| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 4,333,560 | T→C | V378A (GTG→GCG) | proP → | glycine betaine/L‑proline transporter ProP |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 4,333,560 | 0 | T | C | 99.4% | 1670.8 / NA | 482 | V378A (GTG→GCG) | proP | glycine betaine/L‑proline transporter ProP |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (233/245); minor base A (2/1); total (236/246) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.16e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 482 total aligned reads displayed.
GTTGCCCTGTTTGTGTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGATGCCTGCCTATTAC > NZ_CP025268/4333424‑4333696 | ttGCCCTGTTTGTGTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATg > 2:9519730/1‑140 (MQ=255) ttGCCCTGTTTGTGTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATg > 1:10580319/1‑140 (MQ=255) ttGCCCTGTTTGTGTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATg > 2:9410037/1‑140 (MQ=255) ttGCCCTGTTTGTGTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATg > 2:720626/1‑140 (MQ=255) ttGCCCTGTTTGTGTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCATGCCAGCGATg > 1:6672261/1‑140 (MQ=255) cccTGTTTGTGTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTc > 2:2832895/1‑140 (MQ=255) cccTGTTTGTGTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTc > 2:10764979/1‑140 (MQ=255) cccTGTTTGTGTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCATGCCAGCGATGTTc > 1:3216111/1‑140 (MQ=255) ccTGTTTGTGTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTcc < 1:9936631/140‑1 (MQ=255) cTGTTTGTGTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTccc < 1:761034/140‑1 (MQ=255) tgtgTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTACCAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGAGCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCAGACGc < 2:3728752/140‑1 (MQ=255) tgtgTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACCGTAACGTCATCGGCCTGAGTTTTGCCGGGTTACTGATGCGGGCGGTGCTCCTTTACTGCTTTCCGGGCGTTTTGGGTTCTAGCTTGCGAGCGATGTTCCCGACGc > 2:5323973/1‑140 (MQ=255) tgtgTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGc < 1:10181231/140‑1 (MQ=255) tgtgTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGc < 2:5575341/140‑1 (MQ=255) tgtgTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAAAGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGAGTTATGGCTTCTACCGTGCCAGAGATGTTCCCGTCGc > 2:2522063/1‑140 (MQ=255) tgtTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCat < 1:8730872/140‑1 (MQ=255) tgtTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCat < 1:8366419/140‑1 (MQ=255) tgtTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCat < 2:9835569/140‑1 (MQ=255) tgtTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCat < 1:4282882/140‑1 (MQ=255) tgtTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCat < 1:1141820/140‑1 (MQ=255) tgtTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCat < 1:2141492/140‑1 (MQ=255) cGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTcc > 2:6023535/1‑126 (MQ=255) aTCCCGGCGTTTATTCTGATTTACAGTTACGTCATGGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTTATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCAGACGCATATCCGTTa < 1:3595633/140‑1 (MQ=255) cccGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACa > 2:6912896/1‑140 (MQ=255) cccGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACa > 2:1100656/1‑140 (MQ=255) cccGGCGGTTATTCTGATTAACCGTAACGTCATCGTCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATTCTGGCGGTGATCCTTAAATGCTTTACGGGCGGTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACa > 2:1319261/1‑140 (MQ=255) cGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAgc < 1:5558074/140‑1 (MQ=255) cGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAgcgcg < 1:945090/140‑1 (MQ=255) tATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGTCGGTGATCCTTAACTGCTTGACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTACCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTgg > 2:3025002/1‑140 (MQ=255) tCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTggcgg < 2:4934581/140‑1 (MQ=255) cTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTggcggc < 2:6823308/140‑1 (MQ=255) tGATTAACCGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGGTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTggcggcg < 1:9248836/140‑1 (MQ=255) tGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTggcggcg < 1:9526822/140‑1 (MQ=255) tGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTggcggcg < 1:7457734/140‑1 (MQ=255) gATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTggcggcgg > 2:6431492/1‑140 (MQ=255) gATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGGTACTGATTCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTGATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTACCGACGCATATCCGGTACAGCGCGCTggcggcgg > 1:3109744/1‑140 (MQ=255) ttAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCa < 1:9144198/140‑1 (MQ=255) tAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAata > 1:5370767/1‑140 (MQ=255) tAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAata > 1:6087701/1‑140 (MQ=255) aCGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTcc < 1:2645526/96‑1 (MQ=255) aCGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTcc > 2:2645526/1‑96 (MQ=255) aCGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATAtt > 1:68743/1‑140 (MQ=255) aCGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATAtt > 2:4210951/1‑140 (MQ=255) aCGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCGGGCGGCGGCATTTAATAtt < 2:6648150/140‑1 (MQ=255) tCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTCATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCg < 1:5768051/140‑1 (MQ=255) tCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTCCAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTg > 2:6238967/1‑140 (MQ=255) tCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTg > 2:1820972/1‑140 (MQ=255) tCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTg > 1:3974629/1‑140 (MQ=255) tCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTg > 1:1847074/1‑140 (MQ=255) tCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTg > 1:8157481/1‑140 (MQ=255) tCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTg > 1:7033453/1‑140 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ggCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTggcgg > 1:1430477/1‑140 (MQ=255) ggCGGTGATCCTTAACTGCTTAACGGGGGTTATGGCTTCTTCCTTGGCAGCGATTTTCCGGAGGCATATGCGTGACAGCGCGGTGGCGGCGGCATGGATTCTTGGGGTGGGGGTTGCGGGTCTGTCGGGAACGCTggggg > 2:8030526/1‑140 (MQ=255) gCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTggcggc < 1:8008662/140‑1 (MQ=255) ggTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCct > 1:2961839/1‑140 (MQ=255) gATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCGTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGGGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCctggc < 2:7512950/140‑1 (MQ=255) aTCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCctggct < 2:3318475/140‑1 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cTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGAAGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCt > 1:4975316/1‑140 (MQ=255) tttACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTc > 1:8301805/1‑140 (MQ=255) ttACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCg > 2:10586712/1‑140 (MQ=255) ttACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCGGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCg < 2:10507541/140‑1 (MQ=255) tACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGc < 1:10126685/140‑1 (MQ=255) aCGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCa < 2:5417331/140‑1 (MQ=255) aCGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCa < 2:9384254/140‑1 (MQ=255) ttATGGCTTCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCtg > 1:6431975/1‑140 (MQ=255) ttCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGAtgc < 1:1243544/140‑1 (MQ=255) ttCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGAtgc < 1:8872979/140‑1 (MQ=255) ttCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGAtgc < 1:863697/140‑1 (MQ=255) ttCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGAtgc < 2:9097831/140‑1 (MQ=255) tCTACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGAtgcc < 1:2021412/140‑1 (MQ=255) tACCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGAtgcctg > 2:2359163/1‑140 (MQ=255) aCCTTGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGAtgcctgc < 1:10449897/140‑1 (MQ=255) cTTGCCAGCGATGTTCCCGACGAATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTATTAATTCGGTGAAGGTTGCCGGTCTGTCTCCAACGCTGGCGTCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGTtgcctgccg > 2:3554362/1‑139 (MQ=255) ttGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGATGCCTGCCTa < 2:8794743/140‑1 (MQ=255) tGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGATGCCTGCCTAt < 1:2776909/140‑1 (MQ=255) tGCCAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGATGCCTGCCTAt < 2:891106/140‑1 (MQ=255) cAGCGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGATGCCTGCCTATTAc < 1:8046141/140‑1 (MQ=255) | GTTGCCCTGTTTGTGTTGGCGATCCCGGCGTTTATTCTGATTAACAGTAACGTCATCGGCCTGATTTTTGCCGGGTTACTGATGCTGGCGGTGATCCTTAACTGCTTTACGGGCGTTATGGCTTCTACCTTGCCAGTGATGTTCCCGACGCATATCCGTTACAGCGCGCTGGCGGCGGCATTTAATATTTCGGTGCTGGTTGCCGGTCTGACGCCAACGCTGGCGGCCTGGCTGGTCGAAAGCTCGCAGAATCTGATGATGCCTGCCTATTAC > NZ_CP025268/4333424‑4333696 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |