| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NZ_CP025268 | 479,384 | T→C | *125* (TAA→TAG) | tomB ← | Hha toxicity modulator TomB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_CP025268 | 479,384 | 0 | T | C | 99.8% | 1581.6 / NA | 456 | *125* (TAA→TAG) | tomB | Hha toxicity modulator TomB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (187/268); minor base A (1/0); total (188/268) | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 456 total aligned reads displayed.
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TATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTTTAACAAGATAAACTCGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCC > NZ_CP025268/479247‑479519 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |