Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 3,239,247 | (T)6→7 | intergenic (+264/‑18) | ygjR → / → alx | Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase/TerC family membrane protein Alx |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 3,239,241 | 1 | . | T | 95.7% | 1927.7 / 68.3 | 569 | intergenic (+258/‑24) | ygjR/alx | Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase/TerC family membrane protein Alx |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (16/8); new base T (206/332); total (222/347) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.00e-03 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.53e-01 |
Only 100 of 649 total aligned reads displayed.
TGTGTGAAAAAACACATCCGGTCACCGGGCAACCCGAAAGGAATACGCAGACGTATTCCTTTTTTGTTGTAAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑G‑T‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGTTGTTGCAGGGGCGTCGTGGGGCACATGCCATGACC > NZ_CP025268/3239102‑3239375 | gtgtgAAAAAACACATCCGGTCACCGGGCAACCCGAAAGGAATACGCAGACGTATTCCTTTTTTGTTGTAAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑G‑t > 1:3128086/1‑140 (MQ=255) tgtgACAATACACATCCGGTCACCGGGCAACCCGAAAGGAATACGCAGACGTATTCCTTTTGTGTTGGTAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCGCTGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTGGGCC‑G‑t‑t > 2:10668357/1‑140 (MQ=255) tgtgAAAAAACACCTCCGGTCACCGGGCACCCCGAAAGGAATACGCAGACGTATTCCTTTGGTGGGGTAAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTAGGCATCAATAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGGTGGCC‑G‑t‑t > 2:7686231/1‑140 (MQ=255) tgtgAAAAAACACATCCGGTCACCGGGCAACCCGAAAGGAATACGCAGACGTATTCCTTTTTTGTTGTAAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCTGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑G‑t‑t > 2:1151749/1‑140 (MQ=255) tgtgAAAAAACACATCCGGTCACCGGGCAACCCGAAAGGAATACGCAGACGTATTCCTTTTTTGTTGTAAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑G‑t‑t < 2:4309351/140‑1 (MQ=255) tgtgAAAAAACACATCCGGTCACCGGGCAACCCGAAAGGAATACGCAGACGTATTCCTTTTTTGTTGTAAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑G‑t‑t > 1:2974211/1‑140 (MQ=255) tgtgAAAAAACACATCCGGTCACCGGGCAACCCGAAAGGAATACGCAGACGTATTCCTTTTTTGTTGTAAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑G‑t‑t > 2:7052132/1‑140 (MQ=255) tgtgAAAAAACACATCCGGTCACCGGGCAACCCGAAAGGAATACGCAGACGTATTCCTTTTTTGTTGTAAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑G‑t‑t > 1:2117367/1‑140 (MQ=255) tgtgAAAAAACACATCCGGTCACCGGGCAACCCGAAAGGAATACGCAGACGTATTCCTTTTTTGTTGTAAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑G‑t‑t > 1:9239582/1‑140 (MQ=255) gtgAAAAAACACATCCGGTCACCGGGCAACCCGAAAGGAATACGCAGACGTATTCCTTTTTTGTTGTAAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑G‑t‑t‑t > 2:4656955/1‑140 (MQ=255) tgAAAAAACACATCCGGTCACCGGGCAACCCGAAAGGAATACGCAGACGTATTCCTTTTTTGTTGTAAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑G‑t‑t‑t‑t > 1:2523797/1‑140 (MQ=255) aaaaaCACATCCGGTCACCGGGCAACCCGAAAGGAATACGCAGACGTATTCCTTTTTTGTTGTAAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑G‑t‑t‑t‑t‑t‑tt < 1:1528895/140‑2 (MQ=255) caTCCGGTCACCGGGCAACCCGAAAGGAATACGCAGACGTATTCCTTTTTTGTTGTAAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTa < 2:2236080/140‑1 (MQ=255) caTCCGGTCACCGGGCAACCCGAAAGGAATACGCAGACGTATTCCTTTTTTGTTGTAAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTa > 1:11358293/1‑140 (MQ=255) caTCCGGTCACCGGGCAACCCGAAAGGAATACGCAGACGTATTCCTTTTTTGTTGTAAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTa > 1:7120763/1‑140 (MQ=255) ggTCACCGGGCAACCCGAAAGGAATACGCAGACGTATTCCTTTTTTGTTGTAAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGaa < 1:6402824/140‑1 (MQ=255) tCACCGGGCAACCCGTAAGGAATACGCAGACGTATTCCTTTTTTGTTGTAAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAATAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACt < 2:11100264/140‑1 (MQ=255) ccGGGCAACCCGAAAGGAATACGCAGACGTATTCCTTTTTTGTTGTAAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCt < 1:4327285/140‑1 (MQ=255) ggCCACCCGAAAGGAATACGCAGACGTATTCCTTTTTTGTTGTAAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATg > 2:2703293/1‑140 (MQ=255) cAACCCGAAAGGAATACGCAGACGTATTCCTTTTTTGTTGTAAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGaa > 1:1027185/1‑140 (MQ=255) aCCCGAAAGGAATACGCAGACGTATTCCTTTTTTGTTGTAAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATa > 1:8419353/1‑140 (MQ=255) gAAAGGAATACGCAGACGTATTCCTTTTTTGTTGTAAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGt > 1:6572822/1‑140 (MQ=255) gAATACGCAGACGTATTCCTTTTTTGTTGTAAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCa < 2:1312497/140‑1 (MQ=255) gAATACGCAGACGTATTCCTTTTTTGTTGTAAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCa < 1:552752/140‑1 (MQ=255) gAATACGCAGACGTATTCCTTTTTTGTTGTAAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTACCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCa < 2:7264815/140‑1 (MQ=255) aaTACGCAGACGTATTCCTTTTTTGTTGTAAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCAc < 2:154149/140‑1 (MQ=255) tACGCAGACGTATTCCTTTTTTGTTGTAAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGc > 2:5088973/1‑140 (MQ=255) cGCAGACGTATTCCTTTTTTGTTGTAAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCg < 2:304694/140‑1 (MQ=255) cGCAGACGTATTCCTTTTTTGTTGTAAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCg < 2:8624135/140‑1 (MQ=255) cGCAGACGTATTCCTTTTTTGTTGTAAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCg < 1:6838536/140‑1 (MQ=255) aGACGTATTCCTTTTTTGTTGTAAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTg < 1:5742947/140‑1 (MQ=255) aCGTATTCCTTTTTTGTTGTAAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCCGG‑T‑T‑T‑G‑T‑TATGTGTAAGGACCTTCTATGACTACTGTCGGCACGCCGGTGCt > 1:9344027/1‑140 (MQ=255) ttCCTTTTTTGTTGTAAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATggg > 2:784282/1‑140 (MQ=255) tttttGTTGTAAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGa > 2:10964337/1‑140 (MQ=255) tttGTTGTAAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGAtt > 1:9607429/1‑140 (MQ=255) tttGTTGTAAGTGAGAACTTGCCGTAAGGAGAGGTCTATGCAAAAAAAGCAGAGGCTGAAGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTTTAAGGAACTTCAATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGAtt > 1:608697/1‑140 (MQ=255) ttgttgTAAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTc > 1:4021728/1‑140 (MQ=255) ttgtAAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCt < 1:2288533/140‑1 (MQ=255) gagaCCTTGCCGGAAGGCGAGTTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑G‑T‑T‑T‑TAT‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCtgttgttgt < 2:10437858/140‑1 (MQ=255) gagaCCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCtgttgttgt < 1:7780840/140‑1 (MQ=255) gagaCCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCtgttgttgt < 1:8960189/140‑1 (MQ=255) gaCCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCg < 1:5393059/140‑1 (MQ=255) cTTGCCGGACGGCGAGGTCGATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCa < 1:7367393/140‑1 (MQ=255) cTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCa > 2:2109736/1‑140 (MQ=255) tGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCAtt > 1:10841074/1‑140 (MQ=255) gCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTa > 2:3795577/1‑140 (MQ=255) aaGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTg > 1:111278/1‑140 (MQ=255) aGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTgg < 2:3398061/140‑1 (MQ=255) cGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑G‑TAT‑T‑A‑T‑TATGTGTAAGGAACATCTATGAATAATGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCAATATGCTGGCTa > 1:9089087/1‑140 (MQ=255) gTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGa < 1:8852599/140‑1 (MQ=255) tCTATGCATAAAATGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGAc < 2:7124041/140‑1 (MQ=255) tCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGAc < 1:7532092/140‑1 (MQ=255) tCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGAc < 2:277790/140‑1 (MQ=255) tCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGAc < 1:10049006/140‑1 (MQ=255) tCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGAc < 2:8862598/140‑1 (MQ=255) cTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGAcc < 1:950738/140‑1 (MQ=255) tGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCtgt > 2:4962763/1‑140 (MQ=255) tGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCtgt < 1:6190618/140‑1 (MQ=255) aaaaaGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGttgttg > 1:1789275/1‑140 (MQ=255) aaaaaGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TAGGTGTAAGGAACTTCTATGACTACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATACGCTGTTGTTGTCGCCCTTAAGCTGGCTATCGACCTGttgttg > 2:9799988/1‑140 (MQ=255) aaaaGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGGTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGttgttga > 1:9922386/1‑139 (MQ=255) aaaaGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGTTGTTGc > 1:338240/1‑140 (MQ=255) aaaaGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGTTGTTGc > 1:4900435/1‑140 (MQ=255) aaaaGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGTTGTTGc > 1:2684083/1‑140 (MQ=255) aaaaGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGTTGTTGc > 1:8110500/1‑140 (MQ=255) aaaGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGTTGTTGCa < 1:1226529/140‑1 (MQ=255) aaGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGTTGTTGCAg < 2:8373863/140‑1 (MQ=255) aaGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGGTGTTGTCGCCATTCTGCTGGCTATCGACCTGTTGTTGCAg > 2:6169009/1‑140 (MQ=255) aaGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGGGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGGTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGTTGTTGCAg > 1:3509826/1‑140 (MQ=255) gcagcGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGTTGTTGCAggg < 2:3185638/140‑1 (MQ=255) gcagcGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGTTGTTGCAggg > 1:8668566/1‑140 (MQ=255) cagcGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGTTGTTGCAgggg < 1:9707074/140‑1 (MQ=255) gcggcgGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCCTTATGCTGGCTATCGCCCTGTTGTTGCAGGGGcg > 1:5184131/1‑140 (MQ=255) ggCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGTTGTTGCAGGGGcgtc < 2:6503566/140‑1 (MQ=255) cTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGTTGTTGCAGGGGcgtcgt < 2:9607428/140‑1 (MQ=255) tGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGTTGTTGCAGGGGCGTCGTg < 2:8972203/140‑1 (MQ=255) tGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGTTGTTGCAGGGGCGTCGTg < 1:1981933/140‑1 (MQ=255) tGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTATAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGACTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGTTGTTGCAGGGGCGTCGTg < 2:7515451/140‑1 (MQ=255) cGTCTTCCGACGTTGGCC‑G‑T‑TGT‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGGTGCTATGGGGCGGTTTCGCTGGTGTTGTCGCCCTGATGCTGGCTATCGACCGGGTGGTGCGGGGGCGGCgggggg > 1:10655795/1‑140 (MQ=255) gTCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGTTGTTGCAGGGGCGTCGTGGGGc < 2:5992249/140‑1 (MQ=255) tcatCCGACGTTGGCC‑G‑T‑T‑TAT‑T‑TATGTGTTAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGGTGCGATGGGGCGGATTCGCGGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGGTGTTGCAGGGGCGTCGTGGGGca < 2:6632481/137‑1 (MQ=255) tCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGTTGTTGCAGGGGCGTCGTGGGGca < 2:5578611/140‑1 (MQ=255) tCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGTTGTTGCAGGGGCGTCGTGGGGca < 2:5753123/140‑1 (MQ=255) tCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGTTGTTGCAGGGGCGTCGTGGGGca < 2:806916/140‑1 (MQ=255) tCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGTTGTTGCAGGGGCGTCGTGGGGca < 1:7028249/140‑1 (MQ=255) tCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGTTGTTGCAGGGGCGTCGTGGGGca < 2:10841073/140‑1 (MQ=255) tCTTCCGACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGCTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGTTGTTGCAGGGGCGTCGTGGGGca < 2:3944808/140‑1 (MQ=255) tCTACCGACGTTGGCC‑GAT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGACCTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGTTGTTGCAGGGGCGTCGTGGGGca < 1:7899441/140‑1 (MQ=255) cTTCCGACGTTGGCC‑G‑T‑T‑T‑T‑TGTATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGTTGTTGCAGGGGCGTCGTGGGGcac > 2:3612680/1‑140 (MQ=255) ttCCGACGTTGTCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATCCTGTCGGCACGACGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGACATTATGCTGGCTATCGACCTGTTGTTGCAGGGGCGTCGTGGGGcaca < 1:2888739/140‑1 (MQ=255) gACGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGTTGTTGCAGGGGCGTCGTGGGGCACATGcc < 1:422907/140‑1 (MQ=255) aCGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGTTGTTGCAGGGGCGTCGTGGGGCACATGcca < 1:5880998/140‑1 (MQ=255) aCGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGTTGTTGCAGGGGCGTCGTGGGGCACATGcca > 2:8745894/1‑140 (MQ=255) cGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGTTGTTGCAGGGGCGTCGTGGGGCACATGccat < 1:10457254/140‑1 (MQ=255) cGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGTTGTTGCAGGGGCGTCGTGGGGCACATGccat < 1:373621/140‑1 (MQ=255) cGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGTTGTTGCAGGGGCGTCGTGGGGCACATGccat < 2:9096493/140‑1 (MQ=255) cGTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGTTGTTGCAGGGGCGTCGTGGGGCACATGccat < 2:9378585/140‑1 (MQ=255) agTTGGCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGTTGTTGCAGGGGCGTCGTGGGGCACATGccag < 1:4624868/139‑2 (MQ=255) ggCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGTTGTTGCAGGGGCGTCGTGGGGCACATGccatgacc > 1:10973754/1‑140 (MQ=255) ggCC‑GTT‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGTTGTTGCAGGGGCGTCGTGGGGCACATGccatgacc < 1:827933/140‑1 (MQ=255) | TGTGTGAAAAAACACATCCGGTCACCGGGCAACCCGAAAGGAATACGCAGACGTATTCCTTTTTTGTTGTAAGTGAGACCTTGCCGGAAGGCGAGGTCTATGCATAAAAAGCAGCGGCTGACGTCTTCCGACGTTGGCC‑G‑T‑T‑T‑T‑T‑TATGTGTAAGGAACTTCTATGAATACTGTCGGCACGCCGTTGCTATGGGGCGGATTCGCTGTTGTTGTCGCCATTATGCTGGCTATCGACCTGTTGTTGCAGGGGCGTCGTGGGGCACATGCCATGACC > NZ_CP025268/3239102‑3239375 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |