Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 1,146,507 | +T | pseudogene (1028/1643 nt) | flgK → | flagellar hook‑associated protein FlgK |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 1,146,507 | 1 | . | T | 98.5% | 2037.9 / 15.2 | 547 | pseudogene (1028/1643 nt) | flgK | flagellar hook‑associated protein FlgK |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (3/5); new base T (232/304); total (235/312) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 595 total aligned reads displayed.
ACGCTTGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GG‑GACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGAT > NZ_CP025268/1146368‑1146639 | cGCTTGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑ggt > 2:5409839/1‑139 (MQ=255) cGCTTGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑ggt < 2:4578593/140‑2 (MQ=255) cGCTTGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑ggt > 1:11419053/1‑139 (MQ=255) cGCTTGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCGATCGGTAAGCCCGCGGGTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑ggt < 2:1130998/140‑2 (MQ=255) cGCTTGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATGTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑ggt < 1:8389542/140‑2 (MQ=255) gACACCTGTCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTGCAACACCCAACACCAGGCCGGAGTTGAGGCTCACGGCGATGGCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTTAGCGCGCGGGTCTGCAAAACGCGAAATAGAAA‑GGTGACGtt > 2:302343/1‑140 (MQ=255) gACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTCAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGACAAACAAA‑GGTGACGtt > 2:9360938/1‑140 (MQ=255) gACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGtt > 1:3115517/1‑140 (MQ=255) gACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGtt > 1:3208021/1‑140 (MQ=255) gACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGtt < 1:912266/140‑1 (MQ=255) gACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGtt < 1:4615423/140‑1 (MQ=255) gACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGtt > 2:8657200/1‑140 (MQ=255) aCAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTg < 2:121982/140‑1 (MQ=255) aCAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTg < 2:1048536/140‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCCACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGAt < 2:8111948/140‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGAt < 1:3584987/140‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCATTCAACACCCAACCCAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATGTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGAt < 1:5221166/140‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGGCATGTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGAt < 2:7366793/140‑1 (MQ=255) tGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATc < 2:4005092/140‑1 (MQ=255) tGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATGTCTTTGATATCGGTAAGCCCGCGGTGCTGCAAAACCGGAAAAACAAT‑GGTGACGTTGCGATc > 2:422399/1‑140 (MQ=255) ggCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTGACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCg > 1:9415459/1‑140 (MQ=255) ggCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCg > 1:2673130/1‑140 (MQ=255) cgcTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCTAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGt < 2:10783498/140‑1 (MQ=255) cgcTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGt < 1:4683264/140‑1 (MQ=255) cTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACTCCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAATACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGc > 1:5517844/1‑140 (MQ=255) cTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGc > 2:3311698/1‑140 (MQ=255) cTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGc > 1:7242643/1‑140 (MQ=255) ggCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGccc > 1:2586688/1‑139 (MQ=255) ggCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCa > 1:619734/1‑140 (MQ=255) ggCATGTGCCGAGGCTTTCAACACCCACCACACAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTGTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCa < 2:511680/140‑1 (MQ=255) cATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACg < 2:5512396/140‑1 (MQ=255) tGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTaa > 1:10390326/1‑140 (MQ=255) aGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAGGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTTCCACGGTAACTGAt > 1:9258023/1‑140 (MQ=255) aGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGAt < 2:1937609/140‑1 (MQ=255) gCTTTCAACACCCACCACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGc < 1:2097116/140‑1 (MQ=255) gCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTCAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGc > 1:7138159/1‑140 (MQ=255) gCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGc < 2:6933725/140‑1 (MQ=255) gCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGGTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGc < 2:562594/140‑1 (MQ=255) ttCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTc > 1:2964318/1‑140 (MQ=255) cAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCcg < 1:5676254/140‑1 (MQ=255) cAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCcg < 1:6797972/140‑1 (MQ=255) cAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCcg < 1:3450984/140‑1 (MQ=255) acacCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCcgcg < 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aaCACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTg > 1:1820183/1‑140 (MQ=255) acacAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTgg > 2:173322/1‑140 (MQ=255) acacAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCATTGCTATCGTTAAGCACGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTgg > 2:9519632/1‑140 (MQ=255) aaaGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGAc < 1:8557003/140‑1 (MQ=255) aaGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACa < 1:6467802/140‑1 (MQ=255) aGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAg > 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aTTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACa < 2:482238/140‑1 (MQ=255) cttaCGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGAGATCGGTAAGCGAGCGGTTCTGCAAATCACGAAAAACACA‑GGTTACGTTGCGATCGGTTCAACGGTAACTGATGCCTCAGCGGTACTGGCGACTGATTTCAAAATCTCg < 2:6465077/137‑1 (MQ=255) tAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGt > 1:5805200/1‑140 (MQ=255) aaCGGCGATGCCGGTTAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGTCGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGtt < 2:1107798/140‑1 (MQ=255) aaCGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGtt < 2:10182021/140‑1 (MQ=255) aaCGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGtt < 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ccGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATaataat < 2:3552145/140‑1 (MQ=255) ccGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTATGCAAAACTCGAACATCAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGACACGGTAAATGATGCCTACGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCTTTCGATaataat < 2:2197513/140‑1 (MQ=255) cGGTGAAGATTTCTTTGCTCTCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATc < 2:7083211/140‑1 (MQ=255) aTTTCGTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAg < 1:977529/140‑1 (MQ=255) tGCTATCGGTAAGCCCGCGTTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCAccc > 1:7537568/1‑140 (MQ=255) tATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGcc > 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1:7832401/1‑140 (MQ=255) gcgGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATAc < 2:7937188/140‑1 (MQ=255) cgGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATAcc > 1:9980553/1‑140 (MQ=255) cgGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATAcc > 1:1524202/1‑140 (MQ=255) cgGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATAcc > 1:4230002/1‑140 (MQ=255) cgGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATAcc > 1:8740727/1‑140 (MQ=255) 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2:8863150/1‑140 (MQ=255) gAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGc < 2:4697357/140‑1 (MQ=255) aCAAA‑GGTGACGTTGCGATCTGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATTATCAGTGGAAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGAt < 1:1953465/140‑1 (MQ=255) | ACGCTTGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GG‑GACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGAT > NZ_CP025268/1146368‑1146639 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |