New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NZ_CP025268 | = 1293101 | 1 (0.000) | 181 (0.350) | 64/226 | 2.3 | 52.5% | noncoding (114/132 nt) | CXP41_RS06840 | RtT sRNA |
? | NZ_CP025268 | 1293574 = | 327 (0.620) | noncoding (66/85 nt) | CXP41_RS06855 | tRNA‑Tyr |
Only 100 of 314 total aligned reads displayed.
GCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGT > NZ_CP025268/1292962‑1293240 | cAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaa > 2:4985458‑M1/1‑136 (MQ=255) ctctctCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttc > 2:1510258‑M1/1‑131 (MQ=255) cGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgac < 1:73349‑M1/140‑22 (MQ=255) gCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacg > 1:827987‑M1/1‑118 (MQ=255) tCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggc > 2:6544503‑M1/1‑116 (MQ=255) cGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggca < 1:3847413‑M1/140‑26 (MQ=255) gAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTAGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagattta > 2:10412845‑M1/1‑109 (MQ=255) aCCTTTGTCGAAGCTTCTCATCGTTCCACGCTTGGGCAGAATATTTTATTGCGTATGAGTTGGGTAGTTCAGTGACTTTTGTAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttaca < 1:59493‑M1/140‑34 (MQ=255) aCCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttaca < 1:8330798‑M1/140‑34 (MQ=255) ggtcgAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctg < 2:5446821‑M1/138‑39 (MQ=255) ggtcgAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctg > 1:5920623‑M1/3‑102 (MQ=255) ggtcgAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctg < 1:7271975‑M1/138‑39 (MQ=255) ggtcgAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctg < 2:6282283‑M1/138‑39 (MQ=255) ggtcgAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctg < 2:8227357‑M1/138‑39 (MQ=255) gtcGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgc > 2:9712039‑M1/2‑101 (MQ=255) cgtatcttctcATCCTTCCCCGCTTGGGCATACTATTTAATTGCGGATTCGTTTGTTATTTCTGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctc < 1:8837241‑M1/135‑42 (MQ=255) aaGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGACGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccc > 2:5693223‑M1/1‑97 (MQ=255) aaGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtcttctccc > 1:404133‑M1/1‑97 (MQ=255) gCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctt > 1:782356‑M1/1‑95 (MQ=255) ctcATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggc < 1:1714519‑M1/140‑50 (MQ=255) ctcATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggc < 2:910822‑M1/140‑50 (MQ=255) ctcATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggc > 2:7059334‑M1/1‑91 (MQ=255) ctcATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggc < 1:1835456‑M1/140‑50 (MQ=255) ctcATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggc < 2:1804920‑M1/140‑50 (MQ=255) tcATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggcc < 2:3103851‑M1/140‑51 (MQ=255) tcATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggcc < 1:1469081‑M1/140‑51 (MQ=255) cATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAAGTGCGGATTCGTTGGGTAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccg < 2:5350773‑M1/140‑52 (MQ=255) cATCCGTCCCCGCATGGGCAGAATAATTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccg < 2:8649474‑M1/140‑52 (MQ=255) ttCCCCGCCTGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTGTTGAAAGTGATGGTGGGGGGGGCAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagagttacaggctgctccctttggacgcgcgg > 2:10763662‑M1/1‑84 (MQ=255) ttCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgg > 1:1254148‑M1/1‑84 (MQ=255) ttCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgg > 1:2243630‑M1/1‑84 (MQ=255) ttCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgg > 2:2388139‑M1/1‑84 (MQ=255) ttCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgg > 1:6856507‑M1/1‑84 (MQ=255) tCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcggg > 2:5503469‑M1/1‑83 (MQ=255) tCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGAGGGTGGTGGGGGAAGGATTcgcaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctcccattggccgctcggg > 2:5915423‑M1/1‑83 (MQ=255) tCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGGTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcggg > 2:9836338‑M1/1‑83 (MQ=255) ccccGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcggga > 1:8665248‑M1/1‑82 (MQ=255) ccGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaac < 2:4329291‑M1/140‑61 (MQ=255) gCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccggtcgctaaaac > 1:3432882‑M1/1‑78 (MQ=255) cATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaacccc > 2:7509095‑M1/1‑77 (MQ=255) aTGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaccccca > 2:1071376‑M1/1‑76 (MQ=255) gggCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGACGCAATcgaaccttcgaagtcgattacggcagataaacagtctgcaccctttggccgctccggaaccccacc > 2:3346781‑M1/1‑74 (MQ=255) ggCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccacca > 1:1798633‑M1/1‑73 (MQ=255) cAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccagg > 1:2718680‑M1/1‑71 (MQ=255) gAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccagggg > 1:3487816‑M1/1‑69 (MQ=255) tGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccaggggtaattcaaatt > 2:2192251‑M1/1‑58 (MQ=255) tGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccaggggtaattcaaatt > 1:2603042‑M1/1‑58 (MQ=255) cGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaacc < 1:9293873‑M1/117‑62 (MQ=255) gATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggaaatgctatttagt > 2:5028424‑M1/1‑54 (MQ=255) ttGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctg < 1:5693223‑M1/140‑93 (MQ=255) gTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGAGCTGCGCGCTACGCCCATCTGGTCGTTGCCAGCGGCAACGCTCTCAAGCTGGCGCTCTAGTCGAAACTTGGTCGAAGCTTAACAACCTTccc > 1:9077593/1‑140 (MQ=11) tttGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctg < 1:6432776‑M1/68‑39 (MQ=255) tttGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctg > 2:6432776‑M1/1‑30 (MQ=255) gTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgca < 2:3831685‑M1/140‑118 (MQ=255) gTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgc < 1:10020899‑M1/75‑53 (MQ=255) gATGGTGGTGGGGGAAGGATTctaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccagggggtaatgctttttaatggacttcaacctgatctggaagcggggcgcatc > 2:3422586‑M1/1‑21 (MQ=255) tggtggtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcat > 1:3524022‑M1/1‑19 (MQ=255) tggtggtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcat > 2:409857‑M1/1‑19 (MQ=255) tggtggtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcat > 2:5309603‑M1/1‑19 (MQ=255) tggtggtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcat > 1:7477505‑M1/1‑19 (MQ=255) tggtggtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcat > 2:8691633‑M1/1‑19 (MQ=255) tggtggtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatc < 2:6690935‑M1/138‑120 (MQ=255) ggtggtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcata < 1:2967237‑M1/140‑123 (MQ=255) gtggtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatat > 1:9531451‑M1/1‑17 (MQ=255) tggtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatc < 2:2504193‑M1/140‑125 (MQ=255) tggtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagt < 1:4661113‑M1/51‑36 (MQ=255) gtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaa > 1:7262701‑M1/1‑14 (MQ=255) gtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaa > 1:8600804‑M1/1‑14 (MQ=255) gtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaa > 2:10036829‑M1/1‑14 (MQ=255) gtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaa > 1:9775325‑M1/1‑14 (MQ=255) gtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaa > 1:3780505‑M1/1‑14 (MQ=255) gtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctg < 1:4883892‑M1/52‑39 (MQ=255) gtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacgg < 1:2007400‑M1/37‑24 (MQ=255) tggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctacctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaa > 2:1116498‑M1/1‑13 (MQ=255) tggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctg < 1:9860060‑M1/51‑39 (MQ=255) gggggAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaat > 2:2864897‑M1/1‑12 (MQ=255) ggggAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatg > 1:8137657‑M1/1‑11 (MQ=255) ggggAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatg > 1:4178896‑M1/1‑11 (MQ=255) ggggAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggta < 1:452287‑M1/85‑75 (MQ=255) ggggAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctcccgttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatg > 2:1465874‑M1/1‑11 (MQ=255) ggggAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttac < 1:5178061‑M1/43‑33 (MQ=255) ggggAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttac > 2:5178061‑M1/1‑11 (MQ=255) gggAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgca > 1:5281080‑M1/1‑10 (MQ=255) ggAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgac > 1:6588542‑M1/1‑9 (MQ=255) ggAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgac > 2:4882078‑M1/1‑9 (MQ=255) gAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacg < 2:7785927‑M1/140‑133 (MQ=255) gAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacg < 1:10199957‑M1/140‑133 (MQ=255) gAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacg < 2:4618660‑M1/140‑133 (MQ=255) gAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcacatcaaatgacg < 2:4732898‑M1/140‑133 (MQ=255) aGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcg < 1:6050230‑M1/140‑135 (MQ=255) aGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcg < 1:6230625‑M1/140‑135 (MQ=255) aGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcg > 1:7696540‑M1/1‑6 (MQ=255) aGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcg > 1:3263338‑M1/1‑6 (MQ=255) aGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcg > 2:4468186‑M1/1‑6 (MQ=255) aGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcg < 2:9471955‑M1/140‑135 (MQ=255) aGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcg < 2:1915389‑M1/140‑135 (MQ=255) aGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctc > 2:7268584‑M1/1‑6 (MQ=255) aTTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcgccg < 1:5495823‑M1/140‑138 (MQ=255) aTTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctatttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcgccg < 1:10736395‑M1/140‑138 (MQ=255) tcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcgccgct > 1:10528959‑M1/1‑1 (MQ=255) | GCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGT > NZ_CP025268/1292962‑1293240 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |