| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP025268 | 1292725 = | 484 (0.780) | 191 (0.370) | 67/224 | 2.0 | 44.5% | intergenic (+182/+2) | narI/CXP41_RS06830 | respiratory nitrate reductase subunit gamma/RtT sRNA |
| ? | NZ_CP025268 | = 1293258 | 68 (0.130) | intergenic (‑44/+3) | CXP41_RS06840/CXP41_RS06845 | RtT sRNA/tRNA‑Tyr | |||||
Only 100 of 346 total aligned reads displayed.
CGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGA > NZ_CP025268/1293120‑1293392 | cGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTg < 2:7515880‑M2/140‑2 (MQ=255) gCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTga > 1:2028266‑M2/1‑138 (MQ=255) cccTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCATCGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgat > 1:2427303‑M2/1‑137 (MQ=255) ccTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatg > 1:1752389‑M2/1‑136 (MQ=255) gggTCGTTGCCGGCGGCTACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTGAGTCGACGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGAGTGCGGAGTCGCTGGAGAGTTCAGGGACTTGTGAAAGTgatggtggt > 2:10196832‑M2/1‑131 (MQ=255) gggTCGTTGCCAGCGGCAACGCTCTCACGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCGTCCCCGCCAGGGCAGAATATTTGATTTCGGATTCGCTTGATAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGAtggtggt > 1:7379710/1‑140 (MQ=11) gTCGTTGCCTGCGGCCACGCTCTCTCGCTGACGCGCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCATCCCCGCATGGGCCGAATATTTTATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACGGTTGAAAGAGAtggtggtgg > 1:1654086/1‑140 (MQ=11) gtcgCCAGCGGCAACGCACTCTCGCCGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATGCTTCCCCGAATGGGCAGTTTTTTTGTTTTCGTTGTCTCTTTTTTGTTCATTTAATTTTGAAAGTGATGGTGGTggggg < 1:4896588/137‑1 (MQ=2) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtggggg > 2:2492643‑M2/1‑126 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCTAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTTATTGCGGATTCGTTTGTTATTTCAGGGTCTTTTGAAAGTgatggtggtggggg > 1:8508637‑M2/1‑126 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGCAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtggggg > 2:840304‑M2/1‑126 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtggggg > 1:7417691‑M2/1‑126 (MQ=255) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGTAAGTgatggtggtgggggaagga > 2:9160086‑M2/1‑121 (MQ=255) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGACGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaagga > 1:10295380‑M2/1‑121 (MQ=255) gCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGTTTCGCGTGAGTGTTCAGGGACGTTTGAAAGGgatggtggtgggggtaggatt < 2:8235270‑M2/140‑22 (MQ=255) cGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCGTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTGGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTc > 2:7824478/1‑140 (MQ=255) gCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCATGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattact > 2:1086775‑M2/1‑116 (MQ=255) aCGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcag > 1:2692951‑M2/1‑113 (MQ=255) cGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGTGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggcaggattactcagc < 1:565008‑M2/140‑29 (MQ=255) cGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagc < 1:9571695‑M2/140‑29 (MQ=255) cGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCGTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactctgc < 2:6929219‑M2/140‑29 (MQ=255) gacgctcGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTATAGAAAGTgatggtggtgggggtaggagtactcagcgctgcgcgcttc < 2:7100649‑M2/138‑41 (MQ=255) cgcTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCCTCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgc > 1:5359572‑M2/1‑98 (MQ=255) cTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACgg < 1:9848290/140‑1 (MQ=255) cTCCAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCAGCCTTCCCCGCTTGGGCAGTCTATTTTTTTGAGGTTTAGTTGGGTAGTTCAGGGACTTTTGTAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACgg < 1:10741003/140‑1 (MQ=9) cGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgagcgcttcgccctt > 1:10479504‑M2/1‑94 (MQ=255) agtcgAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTGTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgcggcgcgcttcgcccttcgggtcgtggccg < 1:2801794‑M2/138‑60 (MQ=255) gtcGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGATGATTCGATTGAGAATACATGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctg < 2:7467042‑M2/139‑61 (MQ=255) gCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaa < 1:3851007‑M2/140‑67 (MQ=255) gCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtggggg < 2:5622663‑M2/88‑15 (MQ=255) gCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatgg < 1:3236776‑M2/79‑6 (MQ=255) ccTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTAGACACTTCGAAGACGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTGCCTTAGGACGCTc > 2:666147/1‑140 (MQ=17) ttCCCAGCCTGGGCAGATTATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgc > 1:945170‑M2/1‑63 (MQ=255) tCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgct < 2:121199‑M2/140‑79 (MQ=255) ccccGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctg < 1:3661281‑M2/140‑80 (MQ=255) ccccGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgcactctcgctg < 1:8062900‑M2/140‑80 (MQ=255) cccGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggacggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctgg < 1:7963617‑M2/140‑81 (MQ=255) cccGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctgg < 1:8950706‑M2/140‑81 (MQ=255) ccGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcg < 1:4112674‑M2/100‑42 (MQ=255) ccGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcg > 2:4112674‑M2/1‑59 (MQ=255) gcttGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCTGATGTACTGTCAGCTCCCTGAGGGCGCTCGGGAAccc > 2:5861614/4‑140 (MQ=18) gCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagagctgcgcgcttcgcccatcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgc < 2:6753775‑M2/140‑84 (MQ=255) cATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgct < 2:3946895‑M2/140‑85 (MQ=255) cATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGATTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgct > 2:286372‑M2/1‑56 (MQ=255) aTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctc > 1:4482347‑M2/1‑55 (MQ=255) gggCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTGTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcatcgcccttcgggtcgttgccggaggcaacgctctctcgctgtcgctcga < 2:3049890‑M2/140‑88 (MQ=255) gCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagt < 2:9270350‑M2/140‑90 (MQ=255) gCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgaggcaacgatctctcgcttgcgctcgaat < 1:1184886‑M2/140‑90 (MQ=255) gCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgccctacgggtcgtggaatgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagt < 2:4343593‑M2/140‑90 (MQ=255) aattatatttgaTTGCGGATTCGATTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtc > 2:1257870‑M2/5‑50 (MQ=255) aGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcg > 1:7510089‑M2/1‑49 (MQ=255) atTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaacct > 1:9032964‑M2/1‑44 (MQ=255) tGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcga < 1:10074139‑M2/140‑104 (MQ=255) tGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcga < 2:982553‑M2/140‑104 (MQ=255) tGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcga < 2:4573518‑M2/140‑104 (MQ=255) tGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcatgcggcaacgatctctcgctggcgctcgattagaacctttgtcga < 2:1461084‑M2/140‑104 (MQ=255) tGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattacacagcgcggcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgcgctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcga < 2:3768175‑M2/140‑104 (MQ=255) tGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaagga < 1:8599915‑M2/56‑20 (MQ=255) tGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtggggg < 2:10369140‑M2/51‑15 (MQ=255) gCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaa > 1:3403977‑M2/1‑36 (MQ=255) cGGATTCGCTTGAGAGTTCATGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaacttggtcgaag < 2:4022030‑M2/140‑106 (MQ=255) cGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgcacctttgtcgaag < 2:7722546‑M2/140‑106 (MQ=255) cGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaag < 2:529852‑M2/140‑106 (MQ=255) cGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgaatcgaaccttggtcgaag < 1:6229974‑M2/140‑106 (MQ=255) cGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctcgctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaag < 2:7592818‑M2/140‑106 (MQ=255) ttCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttc > 2:3820995‑M2/1‑31 (MQ=255) ggaagTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCt < 2:5963083/137‑1 (MQ=255) agagTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatcctt < 1:3721306‑M2/140‑118 (MQ=255) gagTTCCGGGACATTAGAAAGGgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttc > 1:7590100‑M2/1‑22 (MQ=255) gagTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaa < 1:6379839‑M2/126‑105 (MQ=255) gTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTgag < 1:5164141/140‑1 (MQ=255) gTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTgag > 2:8996862/1‑140 (MQ=255) ttctcggACTTTTGTAAGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTgaga < 2:3456914/135‑1 (MQ=255) ttCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTTCTCCCATTTGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTAAAATTTTGATGTAATGCTTgaga > 1:3036429/1‑140 (MQ=21) ttCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTgaga < 1:1251661/140‑1 (MQ=255) ttCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTgaga < 2:487669/140‑1 (MQ=255) tCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGAt < 1:6595779/140‑1 (MQ=255) tCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGAt < 1:5858106/140‑1 (MQ=255) tCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGAt < 1:2373195/140‑1 (MQ=255) cAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGAtg > 2:7768169/1‑140 (MQ=255) cAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGAtg < 2:8062899/140‑1 (MQ=255) aGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaagga > 2:1415696‑M2/1‑16 (MQ=255) aGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaagga < 1:1415696‑M2/35‑20 (MQ=255) ggACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatg < 2:883642‑M2/140‑127 (MQ=255) ggACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctcactcgctggcgctcgagacgaaactaggtccaagcttctcatccttccccgcatg < 2:1970912‑M2/140‑127 (MQ=255) ggACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGAtggtg > 2:174221/1‑140 (MQ=255) gACTTTTGAAAGTGATGGTTGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGAtggtgg < 1:529852/140‑1 (MQ=255) aCTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatggg > 2:3371373‑M2/1‑12 (MQ=255) aCTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgcggcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatggg > 1:7100650‑M2/1‑12 (MQ=255) cTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggc < 2:503385‑M2/140‑130 (MQ=255) tttGAAAGTgatggtggtgggggacggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgcgctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggcag < 2:10685664‑M2/140‑132 (MQ=255) tttGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcg > 2:63243‑M2/1‑9 (MQ=255) tttGAAAGTGATTGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGACTGATCCAGTTGGCCGGTCGGGAACCCCACCTGGGGGTATGCAAATATTGAGGTTATCGGTGTGATGGTGGTggg > 2:7900687/1‑140 (MQ=17) tttGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTggg > 1:8183609/1‑140 (MQ=255) tttGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGGAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTggg > 1:683304/1‑140 (MQ=255) tGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAGTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGTTGTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACGAGGGGTAATTCAATTATTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTggggg < 1:664401/140‑1 (MQ=21) gAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGa < 1:3009310/140‑1 (MQ=255) aaGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaa < 1:7742986‑M2/108‑105 (MQ=255) aGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgc > 2:2344041‑M2/1‑3 (MQ=255) aGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgc < 1:7823664‑M2/36‑34 (MQ=255) | CGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGA > NZ_CP025268/1293120‑1293392 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |