| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NZ_CP025268 | 2,773,510 | A→G | *274* (TAA→TAG) | yfjQ → | DUF932 domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NZ_CP025268 | 2,773,510 | 0 | A | G | 99.6% | 2329.0 / NA | 675 | *274* (TAA→TAG) | yfjQ | DUF932 domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (351/321); minor base T (2/1); total (353/322) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 675 total aligned reads displayed.
ATTAAGGGCGGACTCAGTGGGCGTAATGCTAAAGGCGGACGAACTCATACTCGTGCCGTGCGTGGCATTGACGGGGATGTGAAGCTTAACCGTGCGCTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAAACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCATCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAAATAAAAAATAGTTTCT > NZ_CP025268/2773373‑2773645 | aTTAAGGGCGGACTCAGTGGGCGTAATGCTAAAGGCGGACGAACTCATACTCGTGCCGTGCGTGGCATTGACGGGGATGTGAAGCTTAACCGTGCGCTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGAc > 1:3457588/1‑140 (MQ=255) ttAAGGGCGGACTCAGTGGGCGTAATGCTAAAGGCGGACGAACTCATACTCGTGCCGTGCGTGGCATTGACGGGGATGTGAAGCTTAACCGTGCGCTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACg < 2:9304058/140‑1 (MQ=255) aGGGCGGACTCAGTGGGCGTAATGCTAAAGGCGGACGAACTCATACTCGTGCCGTGCGTGGCATTGACGGGGATGTGAAGCTTAACCGTGCGCTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGttt < 1:13007/140‑1 (MQ=255) gCGGACTCAGTGGGCGTAATGCTAAAGGCGGACGAACTCATACTCGTGCCGTGCGTGGCATTGACGGGGATGTGAAGCTTTACCGTGCGCTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCTGTAGACGTTTCag > 1:10107144/1‑139 (MQ=255) 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1:10733232/1‑137 (MQ=255) gggTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCATCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTAc > 2:897665/1‑140 (MQ=255) gTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCATCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACAt < 2:6188697/140‑1 (MQ=255) ggCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCATCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTGCATCTggg > 2:2578192/1‑139 (MQ=255) ggCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCATCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGc > 2:5767161/1‑140 (MQ=255) ggCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCATCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTGATAGCTTTTTAGCCCCGTTGCGTCTGGc > 1:8768152/1‑140 (MQ=37) cTGCTCACGCAACTGCAGTAGACTTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGCCACCCCCTGTCCGCATCGCTATGGGCTCGTGTGCCTCACTCCACCGGTTAGAGCCTTTAACCCCCGTTACCTCTGGCTTTTGCAGaa < 1:623299/140‑1 (MQ=25) cTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCATCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCACTCCCCCGGTTATCGCGTTTAGCCCGCGGGACGGCTGGCTTGTGcggga > 1:4378339/1‑136 (MQ=21) cTGCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCATCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGaa < 1:8357573/140‑1 (MQ=255) gCTCACGCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCATCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTGACATCTGGCTGTTGCAGACAt > 2:128718/1‑140 (MQ=255) cACGCAACTGCAGTAGACGGTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCATCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGGTATAGCTTTTAACCCCCGGTCCGTCTGGCGTTGGCAGACATgaa > 2:3085370/1‑140 (MQ=25) gCAACTGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCATCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCATTCCCCCGGGGATAGCTTTTCACCCCCGTTACATCTGGGGTTTGCAGAGATaaaaaa > 2:4768057/1‑140 (MQ=37) tGCAGTAGACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCATCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTCTAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAAATAatagataggt > 2:1478990/1‑138 (MQ=38) gCAGTAGACGTTTCAGGTTGCCACGTTGTTAATAACGGACACCACCTGTCCGCATCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCACTCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAAATAAAAAATAGttt < 2:4638115/140‑1 (MQ=255) aGTAGACGTTTCATGTGGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCATCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAAATAAAAAATAGTTTCt < 1:3079042/140‑1 (MQ=255) | ATTAAGGGCGGACTCAGTGGGCGTAATGCTAAAGGCGGACGAACTCATACTCGTGCCGTGCGTGGCATTGACGGGGATGTGAAGCTTAACCGTGCGCTGTGGGTGATGGCAGAAACACTGCTCACGCAACTGCAGTAAACGTTTCATGTTGCCACGTTGTTAATATCGGACACCACCTGTCCGCATCGCTATGTGCTCGTGTGCCTCAATCCCCCGGTTATAGCTTTTAACCCCCGTTACATCTGGCTTTTGCAGAAATAAAAAATAGTTTCT > NZ_CP025268/2773373‑2773645 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |