Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 3,270,287 | A→G | *396* (TAA→TAG) | yhaC → | YhaC family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 3,270,287 | 0 | A | G | 100.0% | 218.8 / NA | 65 | *396* (TAA→TAG) | yhaC | YhaC family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (50/15); total (50/15) |
CGAGAAAGACGAAAATTCTCCGGACAATGGCTTTGAGGTCGGGGAATATAACACATATGAAGCATATAACTCAGAGAAGCAATATTTTACCAGAGAGGACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAAACTTAATAACTTCTTACAAAGTCTATTATTAATACCGTAGATATTTATTCATCTTACCCTGTGCACCAAAAGCAAAAACTCACTGACGCGGGTTTGAAACTGATGGCAACCGCAAAAATGCCTGATGCGCTACGC > NZ_CP025268/3270152‑3270422 | cGAGAAAGACGAAAATTCTCCGGACAATGGCTTTGAGGTCGGGGAATATAACACATATGAAGCATATAACTCAGAGAAGCAATATTTTACCAGAGAGGACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACtt > 2:7749054/1‑140 (MQ=255) aGACGAAAATTCTCCGGACAATGGCTTTGAGGTCGGGGAATATAACACATATGAAGCATATAACTCAGAGAAGCAATATTTTACCAGAGAGGACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTTAATAAc > 2:3013068/1‑140 (MQ=255) aGACGAAAATTCTCCGGACAATGGCTTTGAGGTCGGGGAATATAACACATATGAAGCATATAACTCAGAGAAGCAATATTTTACCAGAGAGGACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTTAATAAc < 1:4677141/140‑1 (MQ=255) gACGAAAATTCTCCGGACAATGGCTTTGAGGTCGGGGAATATAACACATATGAAGCATATAACTCAGAGAAGCAATATTTTACCAGAGAGGACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTTAATAAct > 1:2564238/1‑140 (MQ=255) aaTTCTCCGGACAATGGCTTTGAGGTCGCGGAATATAACACATATGAAGCATATAACTCAGAGAAGCAATATTTTACCAGAGAGGACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTTAATAACTTCTTAc < 1:7749055/140‑1 (MQ=255) cGGACAATGGCTTTGAGGTCGGGGAATATAACACATATGAAGCATATAACTCAGAGAAGCAATATTTTACCAGAGAGGACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTTAATAACTTCTTACAAAGTCt < 2:1209876/140‑1 (MQ=255) cGGACAATGGCTTTGAGGTCGGGGAATATAACACATATGAAGCATATAACTCAGAGAAGCAATATTTTACCAGAGAGGACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTTAATAACTTCTTACAAAGTCt < 2:8072101/140‑1 (MQ=255) cGGGGAATATCACACATATGAAGCATATAACTCAGAGAAGCAATATTTTACCAGAGAGGACTATACGTATGATTACGACCTTTTCAATGCAATATAGACTTAATAACTTCTTACAAAGTCTATTATTACTACCGTAGata > 2:7098615/1‑140 (MQ=255) cGGGGAATAAAACACATATGAAGCATATAACTCAGAGAAGCAATATTTTACCAGAGAGGACTATAAGTATGCTTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTTAATAACTTCGTACAAAGTCTATTATTAAAACCGTAGata > 2:7098677/1‑140 (MQ=255) atatGAAGCATATAACTGAGAGAAGCAATATTTTACCAGAGAGGACTATACGTCTGATTACGCCCTTTTTAATGCAATATAGACTTAATAATTTGTTTCATAGTGTATGTTTCTTTCCGTTGATATTTATTAATCTTAcc > 2:8354807/1‑140 (MQ=255) atatGAAGCATATAACTCAGAGAAGCAATATTTTACCAGAGGGGACTATACGTCTGATTACGTCATGTTAAATGCAATATAGAGTTAATAACTTCTGACAAAGTCTATTGTTAATTCGGTAGATAGTTATTCATATTTcc > 2:8903789/1‑140 (MQ=255) atatGAAGCATATAACTCAGAGAAGCAATATTTTACCAGAGAGGACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTTAATAACTTCTTACAAAGTCTATTATTAATACCGTAGATATTTATTCATCTTAcc < 1:1897319/140‑1 (MQ=255) atatGAAGCATATAACTCAGAGAAGCAATATTTTACCAGAGAGGACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTTAATAACTTCTTACAAAGTCTATTATTAATACCGTAGATATTTATTCATCTTAcc < 2:3900638/140‑1 (MQ=255) atGAAGCATATAACTCAGAGAAGCAATATTTTACCAGAGAGGACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTTAATAACTTCTTACAAAGTCTATTATTAATACCGTAGAGATTTATTCATCTTACCCt > 1:8055275/1‑140 (MQ=255) tataACTCAGAGAAGCAATATTTTACCAGAGAGGACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGAc > 2:588406/1‑74 (MQ=255) tataACTCAGAGAAGCAATATTTTACCAGAGAGGACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGAc < 1:588406/74‑1 (MQ=255) tataACTCAGAGAAGCAATATTTTACCAGAGAGGACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTTAATAACTTCTTACAAAGTCTATTATTAATACCGTAGATATTTATTCATCTTACCCTGTGCACCa > 2:5418049/1‑140 (MQ=255) tataACTCAGAGAAGCAATATTTTACCAGAGAGGACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTTAATAACTTCTTACAAAGTCTATTATTAATACCGTAGATATTTATTCATCTTACCCTGTGCACCa > 1:5612020/1‑140 (MQ=255) tataACTCAGAGAAGCAATATTTTACCAGAGAGGACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTTAATAACTTCTTACAAAGTCTATTATTAATACCGTAGATATTTATTCATCTTACCCTGTGCACCa > 2:2523662/1‑140 (MQ=255) tataACTCAGAGAAGCAATATTTTACCAGAGAGGACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTTAATAACTTCTTACAAAGTCTATTATTAATACCGTAGATATTTATTCATCTTACCCTGTGCACCa > 1:2250153/1‑140 (MQ=255) taACTCAGAGAAGCAATATTTTACCAGAGAGGACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTTAATAACTTCTTACAAAGTCTATTATTAATACCGTAGATATTTATTCATCTTACCCTGTGCACCaaa > 2:4435866/1‑140 (MQ=255) taACTCAGAGAAGCAATATTTTACCAGAGAGGACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTTAATAACTTCTTACAAAGTCTATTATTAATACCGTAGATATTTATTCATCTTACCCTGTGCACCaaa < 1:3013068/140‑1 (MQ=255) aCTCAGAGAAGCAATATTTTACCAGAGAGGACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTTAATAACTTCTTACAAAGTCTATTATTAATACCGTAGATATTTATTCATCTTACCCTGTGCACCAAAAg > 1:9879179/1‑140 (MQ=255) agagAAGCAATATTTTACCAGAGAGGACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTtaa > 1:8328437/1‑70 (MQ=255) agagAAGCAATATTTTACCAGAGAGGACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTtaa < 2:8328436/70‑1 (MQ=255) agagAAGCAATATTTTACCAGAGAGGACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTTAATAAc > 2:10486760/1‑74 (MQ=255) agagAAGCAATATTTTACCAGAGAGGACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTTAATAAc < 1:10486761/74‑1 (MQ=255) agagAAGCAATATTTTACCAGAGAGGACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTTAATAACTTCTTACAAAGTCTATTATTAATACCGTAGATATTTATTCATCTTACCCTGTGCACCAAAAGCaaa > 1:4335622/1‑140 (MQ=255) gagaAGCAATATTTTACCAGAGAGGACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTTAATAACTTCTTACAAAGTCTATTATTAATACCGTAGATATTTATTCATCTTACCCTGTGCACCAAAAGCaaaa > 2:651963/1‑140 (MQ=255) agaAGCAATATTTTACCAGAGAGGACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTTAATAACTTCTTACAAAGTCTATTATTAATACCGTAGATATTTATTCATCTTACCCTGTGCACCAAAAGCaaaaa > 1:4726360/1‑140 (MQ=255) aGCAATATTTTACCAGAGAGGACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTTAATAACTTCTTACAAAGTCTATTATTAATACCGTAGATATTTATTCATCTTACCCTGTGCACCAAAAGCAAAAACTc > 1:6773086/1‑140 (MQ=255) gCAATATTTTACCAGAGAGGACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTtaa > 1:6482056/1‑64 (MQ=255) gCAATATTTTACCAGAGAGGACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTtaa < 2:6482055/64‑1 (MQ=255) cAATATTTTACCAGAGAGGACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTTAATAACTTCTTACAAAGTCTATTATTAATACCGTAGATATTTATTCATCTTACCCTGTGCACCAAAAGCAAAAACTCAc > 2:5431619/1‑140 (MQ=255) cAATATTTTACCAGAGAGGACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTTAATAACTTCTTACAAAGTCTATTATTAATACCGTAGATATTTATTCATCTTACCCTGTGCACCAAAAGCAAAAACTCAc > 2:2041940/1‑140 (MQ=255) atatTTTACCAGAGAGGACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTTAATAAc > 1:1113763/1‑65 (MQ=255) atatTTTACCAGAGAGGACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTTAATAAc < 2:1113763/65‑1 (MQ=255) ttttACCAGAGAGGACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATTCAATATAGACTTAATAACTTCTTACAAAGTATATTATTAATACCGTAGATATTTATTCATCTTACCCGGTGCACCAAAAGCAAAAACTCACTGAcg > 2:1067137/1‑140 (MQ=255) gagagGACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTTAATAACTTCTTACAAAGTCTATTATTAATACCGTAGATATTTATTCATCTTACCCTGTGCACCAAAAGCAAAAACTCACTGACGCGGGTTTg > 2:2813032/1‑140 (MQ=255) gagGACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTTAATAACTTCTTACAAAGTCTATTATTAATACCGTAGATATTTATTCATCTTACCCTGTGCACCAAAAGCAAAAACTCACTGACGCGGGTTTGaa > 1:4536513/1‑140 (MQ=255) gACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTTAATAACTTCTTACAAAGTCTATTATTAATACCGTAGATATTTATTCATCTTACCCTGTGCACCAAAAGCAAAAACTCACTGACGCGGGTTTGAAACt > 2:9765036/1‑140 (MQ=255) gTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTTAATAACTTCTTACAAAGTCTATTATTAATACCGTAGATATTTATTCATCTTACCCTGTGCACCAAAAGCAAAAACTCACTGACGCGGGTTTGAAACTGATGGCaa > 2:5405510/1‑140 (MQ=255) aTGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTtaa > 1:456595/1‑35 (MQ=255) 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aTGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTTAATAACTTCTTACAAAGACTATTATTAATACCGTAGATATTTATTCATCTTACCCTGTGCACCAAAAGCAAAAACTCACTGACGCGGGTTTGAAACTGATGGCAAcc > 1:10045592/1‑140 (MQ=255) tGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTTAATAACTTCTTACAAAGTCTATTATTAATACCGTAGATATTTATTCATCTTACCCTGTGCACCAAAAGCAAAAACTCACTGACGCGGGTTTGAAACTGATGGCAACCg > 1:7430784/1‑140 (MQ=255) tGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTTAATAACTTCTTACAAAGTCTATTATTAATACCGTAGATATTTATTCATCTTACCCTGTGCACCAAAAGCAAAAACTCACTGACGCGGGTTTGAAACTGATGGCAACCg > 1:476894/1‑140 (MQ=255) tGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTTAATAACTTCTTACAAAGTCTATTATTAATACCGTAGATATTTATTCATCTTACCCTGTGCACCAAAAGCAAAAACTCACTGACGCGGGTTTGAAACTGATGGCAACCg > 1:477334/1‑140 (MQ=255) aTTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTTAATAACTTCTTACAAAGTCTATTATTAATACCGTAGATATTTATTCATCTTACCCTGTGCACCAAAAGCAAAAACTCACTGACGCGGGTTTGAAACTGATGGCAACCGCa > 1:6024311/1‑140 (MQ=255) aTTACGACCTTTTAAATGCAATATAGACTTAATAACTTCTTACAAAGTCTATTATTAATACCGTAGATATTTATTCATCTTACCCTGTGCACCAAAAGCAAAAACTCACTGACGCGGGTTTGAAACTGATGGCAACCGCa > 2:2626686/1‑140 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2:4726360/140‑1 (MQ=255) tttAAATGCAATATAGACTTAATAACTTCTTACAAAGTCTATTATTAATACCGTAGATATTTATTCATCTTACCCTGTGCACCAAAAGCAAAAA‑TCACGTAAGCGGGGTTGAAACAGATGGCCACCGCAAAAATGCCAGa > 2:2995709/1‑140 (MQ=255) ttAAATGCAATATAGACTTAATAACTTCTTACAAAGTCTATTATTAATACCGTAGATATTTATTCATCTTACCCTGTGCACCAAAAGCAAAAACTCACTGACGCGGGTTTGAAACTGATGGCAACCGCAAAAATGCCTGa > 2:2504401/1‑140 (MQ=255) tataGACTTAATAACTTCTTACAAAGTCTATTATTAATACCGTAGATATTTATTCATCTTACCCTGTGCACCAAAAGCAAAAACTCACTGACGCGGGTTTGAAACTGATGGCAACCGCAAAAATGCCTGATGCGCTACGc > 2:8357508/1‑140 (MQ=255) | CGAGAAAGACGAAAATTCTCCGGACAATGGCTTTGAGGTCGGGGAATATAACACATATGAAGCATATAACTCAGAGAAGCAATATTTTACCAGAGAGGACTATACGTATGATTACGACCTTTTAAATGCAATATAAACTTAATAACTTCTTACAAAGTCTATTATTAATACCGTAGATATTTATTCATCTTACCCTGTGCACCAAAAGCAAAAACTCACTGACGCGGGTTTGAAACTGATGGCAACCGCAAAAATGCCTGATGCGCTACGC > NZ_CP025268/3270152‑3270422 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |