| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 3,922,869 | T→C | *80* (TAA→TAG) | atpE ← | F0F1 ATP synthase subunit C |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 3,922,869 | 0 | T | C | 99.2% | 2878.8 / NA | 834 | *80* (TAA→TAG) | atpE | F0F1 ATP synthase subunit C |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (408/418); minor base A (7/0); total (416/418) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.43e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 838 total aligned reads displayed.
TACGTACTTCATGCAGAACAGAACGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTATTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTACGCAGCAGAGGAATCAGATCAGGTTGACGCGCTGCGCCTTCCAG > NZ_CP025268/3922733‑3923003 | aCGTACTTCATGCAGAACAGAACGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTAcg < 2:1626236/140‑1 (MQ=255) aCGTACTTCATGCAGAACAGAACGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTAcg < 2:3311822/140‑1 (MQ=255) ttCATGCAGAACAGAACGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAg > 2:9635530/1‑140 (MQ=255) ttCATGCAGAACAGAACGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAg > 1:3328261/1‑140 (MQ=255) tCATGCAGAACAGAACGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTCTTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACGACGCGACAGc > 2:6755098/1‑140 (MQ=255) aTGCAGAACAGAACGCACACGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGa < 1:10018885/140‑1 (MQ=255) aTGCAGAACAGAACGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCTTTAAGATTCACCGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGa < 2:1309542/140‑1 (MQ=255) aTGCAGAACAGAACGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGa > 2:6178816/1‑140 (MQ=255) aTGCAGAACAGAACGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGa < 1:9697294/140‑1 (MQ=255) aTGCAGAACAGAACGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGa < 1:9082305/140‑1 (MQ=255) aTGCAGAACAGAACGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGa < 2:10445705/140‑1 (MQ=255) aTGCAGAACAGAACGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGa < 1:6921349/140‑1 (MQ=255) aTGCAGAACAGAACGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGa < 2:9364371/140‑1 (MQ=255) tGCAGAACAGAACGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGaa > 1:3012699/1‑140 (MQ=255) tGCAGAACAGAACGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGaa > 2:820146/1‑140 (MQ=255) tGCAGAACAGAACGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGaa > 1:8457207/1‑140 (MQ=255) tGCAGAACAGAACGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGaa > 1:8669068/1‑140 (MQ=255) tGCAGAACAGAACGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGaa > 2:6405806/1‑140 (MQ=255) tGCAGAACAGAACGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGAGATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGac > 2:3951971/1‑139 (MQ=255) agaacagaacGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACAt < 1:4605864/140‑1 (MQ=255) gaacagaacGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATc < 1:762744/140‑1 (MQ=255) aacagaacGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCa > 1:5432821/1‑140 (MQ=255) aacagaacGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCa > 1:11149497/1‑140 (MQ=255) acagaacGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCAc > 1:7055097/1‑140 (MQ=255) gatcgaacAGGACAATCGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTa < 2:9129234/137‑1 (MQ=255) gaacgaacAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTa < 2:3608354/140‑1 (MQ=255) aacgaacAGGACAAACGCTATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGAGTCACAGCACAATGCCTCTATTAATTAAACGTTCTGATAATGCTCTTTAAATACAAGCAACGCTAAATAAGCGACCGCGAACATCACGTAc > 2:7469161/1‑140 (MQ=255) aacgaacAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTCAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTAc > 2:496009/1‑140 (MQ=255) aacgaacAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTAc > 1:9199682/1‑140 (MQ=255) aacgaacAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTAc > 2:6645286/1‑140 (MQ=255) aacgaacAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTAc > 2:4205288/1‑140 (MQ=255) aacgaacAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAAGAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTAc > 2:4682684/1‑140 (MQ=255) acAGGACCAACGCGAGGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTGAAGCTTCACAGCACACTGCCTCAATTTAGTTACCGATCTGATATTGCTCATAAAATACAAGCAACGCTTACAACGCGACACCGAACAGCCCGTAcagacc < 2:4554222/140‑1 (MQ=255) acAGGACATACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTAcagacc < 2:3776465/140‑1 (MQ=255) acAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTAcagacc < 1:10419799/140‑1 (MQ=255) acAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTAcagacc > 1:279259/1‑140 (MQ=255) acAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTAcagacc < 1:10765304/140‑1 (MQ=255) acAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTAcagacc < 1:8955817/140‑1 (MQ=255) aGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTAcagaccca > 1:2188790/1‑140 (MQ=255) ggACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTAcagacccag > 1:3211497/1‑140 (MQ=255) aCGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGACCATCACGTCCAGACCCAGACCtcc > 2:7291737/1‑138 (MQ=255) aCGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTa < 2:5822781/125‑1 (MQ=255) aCGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTAc > 1:44585/1‑140 (MQ=255) aCGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTAc > 1:3845791/1‑140 (MQ=255) gcgATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATTCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAg < 2:10648783/140‑1 (MQ=255) gcgATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAg < 1:1712156/140‑1 (MQ=255) gcgATGGCCTGGCAGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAg < 2:9749338/140‑1 (MQ=255) gagggcctggcaGAGGATTGTTGCTTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTACTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCTAACATCACGTACAGACCCATACCTACAGCg < 2:9488260/137‑1 (MQ=255) aTGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGa > 1:4732610/1‑140 (MQ=255) cctggccGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGatcat < 1:9870971/140‑1 (MQ=255) cctggccGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGatcat < 1:2015410/140‑1 (MQ=255) ggccGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTGTTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCgg > 2:10808541/1‑140 (MQ=255) ccGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGa < 1:9460946/140‑1 (MQ=255) ggATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTATATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGCTAGc > 2:4791821/1‑140 (MQ=255) ggATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGc > 1:804216/1‑140 (MQ=255) ggATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGc > 2:1716455/1‑140 (MQ=255) gATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCa < 1:243021/140‑1 (MQ=255) gATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCa < 1:5211205/140‑1 (MQ=255) gttgCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATcca > 1:11295934/1‑140 (MQ=255) ttgCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATccac < 1:6068942/140‑1 (MQ=255) ttgCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATccac < 2:7728802/140‑1 (MQ=255) ttgCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATccac < 2:5338878/140‑1 (MQ=255) ttAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGAc > 1:352438/1‑140 (MQ=255) aaGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGAccc > 1:5864517/1‑140 (MQ=255) gATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCAt < 2:2111214/140‑1 (MQ=255) ttCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTACCGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATaa < 1:8240526/140‑1 (MQ=255) ttCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATaa < 2:3139577/140‑1 (MQ=255) ttCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATaa < 2:8971795/140‑1 (MQ=255) ttCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATaa < 1:6533899/140‑1 (MQ=255) ttCACAGCACAATGCATCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATATAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATaa < 2:8347864/140‑1 (MQ=255) cacaGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACg > 1:7477042/1‑140 (MQ=255) cacaATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATATAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATaaa < 1:8858270/140‑1 (MQ=255) caATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGa < 2:11019569/140‑1 (MQ=255) caATGCCTCTATTGAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGa < 1:10183498/140‑1 (MQ=255) tGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGCCAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACt < 1:7853550/140‑1 (MQ=255) tGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACt > 1:7162607/1‑140 (MQ=255) tGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACt > 2:2756268/1‑140 (MQ=255) tGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCAGAACGATAAAGAACt > 1:1882038/1‑140 (MQ=255) ctATTTAGTTACCGTTCTGATATTGCTCTTTATATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACATACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGCCCGAGAACGAGAAAGAACTgtgtc > 2:8062550/1‑139 (MQ=255) ctATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTa < 1:729017/140‑1 (MQ=255) ctATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTa < 2:2390982/140‑1 (MQ=255) aTTTAGTTAACGTTCTGATATTTCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTACg < 2:8698789/140‑1 (MQ=255) aTTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTACg < 1:8131095/140‑1 (MQ=255) tttAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACTGCGAACATCACGTACAGACCCTGACCGACAGCGATAATAGGGATAGCATCGACCACAACCTTAAAGGTAAGGGACTGAGTACgc > 2:10913618/1‑140 (MQ=255) tttAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATACAGAACTGAGTACgc > 2:7147545/1‑140 (MQ=255) ttAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTACgca < 2:4297932/140‑1 (MQ=255) gTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTACgcagca > 2:258058/1‑140 (MQ=255) gTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTACgcagca < 2:1154448/140‑1 (MQ=255) ttAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTACGcagcag > 1:10909468/1‑140 (MQ=255) tAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTACGCAGCaga < 1:4855731/140‑1 (MQ=255) aCGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTACGCAGCAGAgg > 1:1474479/1‑140 (MQ=255) ctctTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTACGCAGCAGAGGAATCAGATCAGGtt > 1:6337295/1‑140 (MQ=255) ctcaTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGTATAGCATCCACCATACCCAAAACGATAAAGAACTGAGTACGCAGCAGAGGAATCAGATCAGGtt > 2:5122004/1‑140 (MQ=255) ctTTAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTACGCAGCAGAGGAATCAGATCAGGTTGa > 1:10676921/1‑140 (MQ=255) ttAAATAAAAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTACGCAGCAGAGGAATCAGATCAGGGTGAcg > 2:10301486/1‑140 (MQ=255) taaataaaAGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTACGCAGCAGAGGAATCAGATCAGGTTGAcgc > 1:4166359/1‑140 (MQ=255) aaaGCAACGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTACGCAGCAGAGGAATCAGATCAGGTTGACGCGCTgcg < 2:1963509/140‑1 (MQ=255) aaaGCAACGCGTACTACGCGACAGCGACCATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTACGCAGCAGAGGAATCAGATCAGGTTGACGCGCTgcg < 1:6698097/140‑1 (MQ=255) aCGCTTACTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTACGCAGCAGAGGAATCAGATCAGGTTGACGCGCTGCGCCTTcc > 2:3040947/1‑140 (MQ=255) cGCTTACTCCGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCCTCGGGATAGCTTCCACCAGACCCATAACGTTCATGAACTGAGTACGCAGCAGAGGAATCGGATCAGGTTGACGCGCTGCGGCGTcct > 2:6949464/1‑139 (MQ=255) | TACGTACTTCATGCAGAACAGAACGAACAGGACAAACGCGATGGCCTGGCCGAGGATTGTTGCGTTAAGATTCACAGCACAATGCCTCTATTTAGTTAACGTTCTGATATTGCTCTTTAAATAAAAGCAACGCTTATTACGCGACAGCGAACATCACGTACAGACCCAGACCTACAGCGATCATCGGGATAGCATCCACCAGACCCATAACGATAAAGAACTGAGTACGCAGCAGAGGAATCAGATCAGGTTGACGCGCTGCGCCTTCCAG > NZ_CP025268/3922733‑3923003 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |