255) agagGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTTATAAACAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGTATTTAATGATGAATTTATTGAAAAAACTCAGAAAAACCTGATCGAAGgt > 2:10922870/1‑140 (MQ=255) agagGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTCAGCAAAACCTGATCGATGgt < 2:10745726/140‑1 (MQ=255) agagGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTCAGCAAAACCTGATCGATGgt > 1:1637810/1‑140 (MQ=255) agagGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTCAGCAAAACCTGATCGATGgt > 2:281496/1‑140 (MQ=255) agagGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTCAGCAAAACCTGATCGATGgt > 1:9183938/1‑140 (MQ=255) agagGACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTCAGCAAAACCTGATCGATGgt > 2:4466406/1‑140 (MQ=255) agagGACACCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTCAGCAAAACCTGATCGATGgt > 2:7610904/1‑140 (MQ=255) gACGCCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTCAGCAAAACCTGATCGATGgttgtt > 2:610285/1‑140 (MQ=255) | GCTTATGCCGTTGAATTCAACAAAGATTTAATCGAAGCCGAAGATCGTGAAAACGTTAACCTTTCCCAATTTGAAACTGATGGCCAATTACCCGTCGGCAAATATTCACTAAGCACTCTGATTAATAATAAGAGGACACCAATCCACCTTGACCTCCAATGGGTATTAATTGATAACCAAACTGCAGTTTGCGTGACACCAGAGCAATTAACATTATTAGGATTTACTGATGAATTTATTGAAAAAACTCAGCAAAACCTGATCGATGGTTGTT > NZ_CP025268/3188137‑3188410 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |