| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 1,013,520 | +G | pseudogene (463/542 nt) | zapC → | cell division protein ZapC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 1,013,518 | 1 | . | G | 99.1% | 1568.0 / 4.4 | 458 | pseudogene (461/542 nt) | zapC | cell division protein ZapC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/2); new base G (241/211); total (244/214) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
Only 100 of 497 total aligned reads displayed.
TGCCGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGC > NZ_CP025268/1013380‑1013651 | tGCCGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTT‑g > 1:6341061/1‑140 (MQ=255) ccGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTT‑ggg > 1:9484392/1‑139 (MQ=255) ccGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTT‑ggg > 1:1605579/1‑139 (MQ=255) gggCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTT‑gggcg > 1:5196459/1‑137 (MQ=255) ggCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTT‑gggcga > 2:2837130/1‑136 (MQ=255) ggCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATAATCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTTGCACAAACCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTT‑gtgcga > 2:7589983/1‑135 (MQ=255) gCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTT‑gggcgac < 2:10831831/140‑6 (MQ=255) gCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTT‑gggcgac > 2:9309440/1‑135 (MQ=255) gCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTT‑gggcgac > 2:3645162/1‑135 (MQ=255) gCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTT‑gggcgac > 2:7512668/1‑135 (MQ=255) cGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGACAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTGATTGCGGGTCGCGCGGTGCA‑GTTGGGCGACg > 2:10058869/1‑140 (MQ=255) cGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACg > 2:8374262/1‑140 (MQ=255) gATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGc < 2:7322147/140‑1 (MQ=255) cTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTaaaa > 2:5593603/1‑140 (MQ=255) gTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCAt < 1:341563/140‑1 (MQ=255) gTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTCTGCCTGCTGGCACAACCCGGCGTGGTTAGTGCGGGTCGCGCGATGCAGGTG‑GGCGCCGCGCTTAAGGTCAGGAACg > 2:9018857/1‑140 (MQ=255) gTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACg > 1:6782952/1‑140 (MQ=255) gCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAgg > 2:1455260/1‑140 (MQ=255) cGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGc > 2:113088/1‑140 (MQ=255) tACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGGCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGa > 1:8373123/1‑140 (MQ=255) cACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAAcc < 2:638164/140‑1 (MQ=255) ccGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCg < 1:6868434/139‑1 (MQ=255) aCGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGa > 1:5468877/1‑127 (MQ=255) cGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGc > 2:1266969/1‑140 (MQ=255) cGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGc > 1:577172/1‑140 (MQ=255) gCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAgg < 1:712620/140‑1 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 2:623517/1‑140 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 2:10214427/1‑140 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 2:6037796/1‑140 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 1:3790678/1‑140 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGGTGTGATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 2:434697/1‑140 (MQ=255) ggTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTa > 1:3034500/1‑140 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGa > 2:4178489/1‑127 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGa < 1:4178489/127‑1 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa > 1:5303761/1‑140 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa > 1:9575152/1‑140 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa > 1:8088714/1‑140 (MQ=255) aTTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGtt < 1:1455260/140‑1 (MQ=255) tttGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTg > 2:2079078/1‑140 (MQ=255) tGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGAc < 1:477443/140‑1 (MQ=255) tGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGGCTGGTGGCACAACCCTGGGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAATTCTTGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGc > 2:5312277/1‑140 (MQ=255) tGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt < 1:9192708/127‑1 (MQ=255) tGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGc > 1:9713594/1‑140 (MQ=255) tGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGc > 1:6088386/1‑140 (MQ=255) gTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCtt < 2:3537565/140‑1 (MQ=255) ttGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGc < 2:8783852/140‑1 (MQ=255) cTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTaaaa > 1:2383212/1‑87 (MQ=255) tGGCGAAAATGCCGCACTAGGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAAc < 2:7207109/140‑1 (MQ=255) gCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAg > 2:8078546/1‑140 (MQ=255) gCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAg < 2:3810733/140‑1 (MQ=255) cGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAgg < 2:3371160/140‑1 (MQ=255) cGAAAATGCCGCACTAGGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAgg < 1:4009461/140‑1 (MQ=255) aCTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAAcgcg < 2:8488837/140‑1 (MQ=255) tATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGcc < 1:1162090/140‑1 (MQ=255) tATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGcc < 1:7512669/140‑1 (MQ=255) tGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCaa > 2:9864075/1‑140 (MQ=255) tGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCaa > 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cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa < 2:10339186/140‑1 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa > 2:2688554/1‑140 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa < 1:8554061/140‑1 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa < 2:1835363/140‑1 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa > 1:253848/1‑140 (MQ=255) caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 1:5375824/140‑1 (MQ=255) caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 1:4354849/140‑1 (MQ=255) caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 1:1981394/140‑1 (MQ=255) caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 2:5246565/140‑1 (MQ=255) caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 2:10514514/140‑1 (MQ=255) cccTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCtt > 2:2300324/1‑140 (MQ=255) gCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGTACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCTGt > 2:1949104/1‑140 (MQ=255) gCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGt > 2:9740777/1‑140 (MQ=255) cGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTa > 1:8975212/1‑140 (MQ=255) cGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTa < 2:5057997/140‑1 (MQ=255) gttgttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTac < 1:101428/140‑1 (MQ=255) tgttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTacac < 1:1105682/140‑1 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCtt > 1:1026467/1‑130 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 1:6506921/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 1:4964363/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 2:7123343/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 1:10625373/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 1:1851753/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTAGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTa > 1:2789353/1‑135 (MQ=255) tATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGc < 2:6782611/140‑1 (MQ=255) tATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGc < 2:9553159/140‑1 (MQ=255) ttGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTa < 1:10842107/140‑1 (MQ=255) ttGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTa < 1:2282948/140‑1 (MQ=255) tggCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGACACCTCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGAAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTa < 2:10765621/138‑1 (MQ=255) gCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACa > 2:5906310/1‑140 (MQ=255) gCGGGTCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACa > 1:4051733/1‑140 (MQ=255) tCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCaaa > 2:5409323/1‑140 (MQ=255) tCGCGCGATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCaaa > 1:7908125/1‑140 (MQ=255) cgcgATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGaa < 2:8241106/140‑1 (MQ=255) cgcgATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGaa > 2:4832128/1‑140 (MQ=255) cgcgATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGaa > 2:7675470/1‑140 (MQ=255) cgcgATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGaa < 2:3036986/140‑1 (MQ=255) gcgATGCA‑GTTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAAt < 1:8756529/140‑1 (MQ=255) | TGCCGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑GTT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGC > NZ_CP025268/1013380‑1013651 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |