Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 1,713,981 | C→T | P8S (CCC→TCC) | rsxD → | electron transport complex subunit RsxD |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 1,713,981 | 0 | C | T | 99.2% | 2839.3 / NA | 752 | P8S (CCC→TCC) | rsxD | electron transport complex subunit RsxD |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); major base T (344/401); minor base G (1/5); total (345/407) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.26e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 791 total aligned reads displayed.
AGGCTAATGCGGTACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCCCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTA > NZ_CP025268/1713844‑1714116 | aGGCTAATGCGGTACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGctcc > 2:8453578/1‑140 (MQ=255) ggCTAATGCGGTACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGTGGACTAAATGGGAGTCTGCAGAGCTAGctccc > 2:10194250/1‑140 (MQ=37) aaTGCGGTACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTta < 2:8210623/140‑1 (MQ=255) aaTGCGGTACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTta < 2:7618578/140‑1 (MQ=255) aaTGCGGTACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTta < 2:2291168/140‑1 (MQ=255) aaTGCGGTACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTta < 1:2751551/140‑1 (MQ=255) aaTGCGGTACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTta < 2:1325534/140‑1 (MQ=255) aaTGCGGAACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTta < 1:1445051/140‑1 (MQ=255) aTGCGGTACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTtat > 1:9935846/1‑140 (MQ=255) tGCGGTACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTtata > 1:8653536/1‑140 (MQ=255) gTACCATAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCa < 2:6477061/140‑1 (MQ=255) gTACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCa < 1:4807915/140‑1 (MQ=255) tcccAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAATAATGCCGCCCAGCCGAGGGTTGTCAACGAGGCCTATATGGTATGCAGAATAGCTCGCTGCCCTTATAGCCAt > 1:6752161/3‑140 (MQ=37) tACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAATGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCAt > 2:4885055/1‑140 (MQ=255) tACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCAt > 1:4484735/1‑140 (MQ=255) tACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCAt > 1:2233479/1‑140 (MQ=255) tACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCAt > 1:1960231/1‑140 (MQ=255) tACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCAt > 2:3361410/1‑140 (MQ=255) tACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCCCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCAt > 1:1098831/1‑140 (MQ=255) cAGAAGACCAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTCAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAAc < 1:10177653/140‑1 (MQ=255) cAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAAc < 1:10353954/140‑1 (MQ=255) cAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATCCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAAc < 2:107040/140‑1 (MQ=255) agaagaACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAAcc < 2:5214416/140‑1 (MQ=255) gaagaaCAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCa > 1:4216123/1‑140 (MQ=255) gaagaaCAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCa < 1:4989878/140‑1 (MQ=255) aagaaCAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAg < 1:7525235/140‑1 (MQ=255) aCAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTCTTGCCCGCGCTCCGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTACACGAGGACTACATGGTCTGCAGACTAGCTAGCTCCCCGTATCCCCATACCCAgcgcg > 2:2622180/1‑139 (MQ=255) aCAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGcc > 1:3983877/1‑140 (MQ=255) aCAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGcc > 1:1740653/1‑140 (MQ=255) aCAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGcc > 1:6238113/1‑140 (MQ=255) aCAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGcc > 1:5647998/1‑140 (MQ=255) aCAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGcc > 1:4654241/1‑140 (MQ=255) aGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAg > 2:9387742/1‑140 (MQ=255) gTTGATCATCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCAATCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATAAACATAACCAGCGCCAGAc > 1:8518602/1‑140 (MQ=255) aTCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATcg < 1:10731419/140‑1 (MQ=255) gcgcAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACCTCGCGCa > 2:277928/1‑140 (MQ=255) gcgcAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCa < 1:7810912/140‑1 (MQ=255) aaaGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCAAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTAt < 1:3560840/140‑1 (MQ=255) aGCGGCTGTTGCCGCGGCTATTGCACGCGCTCAGGCCAAAATTGCCGCACAGCCGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGATTAGCTCGCTCCCCGTCTACCCATAACCAGCGCCAGCCATCGCGCCTTATgg > 2:9240997/1‑139 (MQ=255) aGCGGCAGTTGCCGCTGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGCCTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGc < 2:5025310/140‑1 (MQ=255) aGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAACCGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGc < 2:5989579/140‑1 (MQ=255) aGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGc > 2:2366217/1‑140 (MQ=255) cAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTg > 1:5249848/1‑140 (MQ=255) gtGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTACATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGgtg < 1:2303142/139‑1 (MQ=255) cgGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTc < 2:1545141/140‑1 (MQ=255) ggCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCg < 1:9493320/140‑1 (MQ=255) tATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAACAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAAGGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAg < 2:6253133/140‑1 (MQ=255) tATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAg < 2:7901753/140‑1 (MQ=255) tATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAg > 2:8804367/1‑140 (MQ=255) tATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAg < 2:1673754/140‑1 (MQ=255) tATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAg > 1:380909/1‑140 (MQ=255) tATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAg < 2:6817890/140‑1 (MQ=255) ttGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGcc > 1:6404688/1‑140 (MQ=255) tGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATGATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCg > 2:5443599/1‑140 (MQ=255) cccGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTg < 2:10319171/140‑1 (MQ=255) cgcgCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCGTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGcc > 2:3956693/1‑140 (MQ=255) cgcTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAg > 2:87012/1‑140 (MQ=255) cgcTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAg > 1:830282/1‑140 (MQ=255) cgcTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAg > 1:2477149/1‑140 (MQ=255) cgcTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAg > 1:42916/1‑140 (MQ=255) tCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACGAAATGGTAGTCAGTATAGCTCGCTCCCGTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATGGCGCAGGTTGCTGTGGGGGTTGCTCGCGGCCGTGCCAGGaa > 2:10975536/1‑140 (MQ=255) cAGGCCAAACCAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTCAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAAt < 1:10527382/140‑1 (MQ=255) cAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAAt < 2:2119550/140‑1 (MQ=255) ggCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAACTGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCg < 2:1900039/140‑1 (MQ=255) ggCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCg > 1:2545391/1‑140 (MQ=255) cAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAg < 2:5732105/140‑1 (MQ=255) ccgccCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACtg > 1:10000953/1‑140 (MQ=255) ccgccCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACtg > 1:9671874/1‑140 (MQ=255) cgccCAGCAGAAGGTTGTAAAAGAGGACTAAATTTTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCAATAACCAGCGCAAGACATAGCGCATTATGCTGTTTGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACtgt < 2:4515506/140‑1 (MQ=255) gccCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACtgtg < 2:3785870/140‑1 (MQ=255) aGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTttggt < 2:3008623/140‑1 (MQ=255) tAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGt > 2:8985428/1‑140 (MQ=255) tAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGt > 1:1219836/1‑140 (MQ=255) tAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGt > 2:907426/1‑140 (MQ=255) tAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACAGCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTTCCAGGACTCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGt > 2:7433117/1‑140 (MQ=255) aCGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTAct > 1:5482786/1‑140 (MQ=255) aCGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTAct < 1:11253528/140‑1 (MQ=255) aGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACtctc > 1:3292733/1‑140 (MQ=255) ggACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCg > 1:8971003/1‑140 (MQ=255) ggACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCg > 1:5847641/1‑140 (MQ=255) ggACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCg > 2:1119209/1‑140 (MQ=255) ggACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCACTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCATCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCg > 1:7346030/1‑140 (MQ=255) cTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTAAGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTc > 2:11345103/1‑140 (MQ=255) aaTGGTATTCAGGATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGATCGCAGCCGTGACAGGAATCTCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTATCGTTCAGa > 2:10441912/1‑140 (MQ=255) aaTGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGa > 2:4428209/1‑140 (MQ=255) aTGGTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGAt < 2:3553169/140‑1 (MQ=255) gTATTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCt > 1:7170062/1‑140 (MQ=255) tATTCTGTATAGCTAGCTCCCCTTATTCCCATACCCAGCGCCAGACATCGCGCATTCTGCGGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGCATCGCAGCGCAACTGTGGTTGTTGGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGAtaggg > 2:9758712/1‑136 (MQ=255) aTTCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGt > 1:3374130/1‑140 (MQ=255) ttCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGGTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTGTTGTGGTTGGGGTACTCTCGTTCTGATCCTGtt > 1:6531487/1‑140 (MQ=255) tCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGNTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTg > 1:6020213/1‑140 (MQ=255) tCAGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTg < 1:8031244/140‑1 (MQ=255) aGAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGc > 2:9640079/1‑140 (MQ=255) gAATAGCTAGCTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCa < 1:9216122/140‑1 (MQ=255) agctagctCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCgg > 2:4714547/1‑140 (MQ=255) agctagctCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCgg > 2:3154997/1‑140 (MQ=255) agctagctCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCgg > 1:9077978/1‑140 (MQ=255) gctagcTCCCCTTATACCCAGAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTAGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGt < 1:3041395/140‑1 (MQ=255) gctagcGCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGt < 2:1228295/140‑1 (MQ=255) ctagcTCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGtt > 2:4199462/1‑140 (MQ=255) | AGGCTAATGCGGTACCAGAAGAACAGGTTGATCCGCGCAAAGCGGCAGTTGCCGCGGCTATTGCCCGCGCTCAGGCCAAAAAAGCCGCCCAGCAGAAGGTTGTAAACGAGGACTAAATGGTATTCAGAATAGCTAGCCCCCCTTATACCCATAACCAGCGCCAGACATCGCGCATTATGCTGTTGGTGTTGCTCGCAGCCGTGCCAGGAATCGCAGCGCAACTGTGGTTTTTTGGTTGGGGTACTCTCGTTCAGATCCTGTTGGCATCGGTTA > NZ_CP025268/1713844‑1714116 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |