Predicted mutation | ||||||
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RA | NZ_CP025268 | 2,385,598 | C→T | intergenic (‑20/‑45) | elaA ← / → rbn | GNAT family N‑acetyltransferase/ribonuclease BN |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NZ_CP025268 | 2,385,598 | 0 | C | T | 99.7% | 2578.5 / NA | 662 | intergenic (‑20/‑45) | elaA/rbn | GNAT family N‑acetyltransferase/ribonuclease BN |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (344/315); minor base G (2/0); total (347/315) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.00e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 668 total aligned reads displayed.
CGATATCCTGATAAGGGCAATTCTGCTCGACAACAAACACCGCGCAACGCAGTTGTAATAAGGCATAAAGCTGGGAAACCGATAATTCAGAGTGATGCAGATCTTGCCATTCAATCATAATGCTCTCCTTTTAGATGCATGCCTTATACTAGCCGGAATATTTTTTGAAACGTGATGAACTCATGGAATTAATTTTTTTAGGTACTTCAGCCGGTGTGCCAACCCGCACGCGCAATGTCACGGCAATATTGCTTAACCTGCAACATCCGAC > NZ_CP025268/2385461‑2385731 | gATATCCTGATAAGGGCAATTCTGCTCGACAACAAACACCGCGCAACGCAGTTGTAATAAGGCATAAAGCTGGGAAACCGATAATTCTGAGTGATGCAGATCTTGCCATTCAATCATAATGCTCTCCTTTTAGatgtatg < 1:4906469/140‑1 (MQ=255) atatCCTGATAAGGGCAATTCTGCTCGACAACAAACACCGCGCAACGCAGTTGTAATAAGGCATAAAGCTGGGAAACCGATAATTCAGAGTGATGCAGATCTTGCCATTCAATCATAATGCTCTCCTTTTAGatgtatgc > 2:4629862/1‑140 (MQ=255) tatCCTGATAAGGGCAATTCTGCTCGACCACAAACACCGCGCAACGCAGTTGTAATAAGGCATAAAGCTGGGAAACCGATANTTCAGAGTGATGCAGATCTTGCCATTCAATCATAATGCTCTCCTTTTAGNTGTATGcc < 1:5816479/140‑1 (MQ=255) tGATAAGGGCAATTCTGCTCGACAACAAACACCGCGCAACGCAGTTGTAATAAGGCATAAAGCTGGGAAACCGATAATTCAGAGTGATGCAGATCTTGCCATTCAATCATAATGCTCTCCTTTTAGATGTATGCCTtata < 1:3677588/140‑1 (MQ=255) aTAAGGGCAATTCTGCTCGACAACAAACACCGCGCAACGCAGTTGTAATAAGGCATAAAGCTGGGACACCGATAATTCAGAGTGATGCAGATCTTGCCATTCAATCATAATGCTCTCCTTTTAGATGTATGCCTTATACt > 2:5485968/1‑140 (MQ=255) aTAAGGGCAATTCTGCTCGACAACAAACACCGCGCAACGCAGTTGTAATAAGGCATAAAGCTGGGAAACCGATAATTCAGAGTGATGCAGATCTTGCCATTCAATCATAATGCTCTCCTTTTAGATGTATGCCTTATACt > 1:9534384/1‑140 (MQ=255) aTAAGGGCAATTCTGCTCGACAACAAACACCGCGCAACGCAGTTGTAATAAGGCATAAAGCTGGGAAACCGATAATTCAGAGTGATGCAGATCTTGCCATTCAATCATAATGCTCTCCTTTTAGATGTATGCCTTATACt > 2:336913/1‑140 (MQ=255) aGGGCAATTCTGCTCGACAACAAACACCGCGCAACGCAGTTGTAATAAGGCATAAAGCTGGGAAACCGATAATTCAGAGTGATGCAGATCTTGCCATTCAATCATAATGCTCTCCTTTTAGATGTATGCCTTATACTAGc > 2:4413967/1‑140 (MQ=255) ggCAATTCTGCTCGACAACAATCAGCGCGCAACGCAGTTGTAATAAGGCATAATGCTGGGAACCCGATATGTCCGAGTGATGCCGATCTTGCCATTCTCTCTTACTGCTCTCCTTTTAGTTGGATGCCTTATACGAGcgg > 2:9115745/1‑138 (MQ=255) cAATTCTGCTCGACAACAAACACCGCGCAACGCAGTTGTAATAAGGCATAAAGCTGGGAAACCGATAATTCAGAGTGATGCAGATCTTGCCATTCAATCATAATGCTCTCCTTTTAGATGTATGCCTTATACTAGCCGGa > 2:10456293/1‑140 (MQ=255) cAATTCGGCTCGACAACAAACCCCGCGCAACGCAGATGTACTAAGGCATAAAGCTGGGAAACCGATACTTCAGAGTGATGCAGATCTTGCCATTCAATCATACTGCTCTCCATTTAGATGTATGCCTGATACTAGCCGGa < 2:2729638/140‑1 (MQ=255) cTGCTCGACAACAAACACCGCGCAACGCAGTTGTAATAAGGCATAAAGCTGGGAAACCGATAATTCAGAGTGATGCAGATCTTGCCATTCAATCATAATGCTCTCCTTTTAGATGTATGCCTTATACTAGCCGGAATAtt > 2:7480791/1‑140 (MQ=255) cTCGACAACAAACACCGCGCAACGCAGTTGTAATAAGGCATAAAGCTGGGAAACCGATAATTCAGAGTGATGCAGATCTTGCCATTCAATCATAATGCTCTCCTTTTAGATGTATGCCTTATACTAGCCGGAATAttttt > 1:5057761/1‑140 (MQ=255) cTCGACAACAAACACCGCGCAACGCAGTTGTAATAAGGCATAAAGCTGGGAAACCGATAATTCAGAGTGATGCAGATCTTGCCATTCAATCATAATGCTCTCCTTTTAGATGTATGCCTTATACTAGCCGGAATAttttt > 1:6151262/1‑140 (MQ=255) cTCGACAACAAACACCGCGCAACGCAGTTGTAATAAGGCATAAAGCTGGGAAACCGATAATTCAGAGTGATGCAGATCTTGCCATTCAATCATAATGCTCTCCTTTTAGATGTATGCCTTATACTAGCCGGAATAttttt > 2:1912993/1‑140 (MQ=255) acaacaAACACCGCGCAACGCAGTTGTAATAAGGCATAAAGCTGGGAAACCGATAATTCAGAGTGATGCAGATCTTGCCATTCAATCATAATGCTCTCCTTTTAGATGTATGCCTTATACTAGCCGGAATATTTTTTGaa < 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ccTTTTAGATGTATGCCTTAAACTAGACGGAATATTTTTTGAAACGTGATGAACTAATGGAATTAAATTTTTTAGGTAATTCAGCCGGTGTGCCAACCCGCACGCGCAATGTCACGGCAATAATGCTTAACCTGCAACAt > 2:5147749/1‑140 (MQ=255) cTTTTAGATGTATGCCTTATACTAGCCGGAATATTTTTTGAAACGTGATGAACTCATGGAATTAATTTTTTTAGGTACTTCAGCCGGTGTGCCAACCCGCACGCGCAATGTCACGGCAATATTGCTTAACCTGCAACATc > 1:3957031/1‑140 (MQ=255) aGATGTATGCCTTATACTAGCCGGAATATTTTTTGAAACGtgat < 2:3079957/44‑1 (MQ=255) | CGATATCCTGATAAGGGCAATTCTGCTCGACAACAAACACCGCGCAACGCAGTTGTAATAAGGCATAAAGCTGGGAAACCGATAATTCAGAGTGATGCAGATCTTGCCATTCAATCATAATGCTCTCCTTTTAGATGCATGCCTTATACTAGCCGGAATATTTTTTGAAACGTGATGAACTCATGGAATTAATTTTTTTAGGTACTTCAGCCGGTGTGCCAACCCGCACGCGCAATGTCACGGCAATATTGCTTAACCTGCAACATCCGAC > NZ_CP025268/2385461‑2385731 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |