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* | NZ_CP025268 | 1,432,712 | 0 | T | C | 99.8% | 1564.4 / ‑5.3 | 594 | P278P (CCA→CCG) | CXP41_RS07635 | IS5‑like element ISKpn26 family transposase |
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Only 100 of 594 total aligned reads displayed.
CTCTCCCACTGACGTATCATTTGGTCCACCCGAAACAGGTTGGCCAGGGTGAATAACATCGCCAGTTGGTTATCGTTTTTCAGCAGCCCCTTGTATCTGGCTTTCACGAAGCCGAACTGTCGCTTGATGATGCGAAATGGGTGCTCCACCCTGGCCCGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGTGGATGCTGTTTCAAGGTTCTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTC > NZ_CP025268/1432575‑1432846 | ctctcCCACTGACGTATCATTTGGTCCACCCGCAACAGGTTGGCCAGGGTGAATAACATCGCCAGTTGGTTATCGTTTTTCAGCAGCCCCTTGTATCTGGCTTTCACGAAGCCGAACTGCCGCTTGATGATGCGAAACgg < 1:2187225/140‑1 (MQ=255) ctctcCCACTGACGTATCATTTGGTCCACCCGAAACAGGTTGGCCAGGGTGAATAACATCGCCAGTTGGTTATCGTTTTTCAGCAGCCCCTTGTATCTGGCTTTCACGAAGCCGAACTGCCGCTTGATGATGCGAAACgg > 2:4946947/1‑140 (MQ=255) ctctcCCACTGACGTATCATTTGGTCCACCCGAAACAGGTTGGCCAGGGTGAATAACATCGCCAGTTGGTTATCGTTTTTCAGCAGCCCCTTGTATCTGGCTTTCACGAAGCCGAACTGCCGCTTGATGATGCGAAACgg < 1:9845079/140‑1 (MQ=255) ctctcCCACTGACGTATCATTTGGTCCACCCGAAACAGGTTGGCCAGGGTGAATAACATCGCCAGTTGGTTATCGTTTTTCAGCAGCCCCTTGTATCTGGCTTTCACGAAGCCGAACTGCCGCTTGATGATGCGAAACgg < 2:3970023/140‑1 (MQ=255) 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(MQ=11) ccGCTTGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGt > 2:5906520/2‑140 (MQ=11) ccGCTTGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGt < 2:522191/139‑1 (MQ=11) ccGCTTGATGATGAGAAACGGGTGATCCACACTGGCACGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTAAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGt > 1:6546864/2‑140 (MQ=11) cGCTTGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGATGCTGTCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGTTTCTGCGTCAAGGTTTTTAACTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTc < 2:8551739/140‑1 (MQ=11) cGCTTGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTc < 1:2985863/140‑1 (MQ=11) gCTTGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGCTGCTGGCTGTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGCGTCTGCTTCAAGGTGTGTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCCGCCAGTcc > 2:6836626/1‑140 (MQ=11) gCTTGATGATGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGGTGATGGCCGTTGTGTTCTTGCGCGGATGCTGCTTCAAGGTTTGTAGCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTcc > 1:8529455/1‑140 (MQ=11) gCTTGATGAAGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTcc < 2:8011273/140‑1 (MQ=11) tgatgaTGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCcaca > 1:11276821/1‑140 (MQ=11) gatgatGCGAAACGGGTGCTCCACCCTGGCACGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGCGGATTCTGCTTCAAGGTTTTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACAt < 2:8803037/140‑1 (MQ=11) | CTCTCCCACTGACGTATCATTTGGTCCACCCGAAACAGGTTGGCCAGGGTGAATAACATCGCCAGTTGGTTATCGTTTTTCAGCAGCCCCTTGTATCTGGCTTTCACGAAGCCGAACTGTCGCTTGATGATGCGAAATGGGTGCTCCACCCTGGCCCGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGTGGATGCTGTTTCAAGGTTCTTACCTTGCCGGGACGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTC > NZ_CP025268/1432575‑1432846 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |