| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NZ_CP025268 | 2,186,072 | T→C | L314L (TTA→CTA) *249* (TAA→TAG) |
yegV → yegW ← |
carbohydrate kinase family protein GntR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NZ_CP025268 | 2,186,072 | 0 | T | C | 100.0% | 2238.0 / NA | 638 | L314L (TTA→CTA) *249* (TAA→TAG) | yegV yegW | carbohydrate kinase family protein GntR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (262/376); total (262/376) | |||||||||||
Only 100 of 639 total aligned reads displayed.
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tGCCGGTGGCGTACTTGCCGGGCTGGCCTCTGGTCTGCCACTGGCGGATGCCGTATTACTGGGCAATGCAGTGGCGTCGTGGGTTGTCGGGCATCGGGGCGGTGATTGTGCGCCAACGCGCGAGGAACTACTCCTCGcac > 2:5352563/1‑140 (MQ=255) gCCGGTGGCGTACTTGCCGGGCTGGCCTCTGGTCTGCCACTGGCGGATGCCGTATTACTGGGCAATGCAGTGGCGTCGTGGGTTGTCGGGCATCGGGGCGGTGATTGTGCGACAACGCGCGAGGAACTACTCCTCGcaca < 1:3553437/140‑1 (MQ=255) gTGGCGTACTTGCCGGGCTGGCCTCTGGTCTGCCACTGGCGGATGCCGTATTACTGGGCAATGCAGTGGCGTCGTGGGTTGTCGGGCATCGGGGCGGTGATTGTGCGCCAACGCGCGAGGAACTACTCCTCGCACACaaa < 1:369437/140‑1 (MQ=255) gTGGCGTACTTGCCGGGCTGGCCTCTGGTCTGCCACTGGCGGATGCCGTATTACTGGGCAATGCAGTGGCGTCGTGGGTTGTCGGGCATCGGGGCGGTGATTGTGCGCCAACGCGCGAGGAACTACTCCTCGCACACaaa < 1:3383015/140‑1 (MQ=255) tGGCGTACTTGCCGGGCTGGCCTCTGGTCTGCCACTGGCGGATGCCGTATTACTGGGCAATGCAGTGGCGTCGTGGGTTGTCGGGCATCGGGGCGGTGATTGTGCGCCAACGCGCGAGGAACTACTCCTCGCACACaaaa < 1:8078580/140‑1 (MQ=255) tGGCGTACTTGCCGGGCTGGCCTCTGGTCTGCCACTGGCGGATGCCGTATTACTGGGCAATGCAGTGGCGTCGTGGGTTGTCGGGCATCGGGGCGGTGATTGTGCGCCAACGCGCGAGGAACTACTCCTCGCACACaaaa < 2:1821221/140‑1 (MQ=255) tGGCGTACTTGCCGGGCTGGCCTCTGGTCTGCCACTGGCGGATGCCGTATTACTGGGCAATGCAGTGGCGTCGTGGGTTGTCGGGCATCGGGGCGGTGATTGTGCGCCAACGCGCGAGGAACTACTCCTCGCACACaaaa < 1:4866601/140‑1 (MQ=255) ggCGTACTTGCCGGGCTGGCCTCTGGTCTGCCACTGGCGGATGCCGTATTACTGGGCAATGCAGTGGCGTCGTGGGTTGTCGGGCATCGGGGCGGTGATTGTGCGCCAACGCGCGAGGAACTACTCCTCGCACACaaaaa > 1:7055504/1‑140 (MQ=255) ggCGTACTTGCCGGGCTGGCCTCTGGTCTGCCACTGGCGGATGCCGTATTACTGGGCAATGCAGTGGCGTCGTGGGTTGTCGGGCATCGGGGCGGTGATTGTGCGCCAACGCGCGAGGAACTACTCCTCGCACACaaaaa < 1:2518793/140‑1 (MQ=255) gCGTACTTGCCGGGCTGGCCTCTGGTCTGCCACTGGCGGATGCCGTATTACTGGGCAATGCAGTGGCGTCGTGGGTTGTCGGGCATCGGGGCGGTGATTGTGCGCCAACGCGCGAGGAACTACTCCTCGCACACAAAAAc < 2:8103573/140‑1 (MQ=255) cGTACTTGCCGGGCTGGCCTCTGGTCTGCCACTGGCGGATGCCGTATTACTGGGCAATGCAGTGGCGTCGTGGGTTGTCGGGCATCGGGGCGGTGATTGTGCGCCAACGCGCGAGGAACTACTCCTCGCACACAAAAACg > 2:5930242/1‑140 (MQ=255) cTTGCCGGGCTGGCCTCTGGTCTGCCACTGGCGGATGCCGTATTACTGGGCAATGCAGTGGCGTCGTGGGTTGTCGGGCATCGGGGCGGTGATTGTGCGCCAACGCGCGAGGAACTACTCCTCGCACACAAAAACGtata > 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ggCCTCTGGTCTGCCACTGGCGGATGCCGTATTACTGGGCTATGCAGTGGCGTCGTGGGTTGTCGGGCATCGGGGCGGTGTTTGTGCGCCAACGCGCGAGGAACTACTCCTCGCACACAAAAACGTATAGATCGCTGCGa < 2:3723644/140‑1 (MQ=255) ggCCTCTGGTCTGCCACTGGCGGATGCCGTATTACTGGGCAATGCAGTGGCGTCGTGGGTTGTCGGGCATCGGGGCGGTGATTGTGCGCCAACGCGCGAGGAACTACTCCTCGCACACAAAAACGTATAGATCGCTGCGa < 2:362582/140‑1 (MQ=255) ccTCTGGTCTGCCACTGGCGGATGCCGTATTACTGGGCATTGCAGTGGCGTCGTGGGTTGTCGGGCATCTGGGCGGTGATTGTGCGCCAACGCGCGAGGAACTACTCCTCGCACACAAAAACGTATAGATCGCTGCGACa < 2:2880775/140‑1 (MQ=255) ccTCTGGTCTGCCACTGGCGGATGCCGTATTACTGGGCAATGCAGTGGCGTCGTGGGTTGTCGGGCATCGGGGCGGTGATTGTGCGCCAACGCGCGAGGAACTACTCCTCGCACACAAAAACGTATAGATCGCTGCGACa < 1:6547278/140‑1 (MQ=255) ccTCTGGTCTGCCACTGGCGGATGCCGTATTACTGGGCAATGCAGTGGCGTCGTGGGTTGTCGGGCATCGGGGCGGTGATTGTGCGCCAACGCGCGAGGAACTACTCCTCGCACACAAAAACGTATAGATCGCTGCGACa > 2:5717176/1‑140 (MQ=255) ccTCTGGTCTGCCACTGGCGGATGCCGTATTACTGGGCAATGCAGTGGCGTCGTGGGTTGTCGGGCATCGGGGCGGTGATTGTGCGCCAACGCGCGAGGAACTACTCCTCGCACACAAAAACGTATAGATCGCTGCGACa < 1:763618/140‑1 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tCTGCCACTGGCGGATGCCGTATTACTGGGCAATGCAGTGGCGTCGTGGGTTGTCGGGCATCGGGGCGGTGATTGTGCGCCAACGCGCGAGGAACTACGCCTCGCACACAAAAACGTATAGATCGCTGCGACAGTGGCTa < 2:934774/140‑1 (MQ=255) tCTGCCACGGGCGGATGCCGTATTACTGGGCAATGCAGTGGCGTCGTGGGTTGTCGGGCATCGGGGCGGTGATTGTGCGCCAACGCGCGAGGAACTACTCCTCGCACACAAAAACGTATAGATCGCTGCGACAGTGGCTa < 1:8887047/140‑1 (MQ=255) gCCACTGGCGGATGCCGTATTACTGGGCAATGCAGTGGCGTCGTGGGTTGTCGGGCATCGGGGCGGTGATTGTGCGCCAACGCGCGAGGAACTACTCCTCGCACACAAAAACGTATAGATCGCTGCGACAGTGGCTAATg < 2:4712678/140‑1 (MQ=255) gCCACTGGCGGATGCCGTATTACTGGGCAATGCAGTGGCGTCGTGGGTTGTCGGGCATCGGGGCGGTGATTGTGCGCCAACGCGCGAGGAACTACTCCTCGCACACAAAAACGTATAGATCGCTGCGACAGTGGCTAATg < 1:9479434/140‑1 (MQ=255) cTGGCGGATGCCGTATTACTGGGCCATGCAGTGGCGTCGTGGGTTGTCGGGCATCGGGGCGGTGATTGTGCGCCAACGCGCGAGGAACTACTCCTCGCACACAAAAACGTATAGATCGCTGCGACAGTGGCTAATGCTGt > 2:2129779/1‑140 (MQ=255) tGGCGGATGCCGTATTACTGGGCAATGCAGTGGCGTCGTGGGTTGTCGGGCATCGGGGCGGTGATTGTGCGCCAACGCGCGAGGAACTACTCCTCGCACACAAAAACGTATAGATCGCTGCGACAGTGGCTAATGCTGTa < 2:6735792/140‑1 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cAATGCAGTGGCGTCGTGGGTTGTCGGGCATCGGGGCGGTGATTGTGCGCCAACGCGCGAGGAACTACTCCTCGCACACAAAAACGTATAGATCGCTGCGACAGTGGc < 2:2706715/108‑1 (MQ=255) cAATGCAGTGGCGTCGTGGGTTGTCGGGCATCGGGGCGGTGATTGTGCGCCAACGCGCGAGGAACTACTCCTCGCACACAAAAACGTATAGATCGCTGCGACAGTGGCTAATGCTGTACTCAATAGGCCGTTGCTGTTgg < 1:5064181/140‑1 (MQ=255) tGCAGTGGCGTCGTGGGTTGTCGGGCATCGGGGCGGTGATTGTGCGCCAACGCGCGAGGAACTACTCCTCGCACACAAAAACGTATAGATCGCTGCGACAGTGGCTAATGCTGTACTCAATAGGCCGTTGCTGTTGGTCa > 2:4134484/1‑140 (MQ=255) tGCAGTGGCGTCGTGGGTTGTCGGGCATCGGGGCGGTGATTGTGCGCCAACGCGCGAGGAACTACTCCTCGCACACAAAAACGTATAGATCGCTGCGACAGTGGCTAATGCTGTACTCAATAGGCCGTTGCTGTTGGTCa > 1:9182253/1‑140 (MQ=255) tGCAGTGGCGTCGTGGGTTGTCGGGCATCGGGGCGGTGATTGTGCGCCAACGCGCGAGGAACTACTCCTCGCACACAAAAACGTATAGATCGCTGCGACAGTGGCTAATGCTGTACTCAATAGGCCGTTGCTGTTGGTCa > 2:3071699/1‑140 (MQ=255) tGCAGTGGCGTCGTGGGTTGTCGGGCATCGGGGCGGTGATTGTGCGCCAACGCGCGAGGAACTACTCCTCGCACACAAAAACGTATAGATCGCTGCGACAGTGGCTAATGCTGTACTCAATAGGCCGTTGCTGTTGGTCa > 2:5500538/1‑140 (MQ=255) 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(MQ=255) tgtgCGCCAACGCGCGAGGAACTACTCCTCGCACACAAAAACGTATAGATCGCTGCGACAGTGGCTAATGCTGTACTCAATAGGCCGTTGCTGTTGGTCAAGCGCCACTTGCTTGATCACCAGCACCGGTATTTTGCTag > 1:871014/1‑139 (MQ=255) ccAACGCGCGAGGAACTACTCCTCGCACACAAAAACGTATAGATCGCTGCGACAGTGGCTAATGCTGTACTCAATAGGCCGTTGCTGTTGGTCAAGCGCCACTTGCTTGATCACCAGCACCGGTATTTTGCTATCTAACt > 1:4011121/1‑140 (MQ=255) cgcgAGGAACTACTCCTCGCACACAAAAACGTATAGATCGCTGCGACAGTGGCTAATGCTGTACTCAATAGGCCGTTGCTGTTGGTCAAGCGCCACTTGCTTGATCACCAGCACCGGTATTTTGCTATCTAACTGAatat < 2:771677/140‑1 (MQ=255) | CGACAGTCATGCCGGTGGCGTACTTGCCGGGCTGGCCTCTGGTCTGCCACTGGCGGATGCCGTATTACTGGGCAATGCAGTGGCGTCGTGGGTTGTCGGGCATCGGGGCGGTGATTGTGCGCCAACGCGCGAGGAATTACTCCTCGCACACAAAAACGTATAAATCGCTGCGACAGTGGCTAATGCTGTACTCAATAGGCCGTTGCTGTTGGTCAAGCGCCACTTGCTTGATCACCAGCACCGGTATTTTGCTATCTAACTGAATATGTGAC > NZ_CP025268/2185936‑2186207 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |