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gATATCATTATTAATGACAGGGAATCCGTGCTCTCTTAGA‑A‑CTTGAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAGCATTTCAGGCGTTATGCTTTCTTATTATGTCCGCAATATCAg < 2:5922009/140‑1 (MQ=255) gATATCATTATTAATGACAGGGAATCCGTGCTCTCTTAGA‑A‑CTTGAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAGCATTTCAGGCGTTATGCTTTCTTATTATGTCCGCAATATCAg < 1:159513/140‑1 (MQ=255) tatCATTATTAATGACAGGGAATCCGTGCTCTCTTAGA‑A‑CTTGAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAGCATTTCAGGCGTTATGCTTTCTTATTATGTCCGCAATATCAGgt < 1:5637078/140‑1 (MQ=255) tatCATTATTAATGACAGGGAATCCGTGCTCTCTTAGA‑A‑CTTGAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTAACACCATGCTGATGCAAAGTGAGCATTTCAGGCGTTATGCTTTCTTATTATGTCCGCAATATCAGgt > 1:5097160/1‑140 (MQ=255) atCATTATTAATGACAGGGAATCCGTGCTCTCTTAGA‑A‑CTTGAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAGCATTTCAGGCGTTATGCTTTCTTATTATGTCCGCAATATCAGgtg > 1:815660/1‑140 (MQ=255) attaATGACAGGGAATCCGTGCTCTCTTAGA‑A‑CTTGAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAGCATTTCAGGCGTTATGCTTTCTTATTATGTCCGCAATATCAGGTGTCAAGa > 1:8838301/1‑140 (MQ=255) ttaATGACAGTGAATCCGTGCTATCTTAGA‑A‑CTTGAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAGCATTTCAGGCGTTATGCTTTCTTATTATGTCCGCAATATCAGGTGTCAAGaa < 1:5257818/140‑1 (MQ=255) ttaATGACAGGGAATCCGTGCTCTCTTAGA‑A‑CTTGAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAGCATTTCAGGCGTTATGCTTTCTTATTATGTCCGCAATATCAGGTGTCAAGaa < 2:5308436/140‑1 (MQ=255) aTGACAGGGACTCCGTGCTCTCTTAGA‑A‑CTTGAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACGATGCTGATGCAAAGTGAGCATTTCAGGCGTTTTGCTTTCTTATTATGTCCGCAATATCAGGTGTCATGAATgg < 1:10425659/140‑1 (MQ=255) tGACAGGGAATCCGTGCTCTCTTAGA‑A‑CTTGAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAGCATTTCAGGCGTTATGCTTTCTTATTATGTCCGCAATATCAGGTGTCAAGAATGga < 2:1354798/140‑1 (MQ=255) gggACTCCGTGCTCTCTTAGA‑A‑CTTGAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAGCATTTCAGGCGTTATGCTTTCTTATTATGTCCGCAATATCAGGTGTCAAGAATGGAGAGtt < 1:380793/140‑1 (MQ=255) aaTCCGTGCTCTCTTAGA‑A‑CTTGAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAGCATTTCAGGCGTTATGCTTTCTTATTATGTCCGCAATATCAGGTGTCAAGAATGGAGAGTtctc < 2:6973655/140‑1 (MQ=255) aTCCGTGCTCTCTTAGA‑A‑CTTGAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAGCATTTCAGGCGTTATGCTTTCTTATTATGTCCGCAATATCAGGTGTCAAGAATGGAGAGTTCTCg < 1:4259904/140‑1 (MQ=255) aTCCGTGCTCTCTTAGA‑A‑CTTGAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAGCATTTCAGGCGTTATGCTTTCTTATTATGTCCGCAATATCAGGTGTCAAGAATGGAGAGTTCTCg < 1:3209480/140‑1 (MQ=255) aTCCGTGCTCTCTTAGA‑A‑CTTGAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAGCATTTCAGGCGTTATGCTTTCTTATTATGTCCGCAATATCAGGTGTCAAGAATGGAGAGTTCTCg < 2:5114401/140‑1 (MQ=255) aTCCGTGCTCTCTTAGA‑A‑CTTGAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAGCATTTCAGGCGTTATGCTTTCTTATTATGTCCGCAATATCAGGTGTCAAGAATGGAGAGTTCTCg < 2:2578091/140‑1 (MQ=255) || TCAGGCTTTACGCTTGCGTTTAAAAGATGAAACCAGTGTGATTCTTTCTGATCTCTATCTGCAAATATTGCAGTACATTGAAATGCATAAGACTACACTAACGGATATCATTATTAATGACAGGGAATCCGTGCTCTCTT‑‑A‑A‑CTTGAGTAAGGTTTTAGAATAAACATCAGCTGTATCACCATGCTGATGCAAAGTGAGCATTTCAGGCGTTATGCTTTCTTATTATGTCCGCAATATCAGGTGTCAAGAATGGAGAGTTCTCGCTCTCCATTCTTGAC > NZ_CP025268/1223955‑1224233 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |