Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 3,857,882 | T→C | N4S (AAC→AGC) *116* (TAA→TAG) |
yidG ← yidH ← |
DUF202 domain‑containing protein YidH family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 3,857,882 | 0 | T | C | 99.8% | 1907.1 / NA | 546 | N4S (AAC→AGC) *116* (TAA→TAG) | yidG yidH | DUF202 domain‑containing protein YidH family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (188/357); minor base A (0/1); total (188/358) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 546 total aligned reads displayed.
AACATGCCCGCCTGGTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGTTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGTTGGTGTAGGGCAGGTCCTCTTTCAGACGCATCGCTTTTTCATTGCGTAACCAGCGCAAGT > NZ_CP025268/3857747‑3858018 | aaCATGCCCGCCTGGTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATc < 1:5957370/140‑1 (MQ=255) cATGCCCGCCTGGTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCg < 1:559511/140‑1 (MQ=255) cATGCCCGCCTGGTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCg > 1:1744023/1‑140 (MQ=255) cATGCCCGCCTGGTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCg < 2:230682/140‑1 (MQ=255) cATGCCCGCCTGGTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCg < 1:3002808/140‑1 (MQ=255) aTGCCCGCCTGGTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCgg < 1:4282678/140‑1 (MQ=255) aTGCCCGCCTGGTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCgg < 1:2503278/140‑1 (MQ=255) aTGCCCGCCTGGTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGACTTTGCGGCTATCCgg < 2:8378060/140‑1 (MQ=255) cGCCTGGTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATac < 1:5712296/140‑1 (MQ=255) cGCCTGGTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATac < 1:4152089/140‑1 (MQ=255) cGCCTGGTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATac < 2:10368715/140‑1 (MQ=255) ccTGGTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATacaa > 2:10187309/1‑140 (MQ=255) ccTGGTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATacaa > 2:3115341/1‑140 (MQ=255) ccTGGTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATacaa > 2:5385422/1‑140 (MQ=255) cTGGTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGT‑‑GCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAacac < 1:10125078/140‑1 (MQ=255) ggTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAacac < 1:9893688/140‑1 (MQ=255) ggTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAacac < 2:10782730/140‑1 (MQ=255) ggTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAacac < 1:8864795/140‑1 (MQ=255) ggTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAacac < 1:3424245/140‑1 (MQ=255) ggTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAacac < 1:3621587/140‑1 (MQ=255) ggTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAacac < 2:468043/140‑1 (MQ=255) gTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACAcc > 2:9609259/1‑140 (MQ=255) gTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACAcc < 1:6663494/140‑1 (MQ=255) gTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACAcc < 2:8181182/140‑1 (MQ=255) tGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCa < 2:4224528/140‑1 (MQ=255) gtTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAACCCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAAc > 2:3767223/1‑140 (MQ=255) ttGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGa < 2:7911989/140‑1 (MQ=255) gATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATc < 1:6194668/140‑1 (MQ=255) gATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATc < 1:8964100/140‑1 (MQ=255) aTAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCa < 1:8078260/140‑1 (MQ=255) tAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCAc > 1:10017960/1‑140 (MQ=255) tAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCAc > 1:3944807/1‑140 (MQ=255) ccAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGc > 2:5771354/1‑140 (MQ=255) aaCGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCa < 2:6312045/140‑1 (MQ=255) cGCCCTCACCGCGCCGCAGCCCAGCATGGTACGCAACCACGCCAGGGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGCCTTTGCGGCTATCCGGCATACTACACCAGTCCCATAACGAGCACCGCCACg < 2:5899444/140‑1 (MQ=255) cGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACg > 1:8304947/1‑140 (MQ=255) cGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACg < 1:7586378/140‑1 (MQ=255) cGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACg < 1:3163900/140‑1 (MQ=255) cGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACg < 2:4849288/140‑1 (MQ=255) cGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACg < 2:8763429/140‑1 (MQ=255) tCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCAt < 1:8612859/140‑1 (MQ=255) tCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCAt < 1:2705426/140‑1 (MQ=255) tCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCAt < 1:5057914/140‑1 (MQ=255) tCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCAt < 1:5385422/140‑1 (MQ=255) cgcCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCAt < 2:5640806/134‑1 (MQ=255) cgcCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAatat > 2:8825403/1‑140 (MQ=255) gcCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATAtt < 1:9179415/140‑1 (MQ=255) gcCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATAtt < 1:2912799/140‑1 (MQ=255) ccGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTTATGTGCGCTCCGTCTGCAGTCCTGGTTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGAGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTa > 2:6993006/1‑140 (MQ=255) ccGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTa > 1:9598007/1‑140 (MQ=255) aGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCt > 1:8548939/1‑140 (MQ=255) cccAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTaa < 1:776304/140‑1 (MQ=255) ccAGCCTGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCATTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAAt < 2:343167/140‑1 (MQ=255) ccAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAAt < 2:6551919/140‑1 (MQ=255) ccAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAAt < 2:7417879/140‑1 (MQ=255) ccAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAAt < 1:5254423/140‑1 (MQ=255) ccAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAAt < 1:2002725/140‑1 (MQ=255) ccAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAAt < 1:9422878/140‑1 (MQ=255) cATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACg < 1:7054469/116‑1 (MQ=255) cATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGAtt > 1:4869671/1‑140 (MQ=255) cATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGAtt > 2:2480612/1‑140 (MQ=255) cATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGAtt > 1:7901628/1‑140 (MQ=255) ggTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATtaat > 2:7225673/1‑140 (MQ=255) gTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATtaata < 1:10530829/140‑1 (MQ=255) gTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATtaata < 1:6803943/140‑1 (MQ=255) gTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATtaata > 2:5201294/1‑140 (MQ=255) tACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATtaataa < 1:2139703/140‑1 (MQ=255) tACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATtaataa > 1:5484230/1‑140 (MQ=255) tACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATtaataa > 2:2100827/1‑140 (MQ=255) tACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATtaataa < 1:9507094/140‑1 (MQ=255) tACGAAACCACGCCAGGGATCTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCCATGCGTCTGGCTTTGCGGCAATCCGGCATACAACACCAGTCCCATACCGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATtaataa < 2:1345949/140‑1 (MQ=255) aaCCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGt < 2:5102857/140‑1 (MQ=255) aaCCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGt < 2:1784353/140‑1 (MQ=255) aaCCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGt > 2:9398902/1‑140 (MQ=255) aaCCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGt < 2:10663397/140‑1 (MQ=255) aaCCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGt < 2:7740114/140‑1 (MQ=255) aaCCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGt < 2:7491637/140‑1 (MQ=255) cACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGTTgg > 2:9118875/1‑140 (MQ=255) cGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGTTGgtg > 2:4375391/1‑140 (MQ=255) cGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGTTGgtg > 1:3771115/1‑140 (MQ=255) gTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGTTGGTGTAggg > 1:6508285/1‑140 (MQ=255) gTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGTTGGTGTAggg > 2:7134245/1‑140 (MQ=255) gATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCACTGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGTTGGTGTAGGGCa < 2:6881207/140‑1 (MQ=255) tgCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGTTGGTGTAGGGCAGGTc > 1:9758754/1‑140 (MQ=255) tgCGCTCCGGCTGCAGTCCTAGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGTTGGTGTAGGGCAGGTc > 1:7449691/1‑140 (MQ=255) cgcTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATTAGCTGTTGGTGTAGTGCAGGTCct > 1:1210446/1‑140 (MQ=255) cgcTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGTTGGTGTAGGGCAGGTCct < 2:10245010/140‑1 (MQ=255) cgcTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGTTGGTGTAGGGCAGGTCct > 2:8981585/1‑140 (MQ=255) cAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGTTGGTGTAGGGCAGGTCCTCTTTCAGACGc < 1:4626092/140‑1 (MQ=255) ggTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGTTGGTGTAGGGCAGGTCCTCTTTCAGACGCATCGCttt > 2:6641273/1‑140 (MQ=255) cGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTACTGATTAATAAGCTGTTGGTGTAGGGCAGGTCCTCTTTCAGACGCATCGCTTTTTc < 2:619466/140‑1 (MQ=255) cGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGTTGGTGTAGGGCAGGTCCTCTTTCAGACGCATCGCTTTTTc < 1:1490198/140‑1 (MQ=255) gCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCAt < 1:10211966/69‑1 (MQ=255) gCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGTTGGTGTAGGGCAGGTCCTCTTTCAGACGCATCGCTTTTTCAt > 1:6998158/1‑140 (MQ=255) aaTGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGTTGGTGTAGGGCAGGTCCTCTTTCAGACGCATCGCTTTTTCATTg < 1:10748025/140‑1 (MQ=255) ggCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTCATGATTAATAAGCTGTTGGTGTAGGGCAGGTCCTCTTTCAGACGCATCGCTTTTTCATTGCGTAACCAg > 1:2210549/1‑140 (MQ=255) ttGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCGGTTGGTGTAGGGCAGGTCCTCTTTCAGACGCATCGCTTTTTCATTGCGTAACCAGCGCa < 2:6017808/140‑1 (MQ=255) gCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTTATGATTAATAAGCTGTTGGTGTAGGGCAGGTCCTCTTTCAGACGCATCGCTTTTTCATTGCGTAACCAGCGCatg < 2:853669/140‑3 (MQ=255) gCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGTTGGTGTAGGGCAGGTCCTCTTTCAGACGCATCGCTTTTTCATTGCGTAACCAGCGCAAg < 2:2729571/140‑1 (MQ=255) cGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGTTGGTGTAGGGCAGGTCCTCTTTCAGACGCATCGCTTTTTCATTGCGTAACCAGCGCAAGt > 2:4004568/1‑140 (MQ=255) | AACATGCCCGCCTGGTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGTTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGTTGGTGTAGGGCAGGTCCTCTTTCAGACGCATCGCTTTTTCATTGCGTAACCAGCGCAAGT > NZ_CP025268/3857747‑3858018 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |