Predicted mutation | ||||||
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RA | NZ_CP025268 | 1,549,203 | T→C | pseudogene (1331/1331 nt) | CXP41_RS08190 ← | leucine‑rich repeat domain‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NZ_CP025268 | 1,549,203 | 0 | T | C | 100.0% | 1073.2 / NA | 307 | pseudogene (1331/1331 nt) | CXP41_RS08190 | leucine‑rich repeat domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (145/162); total (145/162) |
Only 100 of 307 total aligned reads displayed.
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |