| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 4,396,984 | T→C | G331G (GGT→GGC) | nnr → | bifunctional ADP‑dependent NAD(P)H‑hydrate dehydratase/NAD(P)H‑hydrate epimerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 4,396,984 | 0 | T | C | 99.9% | 2717.3 / NA | 774 | G331G (GGT→GGC) | nnr | bifunctional ADP‑dependent NAD(P)H‑hydrate dehydratase/NAD(P)H‑hydrate epimerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (527/246); minor base A (1/0); total (528/246) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 774 total aligned reads displayed.
AGTACTGACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGTCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCACGCCGCATCCT > NZ_CP025268/4396849‑4397119 | aGTACTGACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGTTGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGc > 1:578723/1‑140 (MQ=255)aGTACTGACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGc > 1:9891006/1‑140 (MQ=255)aGTACTGACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGc > 2:5914579/1‑140 (MQ=255)aGTACTGACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGc > 1:2539408/1‑140 (MQ=255)aGTACTGACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAAATGACTATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGTCCAGc > 2:8612194/1‑140 (MQ=255) gTACTGACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCa > 2:4307247/1‑140 (MQ=255) aCTGACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAAGTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAag < 1:9991767/140‑1 (MQ=255) gACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGt > 1:522743/1‑140 (MQ=255) gACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGt > 2:5588765/1‑140 (MQ=255) gACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGt > 1:1408588/1‑140 (MQ=255) gACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGt > 2:2308296/1‑140 (MQ=255) cccGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTgg > 1:797160/1‑140 (MQ=255) ccGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTggg > 2:10170730/1‑140 (MQ=255) cAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTTCCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGa > 2:8428277/1‑140 (MQ=255) gTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCCGCCAGAGTGGGGGaat > 1:9358840/1‑139 (MQ=255) tGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGACTGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGaaaa > 2:8325152/1‑140 (MQ=255) tGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGaaaa < 2:7099230/140‑1 (MQ=255) aaaaCATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGaaaaaa > 2:1996638/1‑140 (MQ=255) aaCATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGc < 1:4054195/140‑1 (MQ=255) accttGCGCCGCTGCTGACTGCACGCCCGGCATTGATGGTGCATGAACTGACGAAGGACTCTCGTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGAGTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAACAAGCa < 2:10880869/137‑1 (MQ=255) aCATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCa < 1:3322275/140‑1 (MQ=255) gcgcCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAATAAGCACTGCa > 1:9045563/1‑140 (MQ=255) gcgcCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCa > 1:1486418/1‑140 (MQ=255) gcgcCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCa > 2:1836322/1‑140 (MQ=255) gcgcCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCa > 1:5586628/1‑140 (MQ=255) gcgcCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCa > 2:4432744/1‑140 (MQ=255) gccgcTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCaaa < 1:7772383/140‑1 (MQ=255) gccgcGGCGGACCGCCCGACCGGCCGGGATGGTGCATGCACTGCCGAGGGACTCGCTTACCGAAAGCCGGGAAGCGGCCGATGTGGTGGTGATTGGGCCCGGTCTGGGCCAGCACGAGTGGGGGACACAAGCACTGCaaa < 2:3976594/140‑1 (MQ=255) ctgctgACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCCAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGt > 2:8945215/1‑140 (MQ=255) ctgctgACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGt > 2:3614304/1‑140 (MQ=255) ctgctgACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACAGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGGCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAACAAgg > 2:8732889/1‑139 (MQ=255) tGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAAtt > 2:1548738/1‑140 (MQ=255) tGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAAtt > 2:4805784/1‑140 (MQ=255) cACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAAtttt > 2:6805855/1‑140 (MQ=255) cACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAAtttt > 1:4530396/1‑140 (MQ=255) gcGACCGGACTTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGACAGCCTGGAATGGGCCGAGGTGGTGGTGAGTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCACGAGTGGGGGAACAAAGCACTGCACATAGGTGAGAATGTTc > 2:5421689/2‑140 (MQ=255) aCGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTc > 1:2266247/1‑140 (MQ=255) cGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCg < 2:636577/140‑1 (MQ=255) gACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGc > 1:972811/1‑140 (MQ=255) ggAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAAc < 1:3883281/140‑1 (MQ=255) ggAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATCGGCCGATGGGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAAc < 1:5006381/140‑1 (MQ=255) aaTTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCg < 1:11304267/140‑1 (MQ=255) aaTTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCg < 1:4223321/140‑1 (MQ=255) aTTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGa > 2:2505909/1‑140 (MQ=255) gATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGAtgt > 2:3204308/1‑140 (MQ=255) gATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGAtgt > 1:8358604/1‑140 (MQ=255) gCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTggg > 2:9738193/1‑140 (MQ=255) gCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTggg > 1:6504778/1‑140 (MQ=255) gCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTggg > 1:2807305/1‑140 (MQ=255) gCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTggg > 1:1894991/1‑140 (MQ=255) gCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGAGGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGACTTTTCGCAAACCGAGGTTGTggg > 2:5722721/1‑140 (MQ=255) aaCTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCACAAAGTTGAGAATTTTCGCAAAGCGATGTTGTGGGATGcc > 2:7341901/1‑140 (MQ=255) aaCTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCGGGACTGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTTGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGcc < 2:3843028/140‑1 (MQ=255) aCTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCg < 2:7888374/140‑1 (MQ=255) cTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGa < 1:10126352/140‑1 (MQ=255) gACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATg > 1:10662635/1‑140 (MQ=255) gACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATg > 1:11110466/1‑140 (MQ=255) gACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATg > 1:5407150/1‑140 (MQ=255) gACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATg > 1:7884649/1‑140 (MQ=255) cGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCa > 1:1754488/1‑140 (MQ=255) tGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTg < 1:4671825/140‑1 (MQ=255) ctctctTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAAcc < 1:7232108/140‑1 (MQ=255) ctctTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAAc < 2:10573641/137‑1 (MQ=255) ctctTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAAc > 1:10573641/1‑137 (MQ=255) ctctTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACctg > 2:115015/1‑140 (MQ=255) ccGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGca > 2:6509486/1‑140 (MQ=255) gAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaat < 1:6094695/140‑1 (MQ=255) gAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaat < 1:10926416/140‑1 (MQ=255) aaaGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaatc > 1:7477293/1‑140 (MQ=255) aGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGACAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaatcaa > 2:1340467/1‑140 (MQ=255) aGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaatcaa > 1:9563381/1‑140 (MQ=255) aGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaatcaa > 2:3436708/1‑140 (MQ=255) aGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaatcaa > 2:11109555/1‑140 (MQ=255) aGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaatcaa > 1:8135881/1‑140 (MQ=255) aGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaatcaa > 2:41061/1‑140 (MQ=255) aGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaatcaa > 2:8131364/1‑140 (MQ=255) aGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaatcaa > 1:3465118/1‑140 (MQ=255) aGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaatcaa > 1:4334175/1‑140 (MQ=255) ccTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCaatcaatc < 2:1701762/140‑1 (MQ=255) ctGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATa < 1:1641206/139‑1 (MQ=255) ggCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCg < 2:10669030/104‑1 (MQ=255) gATGTGGTTGTGATTGGTCCCGGTCGGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTca < 1:10026541/140‑1 (MQ=255) gATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTca < 2:2920972/140‑1 (MQ=255) tgtgGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTcaca > 1:7327427/1‑140 (MQ=255) tgtgGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTcaca < 1:3045897/140‑1 (MQ=255) tgtgGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTcaca < 1:8844995/140‑1 (MQ=255) aTTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTg > 2:2706140/1‑55 (MQ=255) aTTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGAt > 1:8529963/1‑140 (MQ=255) tGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAGAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGAGGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCa > 1:10350326/1‑140 (MQ=255) tGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCa > 1:241849/1‑140 (MQ=255) gTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCAcg > 2:617732/1‑140 (MQ=255) gTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCAcg > 2:9622317/1‑140 (MQ=255) tCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCAcgc > 1:8742483/1‑140 (MQ=255) tCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCAcgc > 1:6948578/1‑140 (MQ=255) tCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCAcgc > 2:5180442/1‑140 (MQ=255) ccGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCAcgccg > 1:213254/1‑140 (MQ=255) ccGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCAcgccg < 1:7643705/140‑1 (MQ=255) gTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCACGCCGCAt > 2:4892408/1‑140 (MQ=255) gTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCACGCCGCAt > 2:10413573/1‑140 (MQ=255) gTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAAATATCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCACGCCGCAt < 1:3725738/140‑1 (MQ=255) | AGTACTGACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGTCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGTTGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCACGCCGCATCCT > NZ_CP025268/4396849‑4397119 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |