| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 1,215,634 | +C | pseudogene (402/405 nt) | tfaP → | tail fiber assembly protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 1,215,634 | 1 | . | C | 98.9% | 2426.9 / 15.0 | 717 | pseudogene (402/405 nt) | tfaP | tail fiber assembly protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (5/3); new base C (411/296); total (418/299) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 745 total aligned reads displayed.
GGCAGGGTAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCTTACGCCTCCGGCA‑GTT‑AGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGTTGAATCAGA > NZ_CP025268/1215495‑1215767 | ggCAGGGTAAGGCTGCCTTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑Gtt < 2:4784334/140‑1 (MQ=255) ggTAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCCGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑Gttcaggc > 1:8062173/1‑135 (MQ=255) aGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGa > 1:9921061/1‑140 (MQ=255) ggCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGAt > 2:3144346/1‑140 (MQ=255) gCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACa < 1:6733855/140‑1 (MQ=255) cATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGTATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACAt > 2:8189868/1‑140 (MQ=255) cATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACAt > 1:8620261/1‑140 (MQ=255) aTTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATc < 2:2426492/140‑1 (MQ=255) aTTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATGATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATc < 2:7109886/140‑1 (MQ=255) ttGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATcc > 2:6222333/1‑140 (MQ=255) gAAGACTTAAAGAAGCTGAGCTGACACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGgcg < 1:161558/140‑1 (MQ=17) gAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATTATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGgcg < 1:4580639/140‑1 (MQ=255) gAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGgcg < 2:7798355/140‑1 (MQ=255) gAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGgcg < 2:5187520/140‑1 (MQ=255) gAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGgcg < 2:10496116/140‑1 (MQ=255) gAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGgcg < 1:4268156/140‑1 (MQ=255) gAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGgcg < 1:5352248/140‑1 (MQ=255) gAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACAACCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCACATGACATCCGgcg < 2:5311291/140‑1 (MQ=18) aGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGcgcg < 2:11303352/140‑1 (MQ=255) gACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACACTATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCgg < 1:8258683/140‑1 (MQ=255) aCTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGt > 2:493692/1‑140 (MQ=255) aCTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACAGCCGGCGCGGt > 1:8908684/1‑140 (MQ=255) cTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATCTTGTATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTg > 1:6434817/1‑140 (MQ=17) cTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTg < 1:5656372/140‑1 (MQ=255) aagaagATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTgg > 2:7479459/1‑140 (MQ=255) agaagaTGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGt < 2:10316171/140‑1 (MQ=255) gaTGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTctct > 1:6953181/1‑140 (MQ=255) gaTGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCt > 2:3395595/1‑140 (MQ=255) gaTGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCt > 2:7963571/1‑140 (MQ=255) gaTGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGGGCTGGTATCt > 1:10875001/1‑140 (MQ=255) aTGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTg < 1:7903336/140‑1 (MQ=255) tGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGt > 2:10765493/1‑140 (MQ=255) gCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGc < 1:2249219/140‑1 (MQ=255) aaaCAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTTGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCGAGAGATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCT‑GTTCAGGCCAGATGACTGCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTc > 2:11012422/1‑140 (MQ=14) aaCAATATAATTTGTGGCTGGAGTATCTGGCAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGTATGGCCTACGCCTCCGGCAGGTC‑AGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCa < 2:2870965/140‑1 (MQ=14) aCAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCAc < 2:3933430/140‑1 (MQ=255) aCAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCAc < 1:1346511/140‑1 (MQ=255) atatAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACcgc > 2:9458433/1‑140 (MQ=255) tataATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACcgcg > 2:8492828/1‑140 (MQ=255) ataATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCCCTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACTCCTCCGGCAGGTC‑AGGCCAGATGACCTCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGt > 2:5876657/1‑140 (MQ=11) ataATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGt < 2:1252216/140‑1 (MQ=255) ataATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGt < 2:2647167/140‑1 (MQ=255) ataATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGt < 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ggCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAAt > 1:10283418/1‑140 (MQ=255) cTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGGGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGAt > 1:2535024/1‑88 (MQ=14) gATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGc > 1:11320823/1‑140 (MQ=255) gATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCCACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGc > 1:5849260/1‑140 (MQ=255) gATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATAGTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGc > 1:5009009/1‑140 (MQ=255) aTTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCCCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGca < 2:5675536/140‑1 (MQ=255) ttATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGcac < 2:8995039/140‑1 (MQ=255) ttATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGcac < 1:2728435/140‑1 (MQ=255) ttATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGcac < 1:7342811/140‑1 (MQ=255) ttATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGcac < 2:7655274/140‑1 (MQ=255) ttATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGcac < 1:6553513/140‑1 (MQ=255) aTCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAg > 2:4258910/1‑140 (MQ=255) tCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTGCGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGc > 1:8482964/1‑140 (MQ=255) tCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGc > 2:3710106/1‑140 (MQ=255) ggAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGtt < 2:9078429/140‑1 (MQ=255) tcACTGGAACTGGTTGATACATCCTGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTAAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGt < 1:7626855/139‑1 (MQ=11) cTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTg > 2:7215480/1‑140 (MQ=255) 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ccAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAAGGTAATCCAGCTCAGCGTTAAGTCAGGTTGTTTCTGCGTGCGTcg > 2:9722410/1‑139 (MQ=14) tGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGtt > 2:1547303/1‑110 (MQ=0) tGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGttt > 2:4534813/1‑140 (MQ=255) tGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGttt > 1:1993320/1‑140 (MQ=255) cAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTc > 1:2852157/1‑140 (MQ=255) cAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTc > 1:9466853/1‑140 (MQ=255) atTGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGcc > 2:5533157/1‑140 (MQ=255) tGAATGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCCGTTTACGTCCGGCCTg > 2:4411242/1‑140 (MQ=255) aaTGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCa > 2:2015445/1‑140 (MQ=255) aTGGCCTACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCaa > 2:2255165/1‑140 (MQ=255) gcctACGCCTCCGGCA‑GTTCNGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGGTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTGGTTNCTGCCTGNGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAAttt > 1:5976741/4‑140 (MQ=17) gcctACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAAttt > 1:3123318/4‑140 (MQ=255) gcctACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGGAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAAttt > 2:6033650/4‑140 (MQ=255) cctACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTc > 1:9747791/3‑140 (MQ=255) cctACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTc > 1:3946873/3‑140 (MQ=255) cctACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGATGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGGTAAGTCTGGTTGTTTCTGACTGCGTCAGATTACGTCCGGCCTGCAATTTc > 2:6578347/3‑140 (MQ=17) tACGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAg < 1:8826618/140‑1 (MQ=255) aCGCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCTCAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGt < 2:1825540/140‑1 (MQ=255) gCCTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGTTg > 2:10011112/1‑140 (MQ=255) cTCCGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGTTGaa > 1:10386918/1‑140 (MQ=255) cGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGTTGAATCa > 2:8393297/1‑140 (MQ=255) cGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGTTGAATCa > 1:10016952/1‑140 (MQ=255) cGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTGGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGTTGAATCa > 1:9327933/1‑140 (MQ=255) cGGCA‑GTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGGTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGGTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGTTGAATCa > 1:11158384/1‑140 (MQ=255) | GGCAGGGTAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCTTACGCCTCCGGCA‑GTT‑AGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGTTGAATCAGA > NZ_CP025268/1215495‑1215767 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |