Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 1,397,708 | A→G | *300* (TAA→TAG) | pgrR → | DNA‑binding transcriptional regulator PgrR |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 1,397,708 | 0 | A | G | 99.8% | 1587.4 / NA | 455 | *300* (TAA→TAG) | pgrR | DNA‑binding transcriptional regulator PgrR |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (166/288); minor base T (0/1); total (166/289) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 493 total aligned reads displayed.
GAAAAAAAACTGATACGTGTTTTGGATAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAACACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCG > NZ_CP025268/1397571‑1397844 | gAAAAAAAACTGATACGTGTTTTGGATCAATACACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAgca < 2:8261674/140‑1 (MQ=255) gAAAAAAAACTGATACGTGTTTTGGATAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAgca < 1:459915/140‑1 (MQ=255) gAAAAAAAACTGATACGTGTTTTGGATAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAgca < 1:9037657/140‑1 (MQ=255) aaaaaaaaCTGATACGTGTTTTGGATAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAgcac > 1:1172602/1‑140 (MQ=255) aaaaaaaCTGATACGTGTTTTGGATAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCact > 2:9198587/1‑140 (MQ=255) aaaaaaCTGATACGTGTTTTGGATAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCacta < 2:10394356/140‑1 (MQ=255) aaaaaaCTGATACGTGTTTTGGATAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCacta < 2:236348/140‑1 (MQ=255) aaaaaaCTGATACGTGTTTTGGATAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCacta < 1:2433676/140‑1 (MQ=255) aaaaCTGATACGTGTTTTGGATAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCactact > 2:518941/1‑140 (MQ=255) aaaaCTGATACGTGTTTTGGATAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCactact < 1:1026859/140‑1 (MQ=255) aaCTGATACGTGTTTTGGATAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTg < 2:1445116/140‑1 (MQ=255) cTGATACGTGTTTTGGATATATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCt < 2:8082647/140‑1 (MQ=255) cTGATACGTGTTTTGGATAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCt < 2:4961651/140‑1 (MQ=255) cTGATACGTGTTTTGGATAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCt < 1:7097031/140‑1 (MQ=255) gATACGTGTTTTGGATAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGa < 1:9174840/140‑1 (MQ=255) gATACGTGTTTTGGATAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGa < 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ttttGGATAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACAttaa > 1:6649256/1‑140 (MQ=255) ttGGATAAATTCACACCAGATTTACCCCGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACAttaatt < 1:7789242/140‑1 (MQ=255) tGGATAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACAttaattt > 1:10214525/1‑140 (MQ=255) tGGATAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACAt < 1:9357389/134‑1 (MQ=255) tGGATAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACAt > 2:9357443/1‑134 (MQ=255) aaaTTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACTTGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAAttc < 1:4181728/140‑1 (MQ=255) aaaTTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAAttc < 1:2609751/140‑1 (MQ=255) aaaTTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAAttc < 1:7640142/140‑1 (MQ=255) aTTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAAttctt > 1:9879020/1‑140 (MQ=255) aTTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGATGGCTCGGCATGCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATAAATTAATTTAAttctg > 1:6078497/1‑139 (MQ=255) cacCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCtt < 2:5315014/140‑1 (MQ=255) cacCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCtt > 2:7700948/1‑140 (MQ=255) cAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACCCCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTATTAAc < 2:1915662/140‑1 (MQ=255) gATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGt < 1:10777847/140‑1 (MQ=255) gATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGt < 2:1257772/140‑1 (MQ=255) cGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAg < 2:7923018/140‑1 (MQ=255) tACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGa > 2:10101520/1‑91 (MQ=255) tACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACAttaa > 2:6531418/1‑99 (MQ=255) tACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGt > 1:2205378/1‑140 (MQ=255) tACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAAGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTa > 2:9758818/1‑120 (MQ=255) aCTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGtt < 1:3961826/140‑1 (MQ=255) tCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTgg < 1:3606730/140‑1 (MQ=255) tCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTgg > 2:4085434/1‑140 (MQ=255) tCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTgg > 1:10002350/1‑140 (MQ=255) tCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTgg > 1:3230212/1‑140 (MQ=255) tCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACAGTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTgg > 1:4845239/1‑140 (MQ=255) cacaCCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTc < 2:7332858/140‑1 (MQ=255) cacaCCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTc < 1:1306210/140‑1 (MQ=255) cacaCCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTc < 1:5560915/140‑1 (MQ=255) acCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAAttctt > 1:10611702/1‑99 (MQ=255) cGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTc > 2:6772902/1‑135 (MQ=255) cGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTc < 1:6772903/135‑1 (MQ=255) cGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCAtttt > 1:4423108/1‑140 (MQ=255) tCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCAtttttt > 1:651605/1‑140 (MQ=255) cGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTa > 1:6250463/1‑140 (MQ=255) cGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTa > 2:3714665/1‑140 (MQ=255) aCATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTAtt < 1:7948767/140‑1 (MQ=255) aCATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTAtt < 1:2766778/140‑1 (MQ=255) aCATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTAtt < 2:10817291/140‑1 (MQ=255) aTGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTTATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTAttct < 2:1061378/140‑1 (MQ=255) aTGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTAttct < 2:27582/140‑1 (MQ=255) cTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACa < 1:3098293/140‑1 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atttatAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCt < 2:9549192/140‑1 (MQ=255) tagatagGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTa > 1:3707980/1‑140 (MQ=255) gatagGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGa > 2:2568154/1‑43 (MQ=255) gatagGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTCACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATg < 2:6986415/140‑1 (MQ=255) ggCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATAc > 2:6868137/1‑140 (MQ=255) gCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATg > 2:5635874/1‑126 (MQ=255) gCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATAcc > 2:7189287/1‑140 (MQ=255) gCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATAcc > 1:9587107/1‑140 (MQ=255) aaGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTa > 2:4455495/1‑63 (MQ=255) aaGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTc < 2:393466/90‑1 (MQ=255) aaGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCt < 1:1652013/124‑1 (MQ=255) aGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATtct > 2:3120398/1‑66 (MQ=255) aGTATAAAGGTGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGaaaa < 1:407497/140‑1 (MQ=255) 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tGCTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGaa < 2:7253828/140‑1 (MQ=255) cTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGtt < 1:5776635/59‑1 (MQ=255) cTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATg < 1:199117/109‑1 (MQ=255) cTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATg > 2:199467/1‑109 (MQ=255) cTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACg > 1:8139238/1‑140 (MQ=255) cTGTTTAGCACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACg > 1:7376224/1‑140 (MQ=255) 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(MQ=255) | GAAAAAAAACTGATACGTGTTTTGGATAAATTCACACCAGATTTACCCGGTTATCACCTGTACTATCCACACCGTCGACATGCTGGCTCGGCATTCTCATTATTTATAGATAGGCTGAAGTATAAAGGTGCTGTTTAACACTACTTGCTGATACATTAATTTAATTCTTCTCTTAACGTATTCTCAGTTCCTTTCAACGTTTTGGTCATTTTTTATTCTTCGTACAATGGCGACAGATGCTGATTATGATACCGAAAACGGGTTTGAACGTGCG > NZ_CP025268/1397571‑1397844 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |