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Read alignment evidence... | |||||||||||
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Only 100 of 1471 total aligned reads displayed.
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2:11072961/1‑120 (MQ=255) gttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCGTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GA‑AAA‑A‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACg > 1:3902019/1‑140 (MQ=255) ttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGACACCATTCGAGGAA‑GA‑AAA‑A‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCAGGTAAATCCCATGTTTACCGGGCTAGTGAAATCTACGt < 2:5040109/140‑1 (MQ=255) ttgtACTAAAAATCGATGATTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GA‑AAA‑A‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGt < 1:3645055/140‑1 (MQ=255) gtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GA‑AAA‑A‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAACTCTACGTAt < 1:1563345/140‑1 (MQ=255) aCTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GA‑AAA‑A‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATgg < 2:7378330/140‑1 (MQ=255) 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|
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |