| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 2,033,768 | (C)5→6 | pseudogene (190/920 nt) | yedA → | drug/metabolite exporter YedA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 2,033,763 | 1 | . | C | 98.0% | 1691.5 / 22.0 | 493 | pseudogene (185/920 nt) | yedA | drug/metabolite exporter YedA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (6/4); new base C (247/235); total (254/239) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.52e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 555 total aligned reads displayed.
TTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACT‑CCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGCC > NZ_CP025268/2033624‑2033897 | ttGTATATCATTTGGGGCTCAACCACGTTTGTCATTCGTATTGGCGTGGAGAGCTGGCCTCCGTTACTGATGGCGGGCTTTAGATTCCTGGCAGCCTGTATTTTATTTCTGGCATTTTTGCTCGTGCGAGGTCAGAAACt > 2:5830287/1‑140 (MQ=255) gTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACT‑cc > 1:6771193/1‑140 (MQ=255) gTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACT‑cc > 2:10150684/1‑140 (MQ=255) gTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACT‑cc > 2:3920947/1‑140 (MQ=255) tataTCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACT‑ccc < 2:822084/140‑1 (MQ=255) atatCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACT‑ccc‑c > 2:5652553/1‑140 (MQ=255) atatCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACT‑ccc‑c > 2:4038169/1‑140 (MQ=255) atCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACT‑ccc‑c‑cc > 1:7629216/1‑139 (MQ=255) cATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACT‑ccc‑c‑ccgc > 2:5570586/1‑137 (MQ=255) cATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACT‑ccc‑c‑ccgc > 1:1274363/1‑137 (MQ=255) tttGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACT‑ccc‑c‑ccgcta > 1:965105/1‑135 (MQ=255) ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACga > 1:5091065/1‑139 (MQ=255) ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGt > 2:1548300/1‑140 (MQ=255) ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGt > 2:7928735/1‑140 (MQ=255) ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGt > 2:2736663/1‑140 (MQ=255) ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGt > 1:10450257/1‑140 (MQ=255) ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGt > 1:7927824/1‑140 (MQ=255) ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGt > 1:1024922/1‑140 (MQ=255) ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGt > 2:8576183/1‑140 (MQ=255) ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGt > 1:7545881/1‑140 (MQ=255) ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGt > 1:739018/1‑140 (MQ=255) ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGt > 2:6285089/1‑140 (MQ=255) ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGt > 2:2980258/1‑140 (MQ=255) ggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACT‑CCCAC‑C‑GCTACGTcc > 2:8403449/1‑140 (MQ=255) cTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCgc > 1:3861235/1‑140 (MQ=255) cTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTAGTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCgc > 1:8532555/1‑140 (MQ=255) aaCCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCgctgc > 2:2641248/1‑140 (MQ=255) aaCCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCgctgc > 1:10351418/1‑140 (MQ=255) aaCCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCgctgc > 1:4164749/1‑140 (MQ=255) gTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTCATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATATTATTGCTGGCCTTATTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCcgc > 2:371035/1‑140 (MQ=255) gTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCcgc < 2:8861222/140‑1 (MQ=255) gTCAGTCGGATTGGCGAGGAACGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGTGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCcgc < 2:10305821/140‑1 (MQ=255) cATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCgcgc < 1:8586405/140‑1 (MQ=255) ttCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTg > 2:2916708/1‑140 (MQ=255) tCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGa < 1:1367641/140‑1 (MQ=255) cGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGAt < 1:616881/140‑1 (MQ=255) cGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGAt > 1:4584197/1‑140 (MQ=255) ttGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGc < 1:1811130/140‑1 (MQ=255) gCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTg < 1:9920977/140‑1 (MQ=255) cGTGGAAAGCAGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGt > 1:10177930/1‑140 (MQ=255) tGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTa < 2:9593613/140‑1 (MQ=255) gAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTAtt > 1:808327/1‑140 (MQ=255) aaGCTTGCCTCCGTTAATGATGGCGTGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGTCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCTCTGATTGGCCTGTTATTgc < 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ggCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctggct < 2:8913196/140‑1 (MQ=255) gCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctggctg < 1:3532000/140‑1 (MQ=255) tCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCg > 1:3977378/1‑140 (MQ=255) ccGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCgg < 1:3664241/140‑1 (MQ=255) atAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTaa < 1:6559298/139‑1 (MQ=255) atgatgGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATgg < 1:9755086/140‑1 (MQ=255) gatgGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCa < 1:5435517/140‑1 (MQ=255) ggcgggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctggctg > 1:2521217/1‑125 (MQ=255) ggcgggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATgg > 1:2814490/1‑140 (MQ=255) ggcgggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCGGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATgg > 1:5258498/1‑140 (MQ=255) ggcgggcgTTAGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTAGTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATgg > 2:7421389/1‑140 (MQ=255) cgggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTg > 1:10022399/1‑110 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> 1:5899216/1‑140 (MQ=255) cTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCAt > 2:4351690/1‑140 (MQ=255) cTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCAt > 2:7079916/1‑140 (MQ=255) ggCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTg < 1:10614109/79‑1 (MQ=255) ggCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGc > 2:5324134/1‑97 (MQ=255) ggCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATcg > 1:1169333/1‑140 (MQ=255) ggCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATcg < 2:10536679/140‑1 (MQ=255) 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2:4811852/140‑1 (MQ=255) aaaCTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGcc < 2:7555993/140‑1 (MQ=255) aaaCTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGcc < 2:6523616/140‑1 (MQ=255) aaaCTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGcc < 2:2405338/140‑1 (MQ=255) aaaCTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGcc < 1:2221853/140‑1 (MQ=255) aaaCTCCCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGcc < 1:8861989/140‑1 (MQ=255) aaaCTCCCC‑C‑C‑GCGTCGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGcc < 2:5091289/140‑1 (MQ=255) | TTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACT‑CCC‑C‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGCC > NZ_CP025268/2033624‑2033897 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |