Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 3,728,808 | (C)10→8 | pseudogene (1254‑1255/1457 nt) | xylB ← | xylulokinase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 3,728,800 | 0 | C | . | 89.5% | 417.0 / 50.1 | 117 | pseudogene (1263/1457 nt) | xylB | xylulokinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (12/0); new base . (52/50); total (65/52) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.05e-03 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | NZ_CP025268 | 3,728,801 | 0 | C | . | 88.5% | 325.9 / 80.0 | 117 | pseudogene (1262/1457 nt) | xylB | xylulokinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/3); major base . (44/48); minor base T (12/0); total (65/52) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.63e-04 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
GGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACATCCCCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCAATCAACGTAACACTTTGCGGTTTAATACCGCAGGCATGCACGACATCCA > NZ_CP025268/3728661‑3728933 || ggCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACATc < 2:11182452/140‑1 (MQ=255) ggCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACATc < 2:2341569/140‑1 (MQ=255) ggCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACATc < 1:1260145/140‑1 (MQ=255) cTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGTTTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACATccc < 2:2691225/140‑1 (MQ=255) cTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACATccc < 2:3350683/140‑1 (MQ=255) cTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACATccc < 2:3541208/140‑1 (MQ=255) cTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACATccc < 2:3540758/140‑1 (MQ=255) tGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACATcccc > 1:1500748/1‑140 (MQ=255) aaGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAGgcgccccc > 1:3332933/1‑140 (MQ=255) cGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACATccccccccgta < 2:3556922/140‑4 (MQ=255) cGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACATccccccccggt > 2:3240190/1‑137 (MQ=255) ggCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACGTgccgccccggtg > 2:1759004/1‑136 (MQ=255) ggCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACATccccccccgtac < 1:2032084/140‑5 (MQ=255) ggCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACATccccccccgtac < 2:5398742/140‑5 (MQ=255) gCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACATccccccccgtacg < 1:8792837/140‑6 (MQ=255) cATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGAGCTGGCCCCACATccccccccggacgg > 2:6750232/1‑134 (MQ=255) cGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATc < 1:4334190/140‑1 (MQ=255) cgcATCAGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGAGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAGTCGAggg > 2:2213665/1‑138 (MQ=255) gcATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAgctg < 1:1560896/140‑1 (MQ=255) cTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGa < 1:1575497/140‑1 (MQ=255) tAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGc < 1:2359414/140‑1 (MQ=255) tGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACATccccccccg > 2:10528666/1‑111 (MQ=255) tGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACATccccccccg < 1:10528667/112‑2 (MQ=255) tGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGGACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGat > 2:6462231/1‑140 (MQ=255) cGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCAC‑‑CTCCCCCCCCGTGCGGTAGTGGGGCTGCGGGCCGCTGattt > 1:9674043/1‑138 (MQ=255) aCTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCGAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTATTCGAGCTGCGGACCGCTGTTGTcc > 2:8448749/1‑140 (MQ=255) aCTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAAGCGAGCTGCTGGCCGCTGAGATcc > 2:6634381/1‑140 (MQ=255) aCTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACA‑‑GCCCCCCCCGTAGGGGAAGCGAGCTGCTGGCCGCTGAGATcc > 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aCGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAg < 1:4104537/136‑1 (MQ=255) cGGTTGTTGCGGCAACAATTCTATGAGCGATTTCTCTGGATTCGACGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCGAGTGCGGGCCCCACAT‑‑CCCCCACCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATGCGCCAGCATCt < 2:1953045/140‑1 (MQ=255) cGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGCTCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCt < 2:6364988/140‑1 (MQ=255) cGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCt < 1:5591762/140‑1 (MQ=255) cGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCt < 1:3343713/140‑1 (MQ=255) cGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGGGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCt < 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caaTTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACA‑‑GCCCCCCCCGTACGGTAAGCGCGCTGGTGGCCGCTGATAGACGCCAGCATCTGTCGCCAGGACTCAc > 2:2356736/1‑140 (MQ=255) tGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CGCCCCCCGTAGGGGAGTCGCGCTGCTGAGGGCTGTTTTCCGCCAGGCGGTGTCGCCAGTACGCACTTCGcgcc > 1:5534252/1‑140 (MQ=255) gAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGcgccc < 2:3645478/140‑1 (MQ=255) gAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGcgccc < 1:5707737/140‑1 (MQ=255) gCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCGCCCCCGTACGGTACTCGGGCTGCTGACCGGGGAGTTGCGCCCGCTTGTGTGGGCAGTACTCGCTACGcgccccg > 2:7946319/1‑140 (MQ=255) gCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTACTCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCCGCATCGGACGCCCGTCCTCACTACGcgccccg > 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tctGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCAAt < 1:3974874/140‑1 (MQ=255) tctGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCAAt < 1:2501527/140‑1 (MQ=255) tctGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCAAt < 1:2114193/140‑1 (MQ=255) tctGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCAAt < 1:11063922/140‑1 (MQ=255) tctGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCAAt < 1:10747846/140‑1 (MQ=255) tctGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCAAt < 1:10385710/140‑1 (MQ=255) tctGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGACCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGACCCGCCCCCAAt < 2:9168847/140‑1 (MQ=255) ctGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACA‑GCCCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCAAt < 2:3139851/140‑1 (MQ=255) gccgcGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCG‑CCCCAATCAACGTAaca > 1:9415964/1‑140 (MQ=255) ccgcGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACATccc < 2:2124617/48‑1 (MQ=255) ccgcGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑GCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCGGATATCCGCCAGCATCTGACGCCCGGACTCACTACGCGCCCCGCCCCCATTCACCGGAacc > 2:6009535/1‑139 (MQ=255) ttCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGTCGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCAATCAACGTAACACTTTg < 2:412538/139‑1 (MQ=255) aTCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCAATCAACGTAACACTTTg < 1:8837345/140‑1 (MQ=255) cTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCAATCAACGTAACACTTTGCg < 1:4571349/140‑1 (MQ=255) tGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTGATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCTTCGGGCGCCCGTCCGCACTACGCGCCCCGCCCCCAAGCGACGTAACACTTTGCgg > 1:10021907/1‑140 (MQ=255) ccTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTCCTCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCCGCATCTGACGCCAGTACTCCATACGCGCCCCGCCGCCAAGCTACGGGCCACGTTGCGGGTtactac > 2:7871949/1‑140 (MQ=255) ccTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGTGCTGCGGACCGCTGATATCCGCCCGCATCTGACGCCCGTAGTCACGACGCGCCCCGCCCCCAATCAACGGAACACTTTGCGGTTTAATag > 2:6653556/1‑139 (MQ=255) ccTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCCCTCAACGGAACAATGTGCGGTTTAATAc > 2:2160947/1‑140 (MQ=255) ccTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGGAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCCTCTGGCGCCGGTACTCACGACGCGCCCCGCCCCCCATCAACGGGACCCGTTGCGGGTTAAGAc > 2:1862737/1‑140 (MQ=255) gctgcGCCCAGTGCTGGCCCCAC‑‑CTCCCCCCCCGTACGGTAATCGCGCTGCTGACCGCGGATTGCCGCCAGCAGCTGACGCCAGTACGCACTACGCGCCCCGCCCCCAATCAACGTCACACTGTGCGGGTGAATACCGCa > 2:7287880/1‑140 (MQ=255) ctgcGCCCAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCAATCAACGTAACACTTTGCGGTTTAATACCGCAg < 2:4832109/140‑1 (MQ=255) cccAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGATGACCGCTGTTATCCGCCAGCATATGACGCCAGTAATAAATACGCGCCCCGCCCCCAATCAACGTAACTCTTTGCGGTGTAATACCGCAGGCATg > 2:11404738/1‑140 (MQ=255) cccAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGGCATCGAGCTGCTGCCCGGTGGTATCCGCCAGCATCTGGCGCCAGTACTCTCTACGCGCCCCGCCCCCCGTCAGCGTGACACTTTGCGGGGTAATACCGCGGGCATg > 1:4309214/1‑140 (MQ=255) cccAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGGAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCGGACGCCAGTGCTCACTGCGCGCCCCGCCCCCAATCAACGGAACACGTGGCGGTGTAATACCGCAGGCATg > 1:2890846/1‑140 (MQ=255) cAGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCAATCAACGTAACACTTTGCGGTTTAATACCGCAGGCATGCa < 1:795663/140‑1 (MQ=255) aGTGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCCGCATCTGACGCCCGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCAATCCACGTCGCACTTTGCGGTGTAATACCGCAGGCAAGCAc > 2:4891760/1‑140 (MQ=255) aGTGCTGGCCCCAC‑‑GGCCCCCCCCGGCCGGGACTCGAGCGGCTGACCGCGGAGATCCGCCCGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCAATCAACGGAACCCTGTGCGGTTGTATACCGCCGGCATGCAc > 1:3256492/1‑140 (MQ=255) tGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCGCGTACGCACTACGCGCCCCTCCCCCAATCAACGGAACACGTTGAGGTTTAATACGGCAGGCATGCACGa > 2:4026088/1‑140 (MQ=255) tGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCAATCAACGTAACACTTTGCGGTTTAATACCGCAGGCATGCACGa < 1:9442579/140‑1 (MQ=255) tGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGAGATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCTATCAACGTCACACTTTGCGGGTTGATACCGCAGGGATGCCCgg > 1:2835916/1‑139 (MQ=255) tGCTGGCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCGGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGGACGCACTCCGCGCCCCGCCCCCAAGCAACGTAACACTGTGCGGTTTAATCGCGCGGGCAGGCACgc > 2:2587868/1‑139 (MQ=255) gCCCCACAT‑‑CCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCAATCAACGTAACTCTTTGCGGTTTAATACCGCAGGCGTGCACGACATcg > 1:9184848/1‑139 (MQ=255) cccACAT‑CCCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCAATCAACGTAACACTTTGCGGTTTAATACCGCAGGCATGCACGACATCCa < 1:4856802/140‑1 (MQ=255) || GGCTGATAAGCGGCATAACGCTGCGCATCTGGTAGATGCGACTGTTCTAACGGTAGTTGCGGCAACAATTCAATGAGCGATTTCTCTGGATTCGCCGCGATCTGCGCCAGCCTTGCTGCGCCCAGTGCTGGCCCCACATCCCCCCCCCCGTACGGTAATCGAGCTGCTGACCGCTGATATCCGCCAGCATCTGACGCCAGTACTCACTACGCGCCCCGCCCCCAATCAACGTAACACTTTGCGGTTTAATACCGCAGGCATGCACGACATCCA > NZ_CP025268/3728661‑3728933 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |