| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 3,034,336 | A→G | S222S (TCA→TCG) | uacT → | urate/proton symporter UacT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 3,034,336 | 0 | A | G | 99.8% | 3833.1 / ‑5.0 | 1103 | S222S (TCA→TCG) | uacT | urate/proton symporter UacT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base G (571/529); total (572/531) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 1103 total aligned reads displayed.
CCGCAATATGGTAATCCCGTTTATTTAGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCATGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGACTGCCGTGTTAATCATCGTGT > NZ_CP025268/3034199‑3034472 | ccGCAATATGGTAATCCCGTTTATTTAGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTg < 1:5696205/140‑1 (MQ=255) cGCAATATGGTAATCCCGTTTATTTAGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTgg < 2:9867066/140‑1 (MQ=255) atatGGTAATCCCGTTTATTTAGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGgatga > 1:8300802/1‑140 (MQ=255) ggTAATCCCGTTTATTTAGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGatgaa > 2:738205/1‑140 (MQ=255) tAATCCCGTTTATTTAGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGatgaatg > 2:3922284/1‑140 (MQ=255) tAATCCCGTTTATTTAGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGatgaatg > 1:4636975/1‑140 (MQ=255) aTCCCGTTTATTTAGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGAtgaatgaa > 2:10858106/1‑140 (MQ=255) aTCCCGTTTATTTAGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGAtgaatgaa > 1:7158710/1‑140 (MQ=255) tCCCGTTTATTTAGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAg > 1:7921513/1‑140 (MQ=255) tCCCGTTTATTTAGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGGATTACTGGGGATTGTAGTTGGCTTTTTAGTTTCGTGGATGATGAATGAAg > 2:1383172/1‑140 (MQ=255) ccGTTTATTTAGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGAtgaatgaa < 2:3137399/137‑1 (MQ=255) ccGTTTATTTAGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTc > 1:9442839/1‑140 (MQ=255) ccGTTTATTTAGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTc > 1:493792/1‑140 (MQ=255) ccGTTTATTTAGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTc > 1:4739494/1‑140 (MQ=255) ccGTTTATTTAGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTc > 1:4124965/1‑140 (MQ=255) gTTTATTTAGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGAtgaatgaa > 1:3905781/1‑135 (MQ=255) gTTTATTTAGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCaa > 1:8521360/1‑140 (MQ=255) gTTTATTTAGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCaa > 2:10710903/1‑140 (MQ=255) gTTTATTTAGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCaa < 2:9173879/140‑1 (MQ=255) gTTTATTTAGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCaa > 2:7837242/1‑140 (MQ=255) gTTTATTTAGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGAGTGGATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCaa > 2:9406043/1‑140 (MQ=255) ttatttaGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAAtt > 2:3010222/1‑140 (MQ=255) tttaGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTAt < 1:3634120/140‑1 (MQ=255) tttaGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTAt < 1:6123520/140‑1 (MQ=255) tttaGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTAt < 1:4876620/140‑1 (MQ=255) taGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATcc < 2:8761276/140‑1 (MQ=255) taGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATcc < 2:1568573/140‑1 (MQ=255) aGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCg < 1:738205/140‑1 (MQ=255) gTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCggg > 1:5508624/1‑140 (MQ=255) gTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCggg < 2:2301783/140‑1 (MQ=255) gTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCggg < 1:10210923/140‑1 (MQ=255) gTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCggg < 2:5735111/140‑1 (MQ=255) gTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCggg > 2:10005031/1‑140 (MQ=255) gTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCggg < 1:6720157/140‑1 (MQ=255) gTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCggg > 1:752876/1‑140 (MQ=255) gTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCggg < 1:1810203/140‑1 (MQ=255) tATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGc > 1:3438618/1‑140 (MQ=255) tcCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACa > 1:10802425/1‑140 (MQ=255) tcCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACa > 2:4537628/1‑140 (MQ=255) tcCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACa < 1:3014764/140‑1 (MQ=255) cTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACatg < 1:7017415/140‑1 (MQ=255) cTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACatg < 1:8692962/140‑1 (MQ=255) cTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACatg < 2:6239966/140‑1 (MQ=255) cTTTGCCGTCTTAATTTTTATCGTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACatg < 2:8316251/140‑1 (MQ=255) tGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAAttt > 1:784029/1‑123 (MQ=255) tGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACatgatg > 1:233884/1‑140 (MQ=255) gTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTc < 1:10005032/140‑1 (MQ=255) tCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCa > 2:4664045/1‑140 (MQ=255) ttAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATg > 2:8160922/1‑140 (MQ=255) ttAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATg > 2:7579802/1‑140 (MQ=255) ttttATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTg > 1:1498328/1‑140 (MQ=255) tttATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGc < 2:8571236/140‑1 (MQ=255) tttATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGc < 2:10546215/140‑1 (MQ=255) ttATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCg < 1:6510349/140‑1 (MQ=255) cTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTAc > 2:5558209/1‑140 (MQ=255) tCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACg < 1:7678813/140‑1 (MQ=255) ttACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCg < 1:5925473/140‑1 (MQ=255) gCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCg > 1:2882338/1‑140 (MQ=255) gCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCg > 1:6312368/1‑140 (MQ=255) aTGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGttt > 2:7181820/1‑140 (MQ=255) gCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGc < 1:2554622/94‑1 (MQ=255) gCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTAGTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGTAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTgg > 2:5366652/1‑140 (MQ=255) aGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGc > 1:8872853/1‑140 (MQ=255) tttATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCg < 1:9153663/120‑1 (MQ=255) tttATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGAt > 1:9661613/1‑140 (MQ=255) gTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTa > 2:4923611/1‑110 (MQ=255) aaCGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATcc > 2:29239/1‑140 (MQ=255) aaCGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATcc < 2:6468929/140‑1 (MQ=255) aaCGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATcc < 1:10524461/140‑1 (MQ=255) tCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGtt < 2:9614257/140‑1 (MQ=255) tATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCAtt < 1:5240290/140‑1 (MQ=255) ttACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCt < 2:3787316/140‑1 (MQ=255) gggATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGc > 1:1624114/1‑68 (MQ=255) ggATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATg > 1:10337836/1‑140 (MQ=255) gATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGatgaa > 1:4480353/1‑36 (MQ=255) gATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACatg < 2:10389202/62‑1 (MQ=255) gATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACatg > 2:10177379/1‑62 (MQ=255) gATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTc < 1:3165819/96‑1 (MQ=255) gATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGt < 1:5145951/98‑1 (MQ=255) gATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGt > 2:5145951/1‑98 (MQ=255) gATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGa > 1:124746/1‑140 (MQ=255) gATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCATGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATcc > 2:6033480/1‑120 (MQ=255) tGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACatg > 2:1206914/1‑59 (MQ=255) tGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATg > 2:4282156/1‑69 (MQ=255) tGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCAtt < 1:10700891/127‑1 (MQ=255) tGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGACTg < 2:2063761/140‑1 (MQ=255) tGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGACTg < 1:4279310/140‑1 (MQ=255) tGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGACTg > 1:2255134/1‑140 (MQ=255) tGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGACTg < 1:6890335/140‑1 (MQ=255) tGTATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGACTg > 1:8155250/1‑140 (MQ=255) tATTTGGCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGACTGcc < 2:6928819/140‑1 (MQ=255) ggCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGACTGCCGTGtt < 2:1771491/140‑1 (MQ=255) ggCTTTTTACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGACTGCCGTGtt > 2:3493929/1‑140 (MQ=255) ttttACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGACTGCCGTGTTAatc < 2:476270/140‑1 (MQ=255) tttACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGACTGCCGTGTTAatca < 2:245274/140‑1 (MQ=255) tttACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGACTGCCGTGTTAatca > 2:2690563/1‑140 (MQ=255) tttACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGACTGCCGTGTTAatca < 2:6640048/140‑1 (MQ=255) tttACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGACTGCCGTGTTAatca > 2:896349/1‑140 (MQ=255) tttACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGACTGCCGTGTTAatca > 1:2081468/1‑140 (MQ=255) ttACTTTCGTGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGACTGCCGTGTTAatcat < 2:3275340/140‑1 (MQ=255) | CCGCAATATGGTAATCCCGTTTATTTAGGTATCTCCTTTGCCGTCTTAATTTTTATCTTGCTCATTACTCGCTATGCGAAAGGATTTATGTCCAACGTCGCCGTATTACTGGGGATTGTATTTGGCTTTTTACTTTCATGGATGATGAATGAAGTCAATTTATCCGGGCTACATGATGCTTCATGGTTTGCGATTGTTACGCCGATGTCGTTTGGTATGCCGATTTTCGATCCCGTTTCCATTCTGACCATGACTGCCGTGTTAATCATCGTGT > NZ_CP025268/3034199‑3034472 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |