| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 3,665,674 | T→C | *275* (TAA→TAG) | gadX ← | acid resistance transcriptional activator GadX |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 3,665,674 | 0 | T | C | 99.7% | 1005.1 / NA | 289 | *275* (TAA→TAG) | gadX | acid resistance transcriptional activator GadX |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (203/85); minor base A (1/0); total (204/85) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 289 total aligned reads displayed.
AGTTATATTTAACTTACTGAGAGCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTTTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTCCTGATACTCTGTGGGCGTCATCCCATAATAAT > NZ_CP025268/3665537‑3665810 | atatTTAACTTACTGAGAGCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAAt > 2:10103043/1‑140 (MQ=255) atTTAACTTACTGAGAGCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCta < 1:5726753/134‑1 (MQ=255) aCTGAGAGCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTAttccttc > 1:1302986/1‑140 (MQ=255) aCTGAGAGCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTAttccttc > 2:1458353/1‑140 (MQ=255) tGAGAGCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCg < 2:7805322/140‑1 (MQ=255) gagaGCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGc > 1:7222145/1‑140 (MQ=255) agCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTACAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGa > 2:1334878/1‑140 (MQ=255) agCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTAt > 2:5833002/1‑128 (MQ=255) agCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTAt < 1:5833002/128‑1 (MQ=255) agCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCg < 1:5363737/136‑1 (MQ=255) agCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGc > 1:5619916/1‑137 (MQ=255) agCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGa > 1:5316775/1‑140 (MQ=255) agCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGa > 1:6298121/1‑140 (MQ=255) agCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGa > 2:6052087/1‑140 (MQ=255) agCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGa > 2:9522167/1‑140 (MQ=255) agCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGa > 2:979428/1‑140 (MQ=255) agCACAAAGGTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGa < 1:9423464/140‑1 (MQ=255) cacaAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAAc > 1:8399028/1‑140 (MQ=255) cacaAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAAc > 1:2324970/1‑140 (MQ=255) cacaAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAAc > 1:667376/1‑140 (MQ=255) cacaAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCAGCAGAAc > 1:9553289/1‑140 (MQ=255) aaaGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGt > 2:2058318/1‑140 (MQ=255) aaaGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGt > 2:4520868/1‑140 (MQ=255) aaaGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGt < 2:5076743/140‑1 (MQ=255) aaaGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGt > 1:10157974/1‑140 (MQ=255) aaaGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGt < 1:2640282/140‑1 (MQ=255) ttCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGAAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCAGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAATACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTg > 1:3857771/1‑140 (MQ=255) tCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGc > 1:3067046/1‑140 (MQ=255) cccGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTCAAACTCTATAATCTTATTCCATCCGCAGAACGGTCAGTGcc > 2:10253013/1‑140 (MQ=255) cccGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGcc > 2:6933257/1‑140 (MQ=255) gTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTa > 2:5364715/1‑140 (MQ=255) aGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGa > 2:9071591/1‑113 (MQ=255) aGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGa < 1:4011381/113‑1 (MQ=255) tgtTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTg > 1:4847838/1‑138 (MQ=255) tgtTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTg < 2:4847838/138‑1 (MQ=255) gtTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTgcgc < 2:4093438/140‑1 (MQ=255) gtTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTgcgc > 1:860717/1‑140 (MQ=255) ttATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGca < 1:6933258/140‑1 (MQ=255) ttATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGca > 1:8027374/1‑140 (MQ=255) ttATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTATTCCCGGTCCCCTAAGCCGGGTTTTTTTTATTTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCATTCAGCAGAACGGTCAGTTCCGTAAAAATTCCCTTGCGca > 2:6122011/1‑140 (MQ=255) tataACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACGCTCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTGTTTTATGTCTGAGTCAAACTCTCTAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGcac > 2:10326383/1‑139 (MQ=255) cGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCta > 2:3027754/1‑82 (MQ=255) cGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTg < 2:5054581/130‑1 (MQ=255) cGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCACTTGCGCAACAATa > 2:8242139/1‑140 (MQ=255) ttttATTAGTCTGGAGACGGCCGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTGTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGTTCGGTCAGTGCCGTAATAATTCCCTTGCGCATCAAGACt > 2:10541764/2‑140 (MQ=255) gTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCta < 1:6982106/80‑1 (MQ=255) gTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCta > 2:6982105/1‑80 (MQ=255) gTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCta > 1:4576149/1‑80 (MQ=255) gTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAg > 1:9913370/1‑109 (MQ=255) gTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTg > 2:8366843/1‑128 (MQ=255) gTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCACCAATACt > 1:1944899/1‑140 (MQ=255) gTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACt > 1:4367984/1‑140 (MQ=255) ttattaGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTAttccttcc < 2:1804996/94‑1 (MQ=255) ttattaGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTccc < 1:7658631/123‑1 (MQ=255) ttattaGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTccc > 2:7658630/1‑123 (MQ=255) ttattaGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTg < 2:4416782/126‑1 (MQ=255) ttattaGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTg > 1:4416782/1‑126 (MQ=255) ttattaGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTg > 1:8755746/1‑140 (MQ=255) tattaGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCATGCGCACCAATACTTgc > 1:8347239/1‑140 (MQ=255) taGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTgccgc > 2:3686301/1‑140 (MQ=255) tGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCta > 2:8904315/1‑69 (MQ=255) tGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGt > 1:2253575/1‑140 (MQ=255) tGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGt > 2:8799559/1‑140 (MQ=255) tGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGt > 2:3146663/1‑140 (MQ=255) 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aCTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGt < 1:10794367/134‑1 (MQ=255) tCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAAtct < 1:4905629/140‑1 (MQ=255) ccTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAAtctc > 2:5292943/1‑140 (MQ=255) tCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTAttcc > 2:4264480/1‑59 (MQ=255) ccGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCg > 2:8598240/1‑140 (MQ=255) ggTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGc > 1:8973009/1‑75 (MQ=255) ggTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGAt > 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(MQ=255) ccccTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGc < 1:9788992/140‑1 (MQ=255) ccccTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGc < 1:10661461/140‑1 (MQ=255) cGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGGAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGAGCGCTCCTGATAc > 2:737784/1‑140 (MQ=255) ggTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTCCTGATActc > 1:9511741/1‑140 (MQ=255) tATGTCTGAGTAAAACTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTCCTGATACTCTGTGGGCGt < 2:5713981/140‑1 (MQ=255) aCTCTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTCCTGATACTCTGTGGGCGTCATCCCATaataat > 1:7567115/1‑140 (MQ=255) | AGTTATATTTAACTTACTGAGAGCACAAAGTTTCCCGTGCCAACAGGGAGTGTTATAACGGTTTATTAGTCTGGAGACGGCAGACTATCCTCTTCCCGGTCCCCTATGCCGGGTTTTTTTTATGTCTGAGTAAAACTTTATAATCTTATTCCTTCCGCAGAACGGTCAGTGCCGTAAAAATTCCCTTGCGCAACAATACTTGCCGCCGAGTCACGGTTCGACAATCTCTGCGCCGATCGCTCCTGATACTCTGTGGGCGTCATCCCATAATAAT > NZ_CP025268/3665537‑3665810 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |