| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 3,915,245 | A→G | C115R (TGT→CGT) | glmS ← | glutamine‑‑fructose‑6‑phosphate transaminase (isomerizing) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 3,915,245 | 0 | A | G | 99.9% | 3734.2 / NA | 1073 | C115R (TGT→CGT) | glmS | glutamine‑‑fructose‑6‑phosphate transaminase (isomerizing) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (580/491); minor base T (0/1); total (581/492) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.59e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 1088 total aligned reads displayed.
CACTGTACCGTACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACACGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGTCGCCCAGCGAGTGTGAGCAAT > NZ_CP025268/3915108‑3915380 | cACTGTACCGTACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCAcgcg > 2:7321768/1‑140 (MQ=255) aCTGTACCGTACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACgcgc > 2:2821848/1‑140 (MQ=255) aCTGTACCGTACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACgcgc > 1:4352923/1‑140 (MQ=255) cTGTACCGTACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTCTAGCCACgcgcg > 1:9141974/1‑139 (MQ=255) gTACCGTACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCttt < 1:4866430/140‑1 (MQ=255) gTACCGTACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCttt < 1:3583031/140‑1 (MQ=255) tACCGTACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCtttt > 1:4722854/1‑140 (MQ=255) cGTACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGc > 1:7745774/1‑140 (MQ=255) cGTACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGc < 2:10933088/140‑1 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCACTCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGctc > 2:717365/1‑140 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGctc > 2:10014108/1‑140 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGctc > 1:60740/1‑140 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGctc > 1:9566261/1‑140 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGctc > 1:4607321/1‑140 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGctc > 1:344814/1‑140 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGctc > 1:323785/1‑140 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGctc > 2:4350521/1‑140 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGctc > 2:3186645/1‑140 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGctc > 1:6609202/1‑140 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGctc > 2:5577367/1‑140 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGctc > 1:7546840/1‑140 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGctc > 1:1521743/1‑140 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGctc > 2:5727911/1‑140 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGctc > 1:11108689/1‑140 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGctc > 1:7893470/1‑140 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGctc > 1:10018145/1‑140 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCGTTTAGctc > 1:2269989/1‑140 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACACGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGTAACGAAGGTATAGCCACGCGCTGTTAGctc > 2:3764405/1‑140 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGAGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGACCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGctc > 2:10306450/1‑140 (MQ=255) cGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCtt > 1:5584842/1‑140 (MQ=255) accacGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCAc > 1:8506626/1‑140 (MQ=255) accacGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCAc > 1:8803577/1‑140 (MQ=255) accacGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCAc > 1:2715058/1‑140 (MQ=255) accacGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCAc > 2:6369719/1‑140 (MQ=255) ccacGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACg < 1:5441137/140‑1 (MQ=255) cacGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGc > 1:9379605/1‑140 (MQ=255) acGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGcg > 2:8319830/1‑139 (MQ=255) acGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCa > 2:11295791/1‑140 (MQ=255) cGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAg > 2:9485626/1‑140 (MQ=255) gCAGCTGCGGGATAGCACGCTGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGACACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTGAGCTCTTCACGCAGc > 2:5042769/1‑140 (MQ=255) aGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCCCTTTTAGCTCTTCAAGCAGCgg > 1:4075106/1‑140 (MQ=255) cGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCAt > 1:4476992/1‑140 (MQ=255) cGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCAt < 1:1671291/140‑1 (MQ=255) ggATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATgg > 2:201492/1‑140 (MQ=255) aTAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGCTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGtt < 1:6862198/140‑1 (MQ=255) gCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTc > 1:9776540/1‑140 (MQ=255) cACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCg > 2:9676587/1‑140 (MQ=255) cGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTGTTCgat > 2:6034318/1‑140 (MQ=255) gCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCgatg < 1:6263435/140‑1 (MQ=255) cAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCgatga < 2:6164891/140‑1 (MQ=255) aGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCgatgat > 2:3422382/1‑140 (MQ=255) gaccGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGatgatg < 1:10338730/137‑1 (MQ=255) gAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGatgatg < 1:10866649/140‑1 (MQ=255) aaCGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGc > 2:1405958/1‑140 (MQ=255) aaCGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCACAGTTCACAAGAAGGTCAATCACTTCGGTGTCGGATTCAGAAACGAAGTTATAGCCACGCGCTTTGAGATATTCTCGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGc > 2:8539042/1‑140 (MQ=255) ggCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGt > 2:4019094/1‑140 (MQ=255) ccTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTa > 1:8322908/1‑140 (MQ=255) ccTCACGCAGAGGCCCGCCTAGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGAGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTa < 2:5297420/140‑1 (MQ=255) tCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATg < 1:10514424/140‑1 (MQ=255) tCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATg < 1:10119891/140‑1 (MQ=255) tCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGACGATGCCGTTATg < 1:9899712/140‑1 (MQ=255) aCGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGca < 2:8053551/140‑1 (MQ=255) aCGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGca < 2:9021380/140‑1 (MQ=255) aCGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGca < 2:1613065/140‑1 (MQ=255) gagTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGcaccacc < 1:8185580/140‑1 (MQ=255) agTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGcaccacca > 2:2939114/1‑140 (MQ=255) agTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGcaccacca > 2:1270172/1‑140 (MQ=255) tCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACcaca > 1:5017797/1‑140 (MQ=255) tCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACcaca < 2:9198716/140‑1 (MQ=255) tCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACcaca < 1:4241287/140‑1 (MQ=255) ccGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAAt < 1:7116128/140‑1 (MQ=255) ccGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAAt > 1:3886112/1‑140 (MQ=255) ccGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAAt < 1:2491194/140‑1 (MQ=255) cTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGACACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGATATGCACCACCACAATgtgt > 2:7592864/1‑140 (MQ=255) tGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTGTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTAGGCACCACCAGCATGTGTTc > 1:6376608/1‑140 (MQ=255) tttCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAg > 1:5821012/1‑140 (MQ=255) tttCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGGTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTAACGCCGCGGGTCATGGTTTTCGATGATGACGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAg > 2:7746253/1‑140 (MQ=255) ccAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCg < 2:6728827/140‑1 (MQ=255) aGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGa > 1:7313675/1‑140 (MQ=255) tCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATgc < 2:8822683/140‑1 (MQ=255) tCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATgc < 1:1895552/140‑1 (MQ=255) ccAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCa < 1:5695037/140‑1 (MQ=255) aTGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAAt < 2:4257710/111‑1 (MQ=255) gggCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACt > 2:1055396/1‑140 (MQ=255) aTCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGa < 2:11145708/140‑1 (MQ=255) cTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGt < 1:2122987/140‑1 (MQ=255) cTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGt < 1:1214984/140‑1 (MQ=255) cTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGt < 1:2876262/140‑1 (MQ=255) gtgtCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCAcc > 1:5251939/1‑140 (MQ=255) gtCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGt < 2:693182/140‑1 (MQ=255) gTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGATCTTTTAGCTCTTGACGCAGCGGTTCTTGGTTTTTGATGATGCCGTTTTGCACGACGTCAATGTGTTCAGAAACATGCGGTTGCGCATTCTCTTCTGAAGGTTCTACGTGGGt < 2:10186078/140‑1 (MQ=255) cAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGTCGcc < 1:309835/140‑1 (MQ=255) aaaCGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGTCGCCCAg < 1:1367079/140‑1 (MQ=255) aaCGACGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCACTTCACGCAGCGGGACATGGTTTTCGCTGATGCCGTTATGCACCACCACCATGTGTTCAGAAACATGCGGAGGCGCATTCACTTCGGAAGGTTCACCGTGGGTCGCCCAGc < 2:3584480/140‑1 (MQ=255) aaCGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGTCGCCCAGc < 2:4688746/140‑1 (MQ=255) aaGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGTCGCCCAGCGAgt < 1:10696271/140‑1 (MQ=255) aaGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGTCGCCCAGCGAgt < 2:1831788/140‑1 (MQ=255) aaGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGTCGCCCAGCGAgt < 2:2310044/140‑1 (MQ=255) ataGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGTCGCCCAGCGAGTGTGAg < 2:2590646/140‑1 (MQ=255) ccACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGTCGCCCAGCGAGTGTGAGCAAt < 2:4888508/140‑1 (MQ=255) | CACTGTACCGTACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACACGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGTCGCCCAGCGAGTGTGAGCAAT > NZ_CP025268/3915108‑3915380 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |