| Predicted mutation | ||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_CP025268 | 2,998,678 | 0 | T | C | 99.6% | 4675.5 / NA | 1350 | *410* (TAA→TAG) | CXP41_RS15650 | IS3‑like element IS2 family transposase |
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Only 100 of 1350 total aligned reads displayed.
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aaTTCCAATTGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCt > 1:5218830/1‑140 (MQ=255) ccAATTGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGaa < 2:509323/140‑1 (MQ=38) aTTGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTa > 1:4863114/1‑42 (MQ=255) ttGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTa > 2:4289321/1‑41 (MQ=255) | AGCTGATAAATAATCCCTTAGTACATCAGGAACCTTATAAAAAAACCCGCGTTCTGCAAACCTTTCTCGATAAAAGTGACAACCACTGAGTAAACAGATCAATGGAAGTAAATTCCAATTGTTTATTGGATTTGCCCTTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGC > NZ_CP025268/2998541‑2998803 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |