Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 939,446 | (A)7→8 | intergenic (‑289/‑255) | trxB ← / → lrp | thioredoxin‑disulfide reductase/leucine‑responsive transcriptional regulator Lrp |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 939,439 | 1 | . | A | 98.3% | 5693.0 / 60.4 | 1480 | intergenic (‑282/‑262) | trxB/lrp | thioredoxin‑disulfide reductase/leucine‑responsive transcriptional regulator Lrp |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (8/17); new base A (415/1037); total (423/1057) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.62e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 1805 total aligned reads displayed.
CTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑AAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCT > NZ_CP025268/939300‑939571 | ctGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaag > 1:6499391/1‑140 (MQ=255) tGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaag‑a > 1:5541427/1‑140 (MQ=255) tGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaag‑a > 2:6473771/1‑140 (MQ=255) gCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaag‑aa > 1:9843102/1‑140 (MQ=255) aCTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑aaa‑aa < 1:10226828/140‑1 (MQ=255) cTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑aaa‑aaa > 1:5119303/1‑140 (MQ=255) cTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑aaa‑aaa > 2:4813601/1‑140 (MQ=255) tAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑aaa‑aaaaa < 2:3270061/140‑2 (MQ=255) caaaTTTCCCGCATTATACGCCGAATCAATGATGCATACACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGGACTAAAAATCGATGTTTTGCTATGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑aaa‑acaaa < 2:8274386/139‑2 (MQ=255) aaTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑aaa‑aaaaaca < 1:1464706/140‑4 (MQ=255) aaTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑aaa‑aaaaaca < 1:5248229/140‑4 (MQ=255) aaTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑aaa‑aaaaaca < 1:8059449/140‑4 (MQ=255) aaTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑aaa‑aaaaaca < 2:3041758/140‑4 (MQ=255) aTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑aaa‑aaaaacag < 1:8628148/140‑5 (MQ=255) aTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑aaa‑aaaaacag > 2:265684/1‑136 (MQ=255) tttCCCTCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTTTTAATGAATATCTGTCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑aaa‑aaaaacagt < 2:10748027/140‑6 (MQ=255) tttCCCGCTTTATAATCCGATTAAATGATTAATACACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑AAACAAAACAGt < 2:2381511/140‑1 (MQ=255) tttCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATTAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGANG‑aaa‑aaaaacagt < 1:9320527/140‑6 (MQ=255) tttCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑aaa‑aaaaacagt < 2:662535/140‑6 (MQ=255) tttCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑aaa‑aaaaacagt < 2:5821291/140‑6 (MQ=255) tttCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑aaa‑aaaaacagt < 2:6187250/140‑6 (MQ=255) ccGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTc > 1:10525742/1‑140 (MQ=255) tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTtat < 1:2882582/140‑1 (MQ=255) tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTtat < 2:6021020/140‑1 (MQ=255) tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTtat < 1:10731633/140‑1 (MQ=255) tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTtat < 1:695402/140‑1 (MQ=255) taAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATgc < 2:6985351/140‑1 (MQ=255) aaGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATgcg < 2:5119303/140‑1 (MQ=255) aaGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATgcg < 1:8467787/140‑1 (MQ=255) gCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCa < 2:3388310/140‑1 (MQ=255) gCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCa < 2:10070638/140‑1 (MQ=255) gCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCa < 1:3365880/140‑1 (MQ=255) gATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTtat > 2:8732628/1‑130 (MQ=255) gATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTtat > 2:457285/1‑130 (MQ=255) gATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATaa > 1:7355617/1‑140 (MQ=255) tAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACca < 2:2514459/140‑1 (MQ=255) aaTGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 2:7237283/140‑1 (MQ=255) aaTGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 1:1311699/140‑1 (MQ=255) aaTGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 1:7515168/140‑1 (MQ=255) aaTGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 1:7742135/140‑1 (MQ=255) aaTGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 1:3769772/140‑1 (MQ=255) aaTGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 2:1575338/140‑1 (MQ=255) aaTGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 2:1309045/140‑1 (MQ=255) aaTGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 1:10000380/140‑1 (MQ=255) tgaATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGt < 2:9816887/140‑1 (MQ=255) tgaATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGt < 2:4102424/140‑1 (MQ=255) gaATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg > 1:8235296/1‑134 (MQ=255) gaATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTa > 1:4095154/1‑140 (MQ=255) gaATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTa > 1:3925931/1‑140 (MQ=255) aaTAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatgcatg < 1:4545437/137‑1 (MQ=255) aaTAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTaa > 2:4484769/1‑140 (MQ=255) tAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAAt < 2:4260068/140‑1 (MQ=255) tAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAAt < 2:3925931/140‑1 (MQ=255) tAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAAt < 1:2507461/140‑1 (MQ=255) tAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTGTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAAt < 2:8886480/140‑1 (MQ=255) aaCGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTTCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGATGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATAc < 2:5540845/140‑1 (MQ=255) aaCGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATAc < 2:9506926/140‑1 (MQ=255) aaCGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATAc < 2:3668919/140‑1 (MQ=255) ccccTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCAGGCATGTAAATACCATg < 2:6770086/140‑1 (MQ=255) ccTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 1:172667/123‑1 (MQ=255) ccTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCGTGCATGTAAATACCATGtt > 1:2633191/1‑140 (MQ=255) ccTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGtt > 1:9022323/1‑140 (MQ=255) tGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATAc > 2:7468318/1‑132 (MQ=255) tGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTa > 1:6760785/1‑140 (MQ=255) tGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTa < 1:491890/140‑1 (MQ=255) tGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTa > 2:814717/1‑140 (MQ=255) gAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTatat < 2:1794835/101‑1 (MQ=255) tatCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGt < 2:9673275/140‑1 (MQ=255) atCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCCTGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTg < 2:8492176/140‑1 (MQ=255) tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTAc > 2:7937597/1‑129 (MQ=255) tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGa > 1:9501833/1‑140 (MQ=255) tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGa > 1:1974222/1‑140 (MQ=255) tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGa > 1:6312438/1‑140 (MQ=255) tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGa > 1:569641/1‑140 (MQ=255) tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTGATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGa > 1:4407153/1‑140 (MQ=255) tGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGaaa < 2:7639013/140‑1 (MQ=255) ggCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAAt < 2:3839884/140‑1 (MQ=255) gCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCAt < 1:2184980/98‑1 (MQ=255) gCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCAt > 2:2184980/1‑98 (MQ=255) gttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑aaa‑aaaaaca > 1:1117376/1‑73 (MQ=255) ttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGt < 2:1089449/140‑1 (MQ=255) tgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGt > 2:5676661/1‑128 (MQ=255) tgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGa < 1:7174958/130‑1 (MQ=255) gtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTAt < 2:10472746/140‑1 (MQ=255) tACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTtat > 1:2366856/1‑82 (MQ=255) cTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGc < 2:9382072/140‑1 (MQ=255) tAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCg < 1:3133704/140‑1 (MQ=255) aaTCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg > 2:5271076/1‑90 (MQ=255) aTGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaag < 1:5969221/50‑1 (MQ=255) aTGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTg < 1:4261103/109‑1 (MQ=255) aTGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGAc < 1:3533616/140‑1 (MQ=255) ttttGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGcc < 2:1974222/140‑1 (MQ=255) ttttGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGcc < 1:968653/140‑1 (MQ=255) ttGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTg < 2:9024027/140‑1 (MQ=255) ccccTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATgcgc > 1:8814459/1‑58 (MQ=255) ccccTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGt > 2:10316697/1‑107 (MQ=255) ttttGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCg < 2:10590893/104‑1 (MQ=255) tttGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTtat > 1:10378044/1‑42 (MQ=255) ttGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACaa > 1:6098015/1‑140 (MQ=255) tGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 1:4738221/55‑1 (MQ=255) | CTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑AAA‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCT > NZ_CP025268/939300‑939571 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |