| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 4,079,391 | A→G | intergenic (+17/‑28) | dtd → / → fabY | D‑aminoacyl‑tRNA deacylase/fatty acid biosynthesis protein FabY |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 4,079,391 | 0 | A | G | 99.8% | 2138.6 / NA | 611 | intergenic (+17/‑28) | dtd/fabY | D‑aminoacyl‑tRNA deacylase/fatty acid biosynthesis protein FabY |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (268/342); minor base C (1/0); total (269/342) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.40e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 611 total aligned reads displayed.
TGACTATTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGTTCGGAACGC > NZ_CP025268/4079254‑4079526 | tGACTATTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTc > 2:9618239/1‑140 (MQ=255) cTATTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACg < 1:1231930/140‑1 (MQ=255) cTATTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACg < 2:3987230/140‑1 (MQ=255) cTATTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACg < 1:5214514/140‑1 (MQ=255) cTATTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACg < 1:179938/140‑1 (MQ=255) tATTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACgg > 2:51769/1‑140 (MQ=255) aTTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACggg < 1:10460632/140‑1 (MQ=255) tttCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGa > 1:2806545/1‑140 (MQ=255) tttCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGa > 2:382805/1‑140 (MQ=255) ttCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGaa > 2:6744728/1‑140 (MQ=255) tcgtcgAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGaaa > 2:3593207/1‑140 (MQ=255) tcgAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACaa > 2:6418768/1‑140 (MQ=255) gAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACAGTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAaga < 1:5676570/140‑1 (MQ=255) aaCGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCCGGGTTGTCACGGGAAACAagag > 2:1611890/1‑140 (MQ=255) gCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTa < 2:4669405/140‑1 (MQ=255) ccGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTAt < 1:1390201/140‑1 (MQ=255) gTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCg < 2:6920689/140‑1 (MQ=255) gTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCg < 2:4383797/140‑1 (MQ=255) tCAGCAAGAGATGAACACGCCAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGc < 2:4868782/140‑1 (MQ=255) tCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGc < 2:1229913/140‑1 (MQ=255) tCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGAAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGc < 2:268931/140‑1 (MQ=255) tCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCGTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGc < 1:9476015/140‑1 (MQ=255) cAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCt < 1:5525732/140‑1 (MQ=255) cAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCt < 2:7123253/140‑1 (MQ=255) gagaTGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTAt < 2:8832876/140‑1 (MQ=255) taTGAACACTCAAACAGGACGCTTCGCTTCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATTATGGCCCCATTACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGTAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCa < 1:719596/139‑1 (MQ=255) gAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCt > 2:9433807/1‑140 (MQ=255) gAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCt < 2:10758885/140‑1 (MQ=255) acacGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTc < 2:9099809/140‑1 (MQ=255) gCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGt < 1:9771360/140‑1 (MQ=255) aaaCAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCCGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTCTCGCTATGTATCACCTTCGGGTTc > 1:11296413/1‑140 (MQ=255) aCAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCca > 1:3373032/1‑140 (MQ=255) cAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCcac > 2:3034148/1‑140 (MQ=255) cAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCcac > 2:9289779/1‑140 (MQ=255) gACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACaaa > 2:8379494/1‑140 (MQ=255) gACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACaaa > 1:2439339/1‑140 (MQ=255) gACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACaaa < 1:7855006/140‑1 (MQ=255) cTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACaga < 1:4867959/140‑1 (MQ=255) ttCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACagaa > 2:10356438/1‑140 (MQ=255) tCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACagaag < 1:6671898/140‑1 (MQ=255) tCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACagaag < 1:4106501/140‑1 (MQ=255) tCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTATGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACagaag < 2:2350724/140‑1 (MQ=255) tCGCTGCGGATATGCAGGTATAGCTGGTCAATGATGGCCACGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACagaag < 2:2486646/140‑1 (MQ=255) cGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACagaaga < 1:6271287/140‑1 (MQ=255) gCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACagaagaa > 1:3017618/1‑140 (MQ=255) tGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACagaagaaga > 1:3271646/1‑140 (MQ=255) tGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCGTCGGGTTCCACAAACagaagaaga > 1:3929721/1‑140 (MQ=255) cGGATATGCAGTTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGCAGAAGAAt < 1:7757019/140‑1 (MQ=255) ggATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAAtt > 1:6882692/1‑140 (MQ=255) tatGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCATGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTaga < 2:8744902/140‑1 (MQ=255) tatGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTaga < 2:804726/140‑1 (MQ=255) gCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCg < 1:819302/140‑1 (MQ=255) gTATCTCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGATaa > 1:10600485/1‑139 (MQ=255) aTCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGTGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTa > 1:8085002/1‑140 (MQ=255) aTCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTa > 2:9866033/1‑140 (MQ=255) aTCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTa > 2:11143715/1‑140 (MQ=255) cGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATc > 1:4326511/1‑140 (MQ=255) gCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCa > 1:91233/1‑140 (MQ=255) cTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAg > 2:7869770/1‑140 (MQ=255) cTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAg > 2:6246614/1‑140 (MQ=255) ggTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGtt > 2:10936542/1‑140 (MQ=255) tCAATGATGGCCCCGTGACCTTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTc > 1:86946/1‑140 (MQ=255) tCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTc > 1:7368653/1‑140 (MQ=255) tCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTc > 2:2251867/1‑140 (MQ=255) cAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCg < 1:6418769/140‑1 (MQ=255) atgatgGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCt > 2:549094/1‑140 (MQ=255) tgatgGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTg > 2:3441315/1‑140 (MQ=255) gCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGaaa < 2:8183058/140‑1 (MQ=255) gCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGaaa > 1:5811703/1‑140 (MQ=255) gCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGaaa > 1:4619280/1‑140 (MQ=255) ccccGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGACACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAAt > 2:1846588/1‑140 (MQ=255) gTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTg > 1:9987607/1‑140 (MQ=255) gTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTg > 1:2067292/1‑140 (MQ=255) gACATTCTGGTTGCAGGTAAGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCCGGGAAATGTTGCg < 1:8876693/140‑1 (MQ=255) cATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTa < 2:732511/140‑1 (MQ=255) aTTCTGGTTGCAGNTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTANCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTaa > 1:5990072/1‑140 (MQ=255) tCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGc > 1:1998884/1‑140 (MQ=255) tGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGccc < 2:6078254/140‑1 (MQ=255) gTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCt > 1:10919649/1‑140 (MQ=255) cAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCAt < 2:4157647/140‑1 (MQ=255) cAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCAt < 1:8456022/140‑1 (MQ=255) cAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCAt > 2:11217288/1‑140 (MQ=255) aGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATc < 1:474445/140‑1 (MQ=255) tATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCg > 1:10190002/1‑93 (MQ=255) tATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCg < 2:10190001/93‑1 (MQ=255) tATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAAc > 1:2256297/1‑140 (MQ=255) aTGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAAcc < 2:5825970/140‑1 (MQ=255) aGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCaaa < 1:11419573/140‑1 (MQ=255) ccAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAg < 1:10091078/140‑1 (MQ=255) gCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGtt > 2:11373088/1‑140 (MQ=255) gCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGtt > 1:368724/1‑140 (MQ=255) gCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGtt > 2:261106/1‑140 (MQ=255) cTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGTTc > 2:5349182/1‑140 (MQ=255) cTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGTTc < 2:2842877/140‑1 (MQ=255) cTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGTTc > 1:10243397/1‑140 (MQ=255) aGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAACTGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGTTCGGAac > 2:7602421/1‑140 (MQ=255) aGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGTTCGGAac > 1:5047249/1‑140 (MQ=255) aGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGTTCGGAac > 2:1323018/1‑140 (MQ=255) gggTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGTTCGGAacg < 1:10976425/140‑1 (MQ=255) ggTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTCTCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTNTCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGTNCGGAacgc < 1:6064046/140‑1 (MQ=255) | TGACTATTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGTTCGGAACGC > NZ_CP025268/4079254‑4079526 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |