Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 1,292,982 | 0 | A | G | 50.2% | 38.7 / inf | 336 | noncoding (55/132 nt) | CXP41_RS06835 | RtT sRNA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (52/106); new base G (89/70); total (154/182) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.48e-05 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 342 total aligned reads displayed.
CGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGC > NZ_CP025268/1292845‑1293115 | gcttGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGGGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGgcgc > 1:8584088/4‑140 (MQ=255) gcttGGGCAGAATATTTGATTGAGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGAGGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGc > 2:6134143/4‑140 (MQ=255) cttGGGCAGAATATATGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCt < 1:5328243/138‑1 (MQ=255) cATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTGGGTGgcgcg > 2:6410551/1‑139 (MQ=11) ttGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTc < 1:3234101/139‑1 (MQ=255) ggCAGAATCTTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGCTGGTGGGGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAg > 2:6483135/1‑140 (MQ=11) ggCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTAATCTGCGCTGCGCGCATCGCCCTTCGGGTCGGTGCCTGAGGCCACGGTCTCTCGCGGTCGCTCGaa > 1:2437795/1‑139 (MQ=14) ggCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCCGCTCTGCGCGCTTCGCCATTCCTGTCGTGGCCAGCCGCAACTATATCTCGCTGGCGCTCTAg > 2:9573118/1‑140 (MQ=11) gCAGACTATTTGATTGCGTATTCGTGTGAGTATGCCGGGGCTTTTGATAGTGAGGGTGGGGGGGGAAGGATTACTCCGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGc < 2:9627593/140‑1 (MQ=14) gCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGACAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGc < 2:8712731/140‑1 (MQ=255) gCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAgt > 2:7222296/1‑139 (MQ=255) aGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCg < 2:4343543/140‑1 (MQ=255) aGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTTCTCAGCGCGGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAAAGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCg < 1:1554362/140‑1 (MQ=11) aaTATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGaa > 2:5047806/1‑140 (MQ=11) tatTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGTCGAAcc > 2:3321967/1‑140 (MQ=255) tatTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAAcc < 1:1616984/140‑1 (MQ=255) tatTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAAcc > 1:11318439/1‑140 (MQ=11) atGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGAGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCCCTGGCTCTCGAGTCGAACCttg > 2:6754125/2‑139 (MQ=11) tGCGGATTCGTTTGAGATTTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGa < 1:3254103/140‑1 (MQ=255) tGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCGATCCGAACCTTAGTCGa < 2:3945873/140‑1 (MQ=255) tGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGa < 1:1407619/140‑1 (MQ=255) gCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGaa < 1:10836395/140‑1 (MQ=255) cGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTTCCAGCGGCAAAGCAATCTCGCTGGCGCTCGAGACGAACCTTAGTCGAAg > 1:3914213/1‑140 (MQ=14) cGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAg > 2:1751097/1‑140 (MQ=255) cGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCGGCGGCAAAGCTCTCTCGCTGACCCGCGAGGCGAACCATAGTCGAAg > 1:1725003/1‑140 (MQ=14) gATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCCGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCt < 2:4762370/140‑1 (MQ=255) ttCGTTTGAGAATTCCGGGGATTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTtc < 2:10565204/140‑1 (MQ=255) cgtttGAGCATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTtctc < 1:2749882/137‑1 (MQ=255) cgtttGAGAATTCCGGGGCGTTTGACAGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTtctc < 1:8979697/137‑1 (MQ=14) tttGAGCATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCAt < 2:8882773/139‑1 (MQ=255) tttGAGAATTCCGGGGCTTTTGTAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCAt < 1:7373625/139‑1 (MQ=255) tGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGGTCTCTCGCGGAAGCTCGATGCGAACATTAGTCGAAGCTTCTCAtac > 1:1792791/1‑138 (MQ=14) agaATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGACGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCtt > 2:1829129/1‑140 (MQ=255) gaATTCCGGGTCTTTTGAAAGGGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTc < 2:2547801/140‑1 (MQ=255) gaATTCCGGGGCTTTTGACAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTc < 1:6740964/140‑1 (MQ=255) tttCGGGGTCTTTTGTAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTccc < 2:3570962/139‑1 (MQ=255) tCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCGGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCg < 1:8131192/140‑1 (MQ=255) ccGGTGCTTTTTAAAGTGATGGTTGTGGTGGAATGATTCCTCTTATTTGCCGGCTTCGACATTCGTGTATTTGACTGAGGCAACGCTCTCTAGCTGACGCTCTAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGc < 2:5727109/140‑1 (MQ=2) gtttttttttGTATGTGATGGTGGTGGGGGATTGATTACTCAGCGCTGCGAGATTCGCCCTTGGGGTCGTTGAATGCGGAAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCa < 2:8251027/134‑1 (MQ=11) ggggCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAt < 2:7352491/140‑1 (MQ=21) gggCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCgatgt > 2:695166/1‑136 (MQ=19) gCTTTGGAAAGTGATGTTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATggg < 2:2713074/140‑1 (MQ=16) ttttGATTGTGAGGGTGGGGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCa < 1:2087068/140‑1 (MQ=11) atttGTAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCa < 2:5273419/139‑1 (MQ=12) ttGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATTCGCAGa > 2:2781882/1‑140 (MQ=12) aGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAatatc < 1:5096469/140‑2 (MQ=17) cgATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCg < 2:5885455/91‑1 (MQ=17) aGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCATGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAAATTTAAATGCGGATTCGTTgg > 2:4674248/1‑140 (MQ=11) gATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGa < 2:2260839/140‑1 (MQ=11) gATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGa < 1:3808353/140‑1 (MQ=11) aTTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAt < 2:10015937/107‑1 (MQ=17) aTTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAt > 1:10015938/1‑107 (MQ=17) aTTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTATCAAGCTGGCGCGCGAGTCGAACCGTGGTCGAATCATCTCATACTTCCCCCCATGGGCACAATAATTAATTGGGGATTAGTTGGGaa > 1:6149493/1‑140 (MQ=11) tACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCAGCCTTCCCCGCTGGGGGCGAAGATTTAATTGCGGATTCGGTGGGAAGt > 1:8407132/1‑140 (MQ=11) tACTCAGCGCGGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGGATATTGTATTGCGGAGTCGGTGGGGAGt > 2:11147210/1‑140 (MQ=11) aCTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGtt < 1:3024419/140‑1 (MQ=255) cTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGa < 1:9438027/135‑1 (MQ=255) cTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTc > 2:10497036/1‑140 (MQ=255) cTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTGGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCCGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGACGtag > 2:6077945/1‑138 (MQ=11) cTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAATCGAAcc < 2:1974547/73‑1 (MQ=255) cTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAAACGAAcc > 1:1974548/1‑73 (MQ=255) cAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCAACCTTCCCCGCATGGGCAGAATAGTTAAGTGGGGAGTCGTTGGGACGTTCAg > 2:6363506/1‑140 (MQ=11) aGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCTAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAga < 1:4285437/140‑2 (MQ=14) gcgcTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAggg < 2:11325662/140‑1 (MQ=255) cgcTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCCTGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGa > 2:7061131/1‑140 (MQ=14) tGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACtt > 2:4329450/1‑140 (MQ=255) tGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTACCCGCATGGGCAGAATAATTAATTTCGGATTCGGTGGGGAGTTCAGGGACtt > 2:5450232/1‑140 (MQ=11) cgcgcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCGAGGCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACtttt > 2:11018149/1‑140 (MQ=255) cgcgcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGACGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTTATTGCGGATTCGGTGGGCAGTTCAGGGACtttt > 2:9263364/1‑140 (MQ=11) cgcgcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTAGAGTCGAACCTTGGTAGAAGCGTCTCAACCTTACCCGCCTGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACtttt > 2:1622146/1‑140 (MQ=14) cgcgcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCGTCCCCGCATGGGCAGAATATTTTATTGCGGATTCGGGGGGGAGTTCAGGGACtttt > 2:8559478/1‑140 (MQ=11) cgcgcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGa < 1:4199228/71‑1 (MQ=21) cgcgcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTAGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCATCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACtttg > 2:1518037/1‑139 (MQ=14) cgcgcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCACTCTCGCTGACGCTCGAGACGAACCTTAGTCGAAGCTTATAATACTTACCCGCATGGGCAGAATATTTTATTGCGGATTCGCTTGGAAGTTCAGGGACtttt > 2:2362537/1‑140 (MQ=11) cgcgcTTCGCCCTTCGGGGCGTTGCCTGCGGCAACGCTCGCTCGCTGGCGCGCGAGTCGAACCTGGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAACTTTAAATGCGGCGTCGGTGGGACGTTCCgggccgggt > 2:1257752/1‑134 (MQ=2) cgcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGa < 1:70228/140‑1 (MQ=255) gcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGTCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGaa < 2:6667004/140‑1 (MQ=14) gcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGaa < 2:10801834/140‑1 (MQ=255) gcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGaa < 1:4698918/140‑1 (MQ=255) gCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGA < 1:1257174‑M1/140‑1 (MQ=255) cTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGG < 1:577649‑M1/140‑1 (MQ=255) tCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCGTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTGGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTG > 2:10269175‑M1/1‑140 (MQ=255) tCGGGTCGTGGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTTATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTG < 1:8352348‑M1/140‑1 (MQ=255) ggTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTG < 1:9020155‑M1/140‑1 (MQ=255) cGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCa > 2:8351395/1‑79 (MQ=21) ttGCCTGCGGCAACGCTATCTCGCTGGGGCTCGAGTCGAACGTTTGTCGTATCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGA < 1:10273987‑M1/140‑1 (MQ=255) ggggcaACGCGCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCGTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATTGTGGTGGGGGAAGGATT > 2:7707505‑M1/3‑140 (MQ=255) cGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCGTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTc > 1:11214930‑M1/1‑139 (MQ=255) ggCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCGTCTCATCCTTCCCCGCTGGGGCAGAATATTTCATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcg < 2:8521090‑M1/140‑3 (MQ=255) gCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTATCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATAGTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcga < 1:8523778‑M1/140‑4 (MQ=255) gCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcga < 1:9297818‑M1/140‑4 (MQ=255) gCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcga < 1:9573278‑M1/140‑4 (MQ=255) gCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGATGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcga < 1:4434530‑M1/140‑4 (MQ=255) cAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaa < 1:10497037‑M1/140‑5 (MQ=255) aCGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCTTCCTTCCCCGCATGGTCAGAATATTTACTTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTGTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaacc > 1:6497579‑M1/1‑134 (MQ=255) cGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATAGTTAATTGCGGATTCGGTGGGCAGGTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaacct > 1:7646771‑M1/1‑133 (MQ=255) cGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTTATTGCGGATTCGTTGGGTAGTTCAGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgtacca > 1:4377700‑M1/1‑133 (MQ=255) cGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCGTCCCCGCCTGGGCCGAAGATTGGAGTGCGGATTCGCGTGCGCGTTGTGGGTCTGTGGAATGNGAGGGTGGGGGGGGACGGTGTACTCAgc > 1:6021650/1‑140 (MQ=255) tctctcGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcg < 1:7276579‑M1/140‑11 (MQ=255) tcGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGTATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGGTCAGGGACTTTTGAATGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAGTcgcaccttcgaagt > 1:3359118‑M1/1‑126 (MQ=255) | CGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGC > NZ_CP025268/1292845‑1293115 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |