| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 2,026,646 | A→G | *246* (TAA→TAG) | fliP → | flagellar type III secretion system pore protein FliP |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 2,026,646 | 0 | A | G | 99.8% | 1950.9 / ‑5.2 | 560 | *246* (TAA→TAG) | fliP | flagellar type III secretion system pore protein FliP |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (318/241); total (319/241) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 | |||||||||||
Only 100 of 564 total aligned reads displayed.
GCCAGCGTGTTGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAAAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCACG > NZ_CP025268/2026509‑2026781 | gCGTGTTGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGc < 1:377827/140‑1 (MQ=255) gCGTGTTGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGc > 1:99038/1‑140 (MQ=255) cGTGTTGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCa > 1:2551054/1‑140 (MQ=255) ttGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAAt < 2:237575/140‑1 (MQ=255) gATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGa > 2:5793061/1‑140 (MQ=255) gATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGa < 1:10742110/140‑1 (MQ=255) gATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGa > 1:4011816/1‑140 (MQ=255) gCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACAcc < 1:6840618/140‑1 (MQ=255) gCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACAcc > 1:1374716/1‑140 (MQ=255) tGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGaa > 1:5405111/1‑140 (MQ=255) gtggATGATGATGGTTCCGCCAGCCACCAGTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCGGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGAAATTGCTGGTCTGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAAt < 2:7290001/138‑1 (MQ=255) ggggATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAAt < 2:2691166/140‑1 (MQ=255) ggggATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAAt < 1:1626940/140‑1 (MQ=255) ggggATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAAt < 1:5507710/140‑1 (MQ=255) ggggATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAAt < 1:7172864/140‑1 (MQ=255) ggggATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAAt < 1:10386372/140‑1 (MQ=255) gggATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATc < 2:3200346/140‑1 (MQ=255) gatgatgGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCa > 1:4472640/1‑140 (MQ=255) gatgatgGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCa > 2:43600/1‑140 (MQ=255) tgGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCatgatg > 1:4210039/1‑140 (MQ=255) tgGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCatgatg < 2:8051766/140‑1 (MQ=255) tgGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCatgatg > 1:2199046/1‑140 (MQ=255) tgGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCatgatg > 2:8492580/1‑140 (MQ=255) gTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCatgatgat > 1:3317865/1‑140 (MQ=255) gTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCatgatgat < 1:2761336/140‑1 (MQ=255) gTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCatgatgat < 2:3575951/140‑1 (MQ=255) gTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCatgatgat < 1:5727635/140‑1 (MQ=255) cccccAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATggg > 2:4265027/1‑140 (MQ=255) cccccAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATggg < 2:4687815/140‑1 (MQ=255) ccccAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATgggg > 2:6554329/1‑140 (MQ=255) cccAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGa > 1:8253029/1‑140 (MQ=255) cccAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACATGAATCGGTCATGATGATGGGGa < 2:3721899/140‑1 (MQ=255) ccAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGAc > 2:9404995/1‑140 (MQ=255) aGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTg > 2:7778703/1‑140 (MQ=255) gCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGa > 2:1004396/1‑140 (MQ=255) gCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGa > 2:2906331/1‑140 (MQ=255) ccaccaTTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGaa > 2:1138533/1‑140 (MQ=255) ccaccaTTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGaa < 1:7827271/140‑1 (MQ=255) ctctGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGaaa > 1:917912/1‑140 (MQ=255) tctGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAACTGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAg > 2:8659878/1‑140 (MQ=255) ctGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGt < 1:7636326/140‑1 (MQ=255) ctGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGt < 2:1182264/140‑1 (MQ=255) gCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGG‑GGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTcgc > 2:8781092/1‑140 (MQ=255) cccTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTcgc > 1:7979920/1‑140 (MQ=255) cccTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTcgc > 2:565164/1‑140 (MQ=255) cccTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTcgc > 2:6291205/1‑140 (MQ=255) cccTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTcgc > 2:10557190/1‑140 (MQ=255) tttAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCt > 2:4009064/1‑140 (MQ=255) tAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTgg > 2:7463470/1‑140 (MQ=255) tGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTg > 1:6188141/1‑140 (MQ=255) aTGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGc < 2:6856714/140‑1 (MQ=255) aTGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGc > 2:4500637/1‑140 (MQ=255) gCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACTCCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTg < 1:8119052/140‑1 (MQ=255) gCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTg < 1:2464877/140‑1 (MQ=255) gCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTg < 1:9425970/140‑1 (MQ=255) gCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTg < 1:4708097/140‑1 (MQ=255) gTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGccc < 1:9404527/140‑1 (MQ=255) gTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGccc < 1:1048589/140‑1 (MQ=255) tttGTACTGGTGGAGGGCTGGCAAGTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGcccc < 2:10261406/140‑1 (MQ=255) ttGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCg < 1:3922878/140‑1 (MQ=255) tGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGTCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGc > 2:3844211/1‑140 (MQ=255) tGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGc > 1:8536455/1‑140 (MQ=255) ggacaggtggATGCCTGGCAATCGCTGGACGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGACCCAAAATGACACCTGACTCGGTCATCATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGACGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCt < 2:10696303/135‑1 (MQ=255) cTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGGTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAtt < 2:2543744/140‑1 (MQ=255) ggtggATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgt > 1:8868667/1‑140 (MQ=255) ggtggATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgt > 1:9580811/1‑140 (MQ=255) ggtggATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTAGCGATGGCACTGGCTGCCCCGCTCttgt > 2:9529058/1‑140 (MQ=255) gtggATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt > 2:1570805/1‑140 (MQ=255) gtggATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt > 2:1463576/1‑140 (MQ=255) gtggATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt > 1:4912453/1‑140 (MQ=255) gtggATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgtt > 1:10658787/1‑140 (MQ=255) tggATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTAttgttg > 1:1943677/1‑140 (MQ=255) gATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTg < 1:1491134/124‑1 (MQ=255) gATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGt > 2:900704/1‑140 (MQ=255) tggctggcAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAg > 1:310953/1‑140 (MQ=255) tggcAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGtt < 1:7013312/140‑1 (MQ=255) tggcAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGtt < 2:5345203/140‑1 (MQ=255) ggcAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTg > 2:1877254/1‑140 (MQ=255) aTTGCTGGTCGGTTCGCTGTCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCATAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGTGGACTGAAGCTATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTTGCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCa < 1:5897917/140‑1 (MQ=255) aTTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCa < 2:1366462/140‑1 (MQ=255) aTTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCa < 2:2192709/140‑1 (MQ=255) aTTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCa < 1:3441097/140‑1 (MQ=255) cTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGTCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACggg > 2:3434932/1‑140 (MQ=255) cTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACggg > 1:6705910/1‑140 (MQ=255) gTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCt > 1:10239297/1‑140 (MQ=255) gTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCt > 1:7299263/1‑140 (MQ=255) tCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCtt < 2:5491837/140‑1 (MQ=255) tCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCtt < 1:6377426/140‑1 (MQ=255) tCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCtt < 1:1137699/140‑1 (MQ=255) ttCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTatca > 2:8328831/1‑140 (MQ=255) tCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTatcat < 2:10439438/140‑1 (MQ=255) tCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTatcat < 2:8202131/140‑1 (MQ=255) tCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTatcat < 1:10016969/140‑1 (MQ=255) ggCGCAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTa < 2:9865329/140‑1 (MQ=255) cAGAGCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTAtttt > 2:4937221/1‑140 (MQ=255) agCTTTTACAGCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCa < 2:5963032/140‑1 (MQ=255) gtACAGCGAGCGAGGCACAATGACACCTGTCGCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGCAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGCTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGgccg < 2:7063534/139‑1 (MQ=255) cgCTAGAGAGGCACAATGACACCTGAATCGGTCATGATGAGGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCAc < 1:5100766/139‑1 (MQ=255) gCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCACg < 1:5976896/140‑1 (MQ=255) gCTAGAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCGTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCACg < 2:4147053/140‑1 (MQ=255) | GCCAGCGTGTTGATGGCATTGGGGATGATGATGGTTCCCCCAGCCACCATTGCTCTGCCCTTTAAACTGATGCTGTTTGTACTGGTGGATGGCTGGCAATTGCTGGTCGGTTCGCTGGCGCAGAGCTTTTACAGCTAAAGAGGCAAAATGACACCTGAATCGGTCATGATGATGGGGACTGAAGCGATGAAAGTCGCGCTGGCACTGGCTGCCCCGCTATTGTTGGTAGCGTTGGTCACGGGCCTTATCATCAGTATTTTGCAGGCCGCCACG > NZ_CP025268/2026509‑2026781 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |