Predicted mutation | ||||||
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RA | NZ_CP025268 | 3,219,051 | T→C | K238E (AAG→GAG) | aer ← | aerotaxis sensor receptor Aer |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NZ_CP025268 | 3,219,051 | 0 | T | C | 99.7% | 2612.3 / NA | 748 | K238E (AAG→GAG) | aer | aerotaxis sensor receptor Aer |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 748 total aligned reads displayed.
TTCGTTCAGTTCATCGGTGCCTTTCGCCAGCGTCTCACTGCCATTTCTGACACTGGACACCTGGCTTGAGACATCGTTAATTAGCCAACGGCACATCAGGCCAAGTTGCCCTACCGCACGTAATGTCAGCCCCAGCTTATCGCTGCGATTCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACATTTTCTATCGGGCGCACAATCTGCCATTCAAAACAGGCGCTTGCCAACAATACCACTAACGCACAG > NZ_CP025268/3218914‑3219187 | ttcagttcaTCGGTGCCTTTCGCCAGCGTCTCACTGCCATTTCTGACACTGGACACCTGGCTTGAGACATCGTTAATTAGCCAACGGCACATCAGGCCAAGTTGCCCTACCGCACGTAATGTCAGCCCCAGCTCATCGCt > 1:5228111/1‑140 (MQ=255) ttcagttcaTCGGTGCCTTTCGCCAGCGTCTCACTGCCATTTCTGACACTGGACACCTGGCTTGAGACATCGTTAATTAGCCAACGGCACATCAGGCCAAGTTGCCCTACCGCACGTAATGTCAGCCCCAGCTCATCGCt > 1:3251927/1‑140 (MQ=255) tcagttcaTCGGTGCCTTTCGCCAGCGTCTCACTGCCATTTCTGACACTTGACACCTGGCTTGAGACATCGTTATTTAGCCAACGGCACATCAGGCCTAGTTGCCCTTCCGCACGTAATGTCAGCCCCAGCTCATCGCTg < 2:8751597/140‑1 (MQ=255) tcagttcaTCGGTGCCTTTCGCCAGCGTCTCACTGCCATTTCTGACACTGGACACCTGGCTTGAGACATCGTTAATTAGCCAACGGCACATCAGGCCAAGTTGCCCTACCGCACGTAATGTCAGCCCCAGCTCATCGCTg < 1:994447/140‑1 (MQ=255) tcagttcaTCGGTGCCTTTCGCCAGCGTCTCACTGCCATTTCTGACACTGGACACCTGGCTTGAGACATCGTTAATTAGCCAACGGCACATCAGGCCAAGTTGCCCTACCGCACGTAATGTCAGCCCCAGCTCATCGCTg < 1:7943006/140‑1 (MQ=255) cagttcaTCGGTGCCTTTCGCCAGCGTCTCACTGCCATTTCTGACACTGGACACCTGGCTTGAGACATCGTTAATTAGCCAACGGCACATCAGGCCAAGTTGCCCTACCGCACGTAATGTCAGCCCCAGCTCATCGCTGc > 1:8162530/1‑140 (MQ=255) aTCGGTGCCTTTCGCCAGCGTCTCACTGCCATTTCTGACACTGGACACCTGGCTTGAGACATCGTTAATTAGCCAACGGCACATCAGGCCAAGTTGCCCTACCGCACGTAATGTCAGCCCCAGCTCATCGCTGCGATTCa > 1:8449883/1‑140 (MQ=255) tCGGTGCCTTTCGCCAGCGTCTCACTGCCATTTCTGACACTGGACACCTGGCTTGAGACATCGTTAATTAGCCAACGGCACATCAGGCCAAGTTGCCCTACCGCACGTAATGTCAGCCCCAGCTCATCGCTGCGATTCAg < 2:164965/140‑1 (MQ=255) cGGTGCCTTTCGCCAGCGTCTCACTGCCATTTCTGACACTGGACACCTGGCTTGAGACATCGTTAATTAGCCAACGGCACATCAGGCCAAGTTGCCCTACCGCACGTAATGTCAGCCCCAGCTCATCGCTGCGATTCAGa < 2:9502909/140‑1 (MQ=255) cGGTGCCTTTCGCCAGCGTCTCACTGCCATTTCTGACACTGGACACCTGGCTTGAGACATCGTTAATTAGCCAACGGCACATCAGGCCAAGTTGCCCTACCGCACGTAATGTCAGCCCCAGCTCATCGCTGCGATTCAGa > 1:10287188/1‑140 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(MQ=255) cACGTAATGTCAGCCCCAGCTCATCGCTGCGATTCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACATTTTCTATCGGGCGCACAATCTGCCATTCAAAACAGGCGCTTGCcaac > 2:2041576/1‑140 (MQ=255) cGTAATGTCAGCCNCAGCTCATCGCTGCGATTCAGATGCTCAACACTATTACGGTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACATTTTCTATCGGGCGCACAATCTGCCATTCAAAACAGGCGCTTGCcaacaa > 1:9830330/1‑140 (MQ=255) aaTGTCAGCCCCAGCTCATCGCTGCGATTCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACATTTTCTATCGGGCGCACAATCTGCCATTCAAAACAGGCGCTTGCCAACAATAc < 2:8060189/140‑1 (MQ=255) aaTGTCAGCCCCAGCTCATCGCTGCGATTCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACATTTTCTATCGGGCGCACAATCTGCCATTCAAAACAGGCGCTTGCCAACAATAc > 2:96958/1‑140 (MQ=255) aaTGTCAGCCCCAGCTCATCGCTGCGATTCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACATTTTCTATCGGGCGCACAATCTGCCATTCAAAACAGGCGCTTGCCAACAATAc < 1:9149273/140‑1 (MQ=255) tGTCAGCCCCAGCTCATCGCTGCGATTCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACATTTTCTATCGGGCGCACAATCTGCCATTCAAAACAGGCGCTTGCCAACAATACCa > 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ccAGCTCATCGCTGCGATTCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACATTTTCTATCGGGCGCACAATCTGCCATTCAAAACAGGCGCTTGCCAACAATACCACTAACGca < 2:1460663/140‑1 (MQ=255) ccAGCTCATCGCTGCGATTCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACATTTTCTATCGGGCGCACAATCTGCCATTCAAAACAGGCGCTTGCCAACAATACCACTAACGca < 2:5644747/140‑1 (MQ=255) ccAGCTCATCGCTGCGATTCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACC‑TCAGTGCCTGATGGGCAACATTTTCTATCGGGCGCACAATCTGCCATTCAAAACAGGCGCTTGCCAACAATACCACTAACGcac < 1:412821/140‑1 (MQ=255) cAGCTCATCGCTGCGATTCAGATGCTCAACACTATTCCGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACATTTTCTATCGGGCGCACAATCTGCCATTCAAAACAGGCGCTTGCCAACAATACCACTAACGcac < 2:6902623/140‑1 (MQ=255) cAGCTCATCGCTGCGATTCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACATTTTCTATCGGGCGCACAATCTGCCATTCAAAACAGGCGCTTGCCAACAATACCACTAACGcac < 2:8449408/140‑1 (MQ=255) cAGCTCATCGCTGCGATTCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACATTTTCTATCGGGCGCACAATCTGCCATTCAAAACAGGCGCTTGCCAACAATACCACTAACGcac < 1:4213221/140‑1 (MQ=255) cAGCTCAACGCTGCGATTCAGATGCTCAACACTATTACGGTCTCCGGTCGACACCTACAGTGCCCGATGGGCAACAATTTCGATCGGGCGCACAATCTGCCATTCAAAACAGGCGCTTGCCAACAATACCACTAACGcac < 2:3833318/140‑1 (MQ=255) aGCTCATCGCTGCGATTCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACATTTTCTATCGGGCGCACAATCTGCCATTCAAAACAGGCGCTTGCCAACCATACCACTAACGcaca > 1:4851559/1‑140 (MQ=255) aGCTCATCGCTGCGATTCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACATTTTCTATCGGGCGCACAATCTGCCATTCAAAACAGGCGCTTGCCAACAATACCACTAACGcaca < 2:9287064/140‑1 (MQ=255) aGCTCATCGCTGCGATTCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACATTTTCTATCGGGCGCACAATCTGCCATTCAAAACAGGCGCTTGCCAACAATACCACTAACGcaca < 1:4371599/140‑1 (MQ=255) aGCTCATCGCTGCGATTCAGATGCTCAACACAATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACATTTTCTATCGGGCGCACAATCTGCCATTCAAAACAGGCGCTTGCCAACAATACCACTAACGcaca < 1:10008275/140‑1 (MQ=255) | TTCGTTCAGTTCATCGGTGCCTTTCGCCAGCGTCTCACTGCCATTTCTGACACTGGACACCTGGCTTGAGACATCGTTAATTAGCCAACGGCACATCAGGCCAAGTTGCCCTACCGCACGTAATGTCAGCCCCAGCTTATCGCTGCGATTCAGATGCTCAACACTATTACGTTCTCCGGTCGCCACCTTCAGTGCCTGATGGGCAACATTTTCTATCGGGCGCACAATCTGCCATTCAAAACAGGCGCTTGCCAACAATACCACTAACGCACAG > NZ_CP025268/3218914‑3219187 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |