| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 1,391,913 | A→G | T126A (ACA→GCA) | tyrR → | transcriptional regulator TyrR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 1,391,913 | 0 | A | G | 99.6% | 1562.8 / NA | 450 | T126A (ACA→GCA) | tyrR | transcriptional regulator TyrR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (255/193); minor base T (0/2); total (255/195) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.87e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 471 total aligned reads displayed.
GGCGTTGAGCGCGTTACTGGAGGCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCACACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGA > NZ_CP025268/1391777‑1392049 | ggCGTTGAGCGCGTTACTGGAGGCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCcgcac > 1:5383634/1‑140 (MQ=255) gCGTTGAGCGCGTTCCTGGAGGCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATAGGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGCACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCcgcacc > 1:10958648/1‑139 (MQ=255) cGTTGAGCGCGTTACTGGAGGCGTTGCCAGAACCTGTGCTCTCTGTCGCTATCAAAAGCACAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGAGCGCCTGCGCAACAATACCGCCGCACaa < 1:8034952/140‑1 (MQ=255) gAGCGCGTTACTGGAGGCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGa > 1:3134857/1‑140 (MQ=255) aGCGCGTTACTGGAGGCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTGTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGAt > 1:1501661/1‑140 (MQ=255) cgcgTTACTGGAGGCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTa > 1:9032250/1‑140 (MQ=255) cgTTACTGGAGGCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAAc > 1:10724411/1‑140 (MQ=255) gTTACTGGAGGCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGTATATGGCGAACCCGTCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACg > 1:4331214/1‑140 (MQ=255) gTTACTGGAGGCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACg > 2:11442744/1‑140 (MQ=255) tGGAGGCGTTGCCTGAACCTGTTCTCTATGTAGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCAAACCGCCGCACAAGTGATTAACGGCttt > 1:3233376/1‑140 (MQ=255) tGGAGGCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCttt < 2:7432515/140‑1 (MQ=255) ggAGGCGTTGCCTGATACTGTGCTCTCTGTCGATATGTAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTa < 2:1384530/140‑1 (MQ=255) gCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAATTTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAAttt > 2:8639655/1‑140 (MQ=255) gTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACACTTGATTAACGGCTTTAAttttt > 2:7122461/1‑140 (MQ=255) gTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAAttttt > 2:5421607/1‑140 (MQ=255) gTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAAttttt > 2:7041731/1‑140 (MQ=255) gTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAAttttt > 1:10384204/1‑140 (MQ=255) ttGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAAtttttt < 1:11346352/140‑1 (MQ=255) tGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTa > 2:4668520/1‑140 (MQ=255) tGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTa > 1:3987770/1‑140 (MQ=255) gCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAAGTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTAc > 2:1041032/1‑140 (MQ=255) cTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGt < 2:1542270/140‑1 (MQ=255) cTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGt > 2:4323031/1‑140 (MQ=255) cTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGt < 1:3539091/140‑1 (MQ=255) ccTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCCACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCt > 1:8386965/1‑140 (MQ=255) ccTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCt < 1:2716939/140‑1 (MQ=255) cTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTg > 2:2789664/1‑140 (MQ=255) tgtgCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTgg > 2:6861062/1‑140 (MQ=255) tgCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGaa > 1:3393317/1‑140 (MQ=255) tgCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGaa > 2:1114588/1‑140 (MQ=255) tgCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGaa > 1:10815636/1‑140 (MQ=255) tgCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGaa > 1:7015063/1‑140 (MQ=255) tgCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGaa > 1:10878927/1‑140 (MQ=255) ctctGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAAGTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCg > 1:4136961/1‑140 (MQ=255) tctGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGa > 1:8637090/1‑140 (MQ=255) tctGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGa < 1:458361/140‑1 (MQ=255) ctGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGaa < 2:3152643/140‑1 (MQ=255) tGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAAc > 2:2838144/1‑140 (MQ=255) tGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAAc > 2:6466437/1‑140 (MQ=255) agTCGATATGACAAGCAAAGTGGATATTGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAATTTGGATCTCCAGCGCAACCTTACAGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGGTGGCTGGAAAGCGAAc > 2:689123/2‑140 (MQ=255) ctatatGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGc < 1:2389624/138‑1 (MQ=255) cGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGc < 2:7780282/140‑1 (MQ=255) cGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGc > 2:673132/1‑140 (MQ=255) tGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGAt > 2:4849131/1‑140 (MQ=255) ggAAAAGCAAAGTGGATATGGAGAACCCGGCGCGCTGTCCGCTTTTTGGGCAAAAAATGGATCGCCTGCGCTTCCAAACCGCCGCACAATGGCTTCACGGCTTTAATTTTTTACGTGGGCTGGACAGCGAACCGctcgag > 2:10847646/2‑135 (MQ=255) gAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGAtt < 2:5109850/140‑1 (MQ=255) aaaaGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTc > 2:7283564/1‑140 (MQ=255) aaaaGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTc > 1:9149151/1‑140 (MQ=255) aaaGCAATGTGGATCTGGCGACCCCGGCGAGCGGTCAGCTTTGTTGGCAAAAATGGGATCGCCTGCGCAACCAGACCGGCGCACACTTGATTAACGGCTTTAATTTTTTTCGTTGGCTGGAAAGCGATCCGCAAGATTCg < 2:6563244/140‑1 (MQ=255) aaaGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCg < 1:10538159/140‑1 (MQ=255) aaGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGc > 1:10047602/1‑140 (MQ=255) gCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCAt < 1:3011730/140‑1 (MQ=255) cAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATa > 1:5744281/1‑140 (MQ=255) aaaGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATaa < 1:10629085/140‑1 (MQ=255) aaaGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATaa < 1:6717217/140‑1 (MQ=255) aaGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAAc < 1:618983/140‑1 (MQ=255) aGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACg > 1:255569/1‑140 (MQ=255) tGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAg < 1:4784559/140‑1 (MQ=255) ggATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGc < 2:10559552/140‑1 (MQ=255) gATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCa < 1:2076954/140‑1 (MQ=255) atGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGt < 2:932035/140‑1 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1:8832730/140‑1 (MQ=255) cccGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGttatta > 1:5139363/1‑140 (MQ=255) gCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATgg > 1:1713212/1‑140 (MQ=255) cGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATggg > 1:5692165/1‑140 (MQ=255) cGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATggg > 2:4710755/1‑140 (MQ=255) tCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAAtt < 2:9605926/140‑1 (MQ=255) aGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTc < 2:1930/140‑1 (MQ=255) aGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTc > 2:5543620/1‑140 (MQ=255) ttGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATg > 1:7478235/1‑140 (MQ=255) ttGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATg < 2:8795790/140‑1 (MQ=255) ttGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATg < 1:1256423/140‑1 (MQ=255) ttGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATg < 2:8413361/140‑1 (MQ=255) ttGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATg < 2:1664174/140‑1 (MQ=255) gggCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGga > 1:6414289/1‑140 (MQ=255) aaaaTTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTa > 1:10136071/1‑140 (MQ=255) aaaaTTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTa < 2:3828436/140‑1 (MQ=255) aaTTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACg < 2:3987769/140‑1 (MQ=255) ttGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGcc < 2:8167084/140‑1 (MQ=255) gtGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATGAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGcc < 2:10271690/139‑1 (MQ=255) gATCGCCTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGt > 2:4478829/1‑140 (MQ=255) ccTGCGCAACCATACCGCCGNACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATGAATGGNCAGAATTNCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATc > 1:5975842/1‑140 (MQ=255) ccTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATc > 2:5280463/1‑140 (MQ=255) ccTGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGACGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGAGTACGCCTGTTTATc > 2:795319/1‑140 (MQ=255) tGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCtt < 2:3364951/140‑1 (MQ=255) tGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCtt < 1:819120/140‑1 (MQ=255) tGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCtt < 2:6329840/140‑1 (MQ=255) tGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCtt < 1:4654112/140‑1 (MQ=255) tGCGCAACCATACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATATTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTTTTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCtt < 2:3057357/140‑1 (MQ=255) ggcgcAACCATACCGCCGCACAAATGATTAACGGCTTTAATTTTGTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGTAGATTACGCCTGTTTATCtt < 1:8117627/139‑1 (MQ=255) aTACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGaa < 1:1770217/140‑1 (MQ=255) tACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGCGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGaaa < 1:9909581/140‑1 (MQ=255) tACCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGaaa < 2:2190716/140‑1 (MQ=255) aCCGCCGCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGaaaa < 1:981427/140‑1 (MQ=255) ccgccgCACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCAGGTCGTTCTTCATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAAt > 2:3594420/1‑140 (MQ=255) | GGCGTTGAGCGCGTTACTGGAGGCGTTGCCTGAACCTGTGCTCTCTGTCGATATGAAAAGCAAAGTGGATATGGCGAACCCGGCGAGCTGTCAGCTTTTTGGGCAAAAATTGGATCGCCTGCGCAACCATACCGCCACACAATTGATTAACGGCTTTAATTTTTTACGTTGGCTGGAAAGCGAACCGCAAGATTCGCATAACGAGCATGTCGTTATTAATGGGCAGAATTTCCTGATGGAGATTACGCCTGTTTATCTTCAGGATGAAAATGA > NZ_CP025268/1391777‑1392049 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |